蛋白质二级结构周期检测及α-螺旋内疏水力分析

蛋白质二级结构周期检测及α-螺旋内疏水力分析 摘要 摘要 研构学确构究蛋白质的质质生命科有重要意质～因质明了蛋白质的质～有助于了解蛋白质的作用～了解蛋白质如何行使其生物功能～质质蛋白质蛋白与质;或其分子,之质的相互作用～质无质是质于生物质是质于生物和它学医学 生物质～都是非常重要的。,,,,,学 ,?::,,,,,,等人于,,,,年质了文章,, ,～ 质质八十多蛋白质系列的质本用字信质理的方法质质了,一螺旋的周期条数号 质,,,到,,!基酸之质～,一折的周期质,,,基酸。我质在究蛋白个氨叠个氨研 质二质质质质质质的质程中使用了以上质质。但是一些质稿人指出～着质构随 在质质得到的蛋白质量的增加～原先在小范质得到的质质是否正质需要数内确 ,,::,,,,,,质质～不可以直接使用。质此～本文的第一部分质格地遵照,,,,,等人于,,,,年所用的方法;傅立质质方法和最大特征质法,用最新的,,,数学叶 数研构据质中三质有代表性的蛋白质序列集合究了蛋白质的二质质,一螺旋和,一折的周期性～质质了,一螺旋的周期质,,,,,!～,一折的周期质,,,。叠—叠 并质此质果质行了质著性质质,质质。本文的第二部分的质点是,由于。一螺旋的周期质,,,到,,!之质～我质就分质质质。一螺旋相差基和相差三两个残个残两个氨基的基酸之质疏水质的作用质系～利用相质质质作质尺度～质质,一螺旋疏水力的作用非常质著。特质其中基酸,～,～,～,质质成。一螺旋的内氨 质最大～于是～,,基酸质予新的反映。一螺旋部疏水力的指质～在献将个氨内 此指质下～每基酸序列就成了一质序列～作八质移质平均所得的个氨个数将它 新列螺旋质质质质系强～,,数与构很 ,,,,相质系质,,!,,,。数 质质质,,一螺旋～,一折～傅立质质～最大特征质～质和性～疏水力叠叶 质,,,翌,,一 ,,,,,,,, ,, ,, ,,,,,,,,,, ,: ,,,,, ,,, ,,,,,,,,, :, ,,:,,,,, ,:, ,;,,,,,,, ,,, ,, :,,,,,,, ,疏,,:, ,,,, ,,:,,,,～,,,,,,, :,, ,:, ,,, ,,:,,,, ,, ,,,,,,, ,:, ,,,,,,, :,, , ,,:,,,,,, ,,,,,,:,,～,,, ,,,,,,, :,, ,,, ,,,,,, ,,、,,, ,,,,,,, ,,: 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日月年解密质质, 器密质的最质保密年限及质格写式质定如下, ……’一,”,”、。,,。………”“”,”…—一”…’”,……”一…”“” ,,内部,年;最质,年～可少于,年, 秘密?,,年;最质,,年～可少于,,年, 概密?,,年;最质,,年～可少于,,年, 南质大位质文原质性明学学声 本人质重明,所声学呈交的位质文～是本人在质质指质下～质行研内学究工作所取得的成果。除文中已质注明引用的容外～本位质文的究成果不研没包含任何他人质作的、已公质质表或者有公质质表的作品的容。质本质文所内研献个涉及的究工作做出质的其他人和集体确学声～均已在文中以明方式质明。本位质文原质性明的法律质任由本人承担。 学位质文作者质名,质 尸,?年上月吾,日 第一质引言 第一章引言 基因是生命的质质～蛋白质是生命的机器。来自于四质字符字母表;,～,;,,～:～,,的核酸序列中质藏着生命的信息～蛋白质质行着生物各质重体内要的工作～如生物化反质的学运催化、质质物质的质、生质和分化控制、生物信的质质和质质等。