利用primer5计算生物群落指数利用primer5计算生物群落指数
1.利用primer软件首先要将数据做成primer格式,我们主要在标准报表基础上利用excel透视表功能来实现,步骤如下:打开标准报表(以底栖动物为例),选择图1中蓝色部分。
选择excel插入、数据透视表、数据透视表。
2.出现透视表对话框,选新建工作表,确定。
3.将监测站位、生物种中文名、密度分别拖入列标签、行标签和数值栏中,单击数值栏里的密度,选值字段设置,选择求和,点确定。
4.将空白、总计等行列删除,空格替换为数字0,首行空一行,即完成数据的primer格式。(数据存为...
利用primer5计算生物群落指数
1.利用primer软件首先要将数据做成primer格式,我们主要在标准报
基础上利用excel透视表功能来实现,步骤如下:打开标准报表(以底栖动物为例),选择图1中蓝色部分。
选择excel插入、数据透视表、数据透视表。
2.出现透视表对话框,选新建工作表,确定。
3.将监测站位、生物种中文名、密度分别拖入列标签、行标签和数值栏中,单击数值栏里的密度,选值字段设置,选择求和,点确定。
4.将空白、总计等行列删除,空格替换为数字0,首行空一行,即完成数据的primer格式。(数据存为excel97-03版,高级版本不识别)。
5.打开primer5,选择打开。
6.选择保存好的primer excel表。
7.选择工作表序号。Ok.
8.点cancel.
9.点左上角方框,选中数据。
10.选择analyse/diverse.
11.在other中选择种类数S、数量N、丰富度指数D、均匀度指数J。
12.在Shannon多样性指数中选择以2为底,结果输出到工作表。OK。
13.群落结构的主要指数便可得到。
14.关于群落优势种的计算采用公式Y=(ni/N)*fi。ni为第i个种的总个体数,N为所有物种的总个体数,fi为第i物种出现的频率。计算结果中Y>0.02的为优势种。
目前对于群落结构的好坏没有统一标准,在描述其群落结构时尽量避免“差”、“较差”等字眼。可以参考“群落结构稳定”、“群落结构较为稳定”、、“群落结构基本稳定” 、“群落结构稳定性略低”、“群落结构稳定性较往年有所增加(降低)”等描述。
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