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当所有人都在前进，怎有资格懒惰！ 生物信息学网页链接 一、序列比对 1. GenBank: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/ 2. BLAST: http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 3. 引物设计 Primer-BLAST： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/index.cgi?LINK_LOC=BlastHome 4. PSI-BLAST: http://www.ebi.ac.uk/Tools/sss/psiblast/ 5. bl 2seq: http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE=MegaBlast&PROGRAM=blastn&BLAST_PROGRAMS=megaBlast&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAULTS=on&BLAST_SPEC=blast2seq&QUERY=&SUBJECTS= 6. Clustal在线版：http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/ 二、核苷酸序列分析 7. CDS区的分析： 1） GeneMark: 原核：http://exon.gatech.edu/gmhmm2_prok.cgi 真核：http://exon.gatech.edu/eukhmm.cgi 2） Glimmer: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/MICROBES/glimmer_3.cgi 3） GeneBuilder：http://zeus2.itb.cnr.it/~webgene/genebuilder.html 8. 启动子分析： PromoterScan：http://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan/ 9. CpG分析： CpGPlot：http://www.ebi.ac.uk/Tools/emboss/cpgplot/ 10. polyA的个数分析： POLYAH： http://linux1.softberry.com/berry.phtml?topic=polyah&group=programs&subgroup=promoter 11：非编码区的二级结构分析： RNAFold: http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAfold.cgi 三、蛋白质序列分析 12.蛋白质的亚细胞定位：http://wolfpsort.org/ 13.糖链连接点： 1）O—连接：http://www.cbs.dtu.dk/services/NetCGlyc/ 2）N—连接：http://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/ 14.蛋白质的重复序列：http://www.embl.de/~andrade/papers/rep/search.html 15.蛋白质卷曲螺旋域：http://www.ch.embnet.org/software/COILS_form.html 16.信号肽及其剪切位点：http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/ 17.蛋白质的PZ、MW氨基酸的组成： 1）ProtParam：http://web.expasy.org/protparam/ 2）AACompIdent：http://web.expasy.org/aacompident/ 3）Compute pI/Mw：http://web.expasy.org/compute_pi/ 18．蛋白质疏水、亲水及跨膜区分析：http://web.expasy.org/protscale/ 19.蛋白质跨膜区域分析：http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/ 20.膜锚定位点：http://mendel.imp.ac.at/sat/gpi/gpi_server.html