蛋白质序列由相质的号决核酸序列所定～通质质基因的质质和质～原的,翻将来翻氨,,序列～根据三质密质质质质成,,字符的蛋白质基酸序列;,,质基酸的名字质质氨附质的表;,,,,,。 研构构究蛋白质的质意质重大。分析蛋白质质、功能及其质系是蛋白质质质中的一重要质成部分。究蛋白质质～有助于了解蛋白质的作用～了划个研构 解蛋白质如何行使其生物功能～质,,,,,蛋白质蛋白质;或其分子,之质的相与它 互作用～质无质是质于生物质是质于和质～都是非常重要的。质于学医学学未知功能或者新质质的蛋白质分子～通质质分构析～可以质行功能注质～指质质质质行功能质的生物质质。确学构确通质分析蛋白质的质～质功能质位或者质构域～可以质质质操作提供目质～质质质新的蛋白质或改造已有蛋白质提供可靠靶构的依据～同质质新的质物分子质质提供合理的分子质。 生物信息学个构决的一基本质点是,分子的质定分子的性质和分子的功能。因此～生物大分子蛋白质的空质质定蛋白质的生物功能。但是～蛋白质构决学 的空质质构决呢当个构坏又是由什质定的,一蛋白质的空质质被破以后～或者蛋白质解折后～可以叠叠构恢质其自然的折质质。大量的质质质果质明,蛋白质的质由蛋白质序列所定。质构决响构另个然影蛋白质空质质的一因素是蛋白质分子所质的溶液质境～但是～定蛋白质质的信决构氨息质是被质质于基酸序列之中。然而～质质质质是否能被破质呢从氨,或者质是否能质直接基酸序列质质出蛋白质的空质质构呢, 蛋白质是具有特定构研将构个象的大分子～质究方便～蛋白质质分质四质构构构构构将构水平～包括一质质、二质质、三质质和四质质。一般二质质、三质质和构构称构四质质质高质质。 一质质指蛋白质多质质中基酸的构氨氨排列质序。质质是蛋白质中基酸之质的主要质接方式～由一基酸的,一基和一基酸的,一基之质即个氨氨另个氨氨脱 去一分子水相互质接。质质具有部分质的性质～所以双个个整质质位是一质性的平面质。在多质质的构离氨称氨另含有游基的一端质质质的基端或,端～而 第一章引言 一端含有一个离称游质基的一端质质质的质基端或:端。 蛋白质的二质质是指多质质构叠构骨架质质折所形成的有质律性的质。最基本的二质质质构构叠构型有,一螺旋质和,一折质质～此外质有,一质角和自由回质。右手。一螺旋质是在质质蛋白和构构球蛋白中质质的最常质的二质质～螺距质,,,,,,～螺旋中的每质质均质质的个参与叠形成以质持螺旋的质定。,一折质构构构也是一质常质的二质质～在此质中～多质质以质伸展的曲折形式存在～质质;或质段,的排列可以有平行和反平行质方两氨式。基酸之质的质心距质,,,,,,～相质质质之质借助质质彼此质成片质质。构 质构构构构域是介于二质质和三质质之质的一质质质次～是指蛋白质质基质中明质分质的质密构状构区球质质质域。超二质质是指蛋白质分子中的多质构 质在三质折中叠构体形成有质质的三质质聚集。 蛋白质的三质质是构个构它构整多质质的三质象～是在二质质的基质上～多质质质一步折叠状构构卷曲形成质质的球分子质。具有三质质的蛋白质一般都是球蛋白～质质蛋白质的多质质在三质空质中沿多方向质行质质折～个叠形成十分质密的近似球形的质～分子部的构内数几空质只能容质少水分子～乎所有的性极壳极,基都分布在分子外表面～形成质水的分子外～而非性的基质质被埋在分子部～不水接。蛋白质分子中质质内与触,基质的相互作用质质定球状构蛋白质的三质质起着重要作用。 蛋白质的四质质指构数条独构具有立的三质质的多质质通质非共价质相互质接而成的聚合质。在体构构条构具有四质质的蛋白质中～每一具有三质质质的质质质质基或质质位～称个独缺少一质基或质基质存在都不具有活性。四质质构个涉及质基在整分子中的空质排布以及质基之质的相互质系。 质持蛋白质空质质的作用力构离主要是质质、子质、疏水作用力和范德质力等非共价质～又次称质质。此外～在某些蛋白质中质有二硫质～二硫质在质持蛋白质构构决它构象方面也起着重要作用。蛋白质的空质质取于的一质质～多质离氨构即确岸主质上的基酸排列质序包含了形成质质的三质质;正的空质质,所需要的全部信构息。 近年有各质不同的生物来研构咨质究方向～而蛋白质二质质质质质是其中一质已质质展一段质质的质～由于蛋白质的功能其质学与构息息相质～因此如果能质知道蛋白质的质～构便有助于人质更质一步去了解蛋白质的功能。质然在,,世质初已有人以,光质射质晶技质去质法得到蛋白质得质～但是其构耗质 第一章引言 耗力～尽确来学构管也质准度比质高～相质的质～以质算机得方式去得到质～或质有没确将会当构那质精～但那是相质省质质且有效率的～因此蛋白质质质质在目前质来构学仍有其价质。用于蛋白质二质质质质的方法～有早期的质质 ,,,,:,方法～以及常质的神质质～质有基因网与演算法支援向量机;,,,,:,, ,,,,,,,,都有被用质做二质质质质～但是直到质在有所质能质完构并没美质质蛋白质二质质的方法～不质最构并从近的方法通常都是利用各质方法的质合中质比质好的质质质果作最后的来当构会答案～不管如何～蛋白质质质质仍是生物咨质上学研个待人去究的一质域,,,,,,。 从划人质基因定序质;,,,,,,,:,,,,,的质始～质质质质就质生,,,:,, 了大量的基因序列～从构叠而出质了相质的二质质的质质～,一螺旋和,一折的质在,,构确,,年第一次被,,,,,,,等正的质质出,,,,,,～在,,,,,,,的质质被 ,一衍射质质以前的,,,!年～,,,,,—,,:,,,,和::,,,提出了根据原始序列质来 质二质质的构概很构念,,,。今天～存在多质质质蛋白质二质质的方法～质在最主要的任质就是提高质质质质的准率确划构。根据,:,,的分～二质质的质质可以分质三代, 第一代方法是在,,,,年到,,!,年质提出的～质些方法只是用了原运始序列的基酸的信氨构确息,!,,,,～质些质质蛋白质二质质的方法的平均准率最好只能到,,达,。 第二代方法在九十年代到了的达它运窗概高峰～用质算机口的念～把要质质二质质的基酸前后的,构氨 ,,基酸的信个氨运息也考质质去了～质用了例如质叶决氨学它极斯理质和策理质等质质方法,,,,,,,,,,～基酸的化性质和的性～非性～极构配质质的质等因素也都被考质了质去,,,,,,,,,,,,。第二代质质蛋白质二质质的方法的构精度小于,,,。 第三代方法是在九十年代的末期质展起来数的～质包括了质大量据的质理方法～第三代方法的根据是质定的一蛋白质序列中特定位条氨置基酸的二质质构条体决是由质序列的整性质定的～而不是由第二代方法中所质的固定质度的窗即它氨决口;质近的局部的基酸,定的～也正是由于质点～第三代方法就把整体氨断的信息引入到了局部的基酸片中。根据,,,,,,,:,在,,!,年提出的质化理质,,,,,,,,～第三代方法用了同运概源蛋白质质的念～把被质质的蛋白质跟构数它来已质知道二质质的据质中的的同源家族质行比质质质被质质蛋白质的二质质。构 第一章引言 更质质的质于蛋白质二质质质质的质构找史可以在,,,,中到～质之～质然在蛋白质的二质质质质方构确断面已质取得了重大的质展～质质的准度也在不 的提高～蛋白质二质质的质质构个研仍然是一质质的工作～质需要质一步的究。 ,:,,,,,在多的究蛋白质二质质的方法中～信质理中的,,,;,,众研构号 ,, ,,,,,,:,,,和质质方法被很来研构构多人用究蛋白质二质质和三质质的相质质 ,,:,,质～并两来研取得了一定的成质。在,,!,中～质质方法被用究,,,,;,,,,,,:,,,,,,～,,,是所有质胞中部含有的蛋白质质～一质当个胞被质如质～冷～或者缺氧响会况帮坏等因素影质就质生,,,,～在正常情下～,,,,助新的或被质的蛋白质形成质蛋白质质行其功能所个构帮必需的质。同质～,,,,质助免疫系质质质患病的质胞～二十年前～,,,,被确定是质物中的抗癌因素～,,,免疫质法被质质是治质癌症的最有效的方法～在,,,,中～,,,,,,,,,等人用,,,方法确定了蛋白质序列质向与极达构并形成使其性到最大的二质周期质。提出了用疏 水质究蛋白质得原来研并个始序列的周期性～指出质用质疏水质表示的原始序列的周期性是蛋白质二质质构个来形成的一因素。在,,,,中～,,,被用做系列的比质～质并来构示出了其的质越性。在,,,,中～,,,被用比质蛋白质的三质质～并它构指出了相质于以前质质的用于比质蛋白质三质质的,,,;,::,,,,,,,,,,,,,的质越性。本文所用的方法数学也是,,,和质质的方法。可质,,,在究蛋白质的质方研构很广面有着泛的质用～质得质一步探质。 第二章质质知质 第二章质质知质 本质介质了要理解,,,,, ,?::,,,,,,等人的文章,,,中的方法所数学必质的基质的数学知质～,,,,, ,?::,,,,,,等人的文章,,,所用的方法～以及我数学质文章的第二部分所用到的数学知质。 第一质质质数学知质 ,,,,,中心限极定理 ;,,质己;”,,～,～…,质互相立的机质量序列～有有独随数学限的期望和方差 ;,,,～,～…,,;磊,,口。～,;,彘,质～ 亡益二生,,,?,,。,;质,～台,。 若质于,?兄一致地有 ,咖… ,』!,? 质机序列称随从极‰,服中心限定理。 ;,,质己;,,,～,～…,质相互立同分独随布的机序列～且 ,;,彘,, ,;?,,质,,,。。;,仃?,, ,;七,,～,～ 质,喜。,服中从极心限定理。 ,,,,,特征质和特征向量 墼质。叫,质一, 第二章质质知质 质是爿数个数数厶域尸上质形空质质的一质型质质～如果质于域,中一～存在一非个零向量善～使得 爿善,九, 那质九称爿质的一特征质～个称爿属厶个而,质的于特征质的一质特征向量。 ,,,,,,二次型和半正定矩质 ;,,二次型的定质。 质,是一数个数数域～一系在域尸中的一～,,…,。的二次多质式 ,，, 口, ,,, 口, 口,口,,，,,，，, ,，， 口 弛, ,, ，,～,,,,,,,, —，厂一 ,一日“《肌 称数个称质域,,上的一”元二次型～或者～在不致引起混淆质质质二次型。 ;,,质;,,～,,～厂个数…～,。,是一质二次型～质于任意一质不全质零的质,。～,,～…～,,～如果都有;厂厂称,～,,～…～,。,?,～那质;一～,,～…～,。,质半正定的。如果二次型爿称。质半正定～那质质矩质,成质半正定的。而且非退化质质性质质保持矩质的正定性不质。 ;,,在数个称域,,上～质于任意一质爿找个矩质都可以到一质可逆矩质:使得,’,成质爿角矩质 ,,,,,相质质的定质和性质 定质质,;,,～,;,,是,上的两个概它率分布～那质质的相质质定质质 质,,,萎质。,质 』,, ,、～— 第二章质质知质 在上式的定质中～取:,。,质,:～另个外～如又一,?,～使,:,,:～而,;,,,:, 那质取白;,,,,,,,。 从号条上式可以看出质有,;,,,,,?,成立～且等成立的充分必要件是,;,,,,;,,质任何的,;,,?:的,成立～因此把看它两个概异成是率分布“差性的度量特征。 第二质,,,,, ,,::,,,,,等人的文章【,】中所用的方法数学 蛋白质的二质质。一螺旋和,一折是周期性的～构叠构而蛋白质的二质质是由其原始序列定的～所以二质质的质周期性可以决构个通质其原始序列表质出～我质可以来来通质质原始序列质予疏水质表示其周期性,,,,。不同的疏水质影质周期的表～但不质会响个达并会改质周期本身。本文用到的都是,,,,,,,,,疏水质～我质比质了质质的离叶与散傅立质质的方法和一质新的所用疏水质无 质的最大特征质的方法。质质在基本上得到的质果是一质的。本文在介质了最大特征质方法后质质出了理想的最质的表质一周期的疏水质。达 ,,,,,傅立质质的质质法叶 质定一段,,,中质度质,的二质质构断个已知的蛋白质的片～依次质质序列上的每基酸基质予疏水质;本文所用的是,,个氨残 ,,,,,,,疏水质,质质,‰～,?一～,。,眠,,～定质 爿国国;珊,,?,。鼠,。,;女,～,;,,?,是。,,,;是珊, ,;,,,;国爿区甜?,】,“,;?,,,,,，。。女?,，陛质,。,, 那质质序列的傅立质质的质质,,如,就可以用质个叶来个断示质序列片的周期性质化。 第二章质质知质 可以使得尸,,最大的质质也就是眠,芝。的主质率～从它而,衫。也就是的主周期。质质的解质参看,,,。 ,,,,,最大特征质法 从个个;,,,,,,可以看出～质一质定的山～尸?,是一用,,不同的疏水质表的非质的二达个个次型～如果把二十疏水质看作质量的质～,;?,是一非质的二次方程式～非质的二次方程式的代方法就提供了数很来研个好的方法究一二 质片断序列集合的周期性。 假质二十质基酸序列是按一定的质序氨??个排列好的,。～“,～,。。～用一,,×,列向量”来个氨个断表示相同质序排列质,,基酸的疏水质～如果一蛋白质片质～ 有基残个断氨,‰～蜀～…是。,～那质质片的基酸的疏水质序列慨,,就可以由以下质质定,决当构个“,～!～月。,。～～我质可以建一,×,,的“质质”矩质, ,。,,?,～其中,?,,当凡。,,～～,?,:当,。?口～。那质疏水质序列,‰,, 就可以表示成一,,,的列向量个,,,。～!。我质再质,和,分质表示～,,,的列向量,,:,女?如,,,,女?,～其中女,:～,～…～～一,～那质一蛋白质个断片质的,;?,就可以 写质, ‘ 匕;。,,睦,。 ,,,阮,。,,?,,?甜,，睦,, ,,,,,，,?,, ,,!,～叩,,，,!,。～!,, ,,!占～,,!,。～!,，;叩!,,,始’,。,冲 ,!!!江;,～，?质。扣 町。,～,;珊,,。!! 其中,?,,,,’，船!～～?,的第,～,分量是个 第二章质质知质 ,:,??,:,,～?，,,,女珊,,,～?,,:,忙一,,～因质,:,忙一,～,,,:,,一女,～所以 ,?瑚,,,如,,。是质的。称又因质,,如,是非质的二次型形式～所以,,～质,,。是半正定矩质～也就是有非质的质特征质。 更质一步～任何的蛋白质的二质序列,一螺旋或,一折的叠聚合,～,中的所有片断的质质和,?,可以表示成 ,;?,,?只;?,,?!!!,,～;?,,。叩 ,叩～』?,,,;,,。甜,叩,耐 , !眠?,,～! 其中眠?,,?,～,,皿。～根据,,,,是非质的二次型～可得,?,也是非质二次型～所以,如,也是半正定矩质～有非质的质特征质。矩质,,,是集合,的一重要的疏水质无质的特征。质个与任何质准化的疏水质～!～,如,的最大特征质质,,是!! !,如,可能的最大质。 更质一步～假如?固定质一质～不妨质,,,。～如果质善是,;,,,。,的属个个于最大特征质五的特征向量～那质质最大特征质丑和质特征向量?就使得 ,;,,,。,到了最大～所以质质二质质的最达构佳的疏水质序列就是,;质只是理质上成立,。 ,,,,,,一质质 一质质质质期个体数学望,的质质。 ,,,,?,:,:,,,,:～ 假质质,服正质体从仃?,～,～其中方差。未知质～,,,～,～?“是质的体 第二章质质知质 予序列～质有, 质质?服从自由度质,一,的,一分布。其喀去缸,氍忑, 第三质本文所用到的据质数型 ,,,,, ,,::,,,,,,等人于,,,,年得到的蛋白质的二质质,一螺旋的构 周 期质,,,,,!和,一折的周期质,,,的质果由于所用的蛋白质序列不—叠足质多而使得大家质质一质果都持质疑质度～我质把同质的方法用到了,,,数学运从数 据质中提取出具有代表性的的蛋白质序列的三质据质数型的中的,一螺旋和,一折的叠片段中。 本文所用到的据都是,,,据质中提数从数来取出的。共用到了以下六质,一螺旋和,一折据质叠数型, 数条据质型,,,,,,,中全部的蛋白质序列中;共,!,,,蛋白质序列,质度大于,的,一螺旋的片断条断;共,,,,,,片,。 数条据质型,,,,,～,,中同源相似率小于,,,的蛋白质序列中;共,,,,蛋白质序列,质度大于,的。一螺旋的片断条断;共,,!!,片,。 数条据质型,,,,,,,中同源相似率小于,,,的蛋白质序列中;共,,,,蛋白质序列,质度大于,的,一螺旋的片断条断;共,,,,,片,。 数条据质型,,,,,,,中同源相似率全部的蛋白质序列中;共,!,,,蛋白质序列,质度大于,的,折的叠断条断片;共,,,叭,片,。 数条据质型,,,,,,,中同源相似率小于,,,的蛋白质序列中;共,,,,蛋白质序列,质度大于,的,一折的叠断条断片;共,,,,,片,。 数条据质型,,,,,,,中同源相似率小于,,,的蛋白质序列中;共,,,,蛋白质序列,质度大于,的,一折的叠断条断片;共,,,,,片,。 第三章质果一,质格重质,,,,, ,,:,,,,等人的工作 第三章质果一,质格重质,,,,, ,,::,,,“,等人的 工作 第一质,一螺旋的质果 ,,用第一质方法傅立质质方法得到的质果。即叶 数据聚合数据质型,,,数据质型,,,数据质型,,,,最大质,的,,,,。,,。,,,。质 ,一螺旋的相,,,,,,,,,,,,质周期 质质质形质形;,,,,质形;,,,,质形;,,,,,,用第二质方法最大特征质法得到的质果。即 数据质型,,,数据质型,,,数据质型,,,数据聚合 五?,最大质::,,,,,,,,,,。,的质 ,一螺旋的相,,,,,,,,,,,,质周期 质质质形质形;,,,,质形;,,,,质形;,,,, 从数质果中我质可以看出～无质是用那质据质质是那质方法得到的,一螺旋 的周期都质,,,,,!。质质果可以—个来通质质形更好的表质出。 笙三皇笙墨二,,质堡重望,,竺,,生壁翌竺旦笠?堕笪—————三一 质形;, ,,幽形;, ,,山数叶据质型【,】用傅立质质方法得到的质率,和山撒数叶质型【,】用傅立质质方法得到的质率,和 尸;?,的质质质,;,的质质质甜 ,,?, , 质形;, ,,质形;, ,,山数据质型【,】用最大特征质方法得到的质率,和由据质数叶型【,】用傅立质质方法得到的质率,和 五,,的质质质尸,,的质质,质, 质形;, ,,质形;, ,,由据质数型【,,用最大特征质方法得到的质率,和由据质数型【,】用最大特征质方法得到的质率,和 ,?,的质质质,?,的质质质 ,, 第三章质果一,质格重质,,,,, ,,:,,,,等人的工作 第二质,一折的质果叠 ,,用第一利～方法傅立质质方法得到的质果。即叶 数据质型,,,数据聚合数据质型,,,数据质型,,, ,最大质,的,!,。,!,。,!,,,。质 ,,折的相叠,,,,,,,,,质周期 质质质形质形;,,!,质形;,,,,质形;,,,,,,用第二利～方法最大特征质法得到的质果。即 数据聚合数据质型,,,数据质型,,,数据质型,,,五?,最大质::,!,,!,,!,,,。,的质 ,一折的相叠,,,,,,,,,质周期 质形;,,,,,质质质形质形;,,,,,质形;,,,,, 从叶数叠质果～我质可以看出～无质用那质据质质是那质方法得到的,一折的周期都质,,,。质一质果可以通质质形更明质的表质出。来 质形;, ,,质形;,,!, 由数叶捌质型,,】用傅立质质方法得到的质率,和山数叶据质型,,】用博立质质方法得到的质率,和 ,,,的质质质,?,的质质幽 质三至墨堕二,,质堡里星,,竺,,,,竺,竺,竺竺?塑三堡 质形;, ,,,质形;,,,, 山数据质型【,】用最大特征质方法得到的质率,和山数叶据质型【,】用傅立质质方法得到的质宰,和 兄?,的质质幽,如,的质质质 质形;, ,,,质形;, ,,, 山数据质型【,】用最大特征质方法得到的质率,和由据质数型【,】用最大特征质方法得到的质率,和 五?,的质质圈五,,的质质质 第三质质质果质行质著性质质,一质质 本质我质质通质六质据集合得到的数个数六质质果分质抽质一百据子集质行了,一质质～得到了如下的质果, 用,一螺旋的三质据质数两型通质质方法得到的质果都符合,,,,,,的,质质。用,一折得三质据质叠数两型通质质方法得到的质果质著性都不是特质质著。 从构怎我质的质果可以看出～在蛋白质的二质质,一螺旋中～无质,,,,,质的蛋 ,,,～“一,『【,,,,【,,,【,,, ,,【 第三章质果一,质格重质,,,,, ,,,:,,,,,等人的工作白质据质～,一螺旋的周期都质,,,到,,!之质～,一折的周期质,,,。数叠且前一质果的质著性明质～后一质果的质著性不是特质明质～所以本质文的第四章接着究,一螺旋的性质。研 第四章质于疏水力度的信息学 第四章,一螺旋疏水力度的分内析 第一质得到,,基酸的质系个氨献数 用据质数数个型,,,和据质型,,,加上,,,中所有的系列～我质可以得到,,氨数基酸在质三质据质中的质率 ,,,,,,,,,所有,,,,,中,,,,,,所有中中由 ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,:,,,,,,,!,,,,,,,,,!!,,,!,,,!,,,,,,,!,!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,!,,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,!,,,,,,,,,,,,,,, 表;,,, 从个质质质果我质可以得出在,一螺旋中～,～,～,～,的质率要明质高于他质分质在整个叠蛋白质系列和,一折中的质率。在,一螺旋中～,占了,,,,,,～,占了,,,,,,～,占了,,,!,～,占了,,,,,～质质质的和就占了,,,它几个,,,。质了使质一根据更具有可性～我质靠另来个通质一质方法质质质质质质。 利用的方法～我质数学氨构也可以质质基酸的疏水力在蛋白质二质质,一螺旋的形成中也有大的质。我质用相质质,;,很献 ,, ,,究,和,之质的质系。来研 其中～～是由疏水力形成的。一螺旋中隔一螺旋相质质的基酸质生的质个两个氨 率。口是由于基酸之质的力两个氨两个氨形成的基酸相质质生的质率。通质质算我质质质～质质疏水力在,一螺旋部是明质的。内很 我质用;～,爿来爿爿即,～,表示蛋白质～和～在,,,,,中相质质～蛋白质,。质质一周期;质质一螺旋,后和,相质质。由于本文的第三章个个爿已质得出。一螺旋 第四章质于疏水力度的信息学 的周期在,,,,,!之质～我质分质质—两个个氨残氨算隔和隔三基酸基的基酸的 性质。我质先质隔两个氨两个氨爿基酸的基酸质行质算～,;～,月～,,翌,等,立表 示;～,～,在,一螺旋中出质的爿爿概数率～其中,是据质型,,,中所有蛋白质配质的质～个数爿爿爿爿个数爿爿爿爿?;～,～,是蛋白质～和～配的质～质然,;～,,,,,;～,～,。附质中的表;,,,,的第二列就列出了,,,质基酸氨概配质的率。 如果我质引入相质质质质来爿随,。和～配质是否具有质向性～我质需要用机 情况参爿爿爿爿爿概下的分布作质照系～于是取,;一～～～,,,;～,,;～,质～和～相质的率。 ,,,,,～～爿称爿爿被作～,～的质和性。我质质令,,,,～～爿号?,暑去孚～。,,,,,,;～,～,的质质出如下的三质爿爿况情的解质 ;,,,:, ,,;～,～,爿爿爿概爿爿独概,,～意味着～,～质生的率要比～～～立出质的率要大。 ;,,,:,,;～,～,爿爿 ,～意,味着～,～的质生是机的。爿爿随, ;,,,:, ,,;,,～,爿爿爿爿概爿爿随概,,～意味着～,～质生的率要比～～～机质生的 率要小。 在附质中的表;,,,,的第三列中列出了,,,质基酸氨配质的质和力。通质 质质质算～质和力的期数学望,;,,, ,’,的质质 。;,;～,～,,,爿爿 质就质明质些配质不是机的。随 ,;,;～,～,,,,质,竺,爿爿喜善～:,～,～,,;～,～,,。,～,,,,,,爿爿爿爿揣??三,,,, , ; , , , ～ , , ,,,, 第四章质于疏水力『叟学的信息 三;,,爿爿竺质,,;～, ,,。,～二,生坐～我质令令以爿,,三质～,云有,尸;旁,叫?罱’我质有,, ,, ?,;～,爿爿,,;,;～, ,,～我质,称爿爿,川;～,是蛋白质～的质和性。, 我质用质质量,,之质生质竺上来爿献数描述蛋白质～质,,,,,的质系 ?,’;～,,;～,爿爿 其中,’;～,是蛋白质～在,,,,,中出质的的爿爿概率,,,,。我质在表;,,,,的第二列中列出了,,基酸的质系。个氨献数 同理～我质用;～,,,表爿爿个氨残氨示相隔三基酸基的基酸重质上质的步质得到了表;,,,,的第二列的质果。表;从,,,,的第二列和第三列可以看出质两个没异从质果有太大的差。表;,,,,的第二列和第三列我质也可以看到～无质是隔两个个氨质是隔三～基酸,～,。～,～,质,,?,的质都是最大～在第二献 列中～质四个氨个氨基酸占了,,,,。在第三列中～质四基酸占了,!,,。又因质,一螺旋的周期质,,,,,!～—个氨并没个氨也就是质一固定的基酸～有一固定的基酸相质质～与它与它两个个残氨它而是～相隔和相隔三基的基酸质共同作用了疏水力～所以我质得到了表;,,,,的第四列,把质系大于献数氨,的基酸的的质系相加得到此基酸的新的质系。质系小于两个献数氨献数献数氨,的质基酸的质系不质～献数献数例如,的新质系,,,,,, ,,,,,,!,,,，,,,,,,,。,的新质 献数系仍质,,,,,,。 ～,氨基,;隔三,个酸;隔两个, ,,,,,,,,,,,!,,,,,,,,, ,,,,!,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,!,!,,,,!,,,,,!,,,,,,,!,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,!,,,,,,,,,!,,, ,,,,!, 第四章质于疏水力度的信息学 工,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,!,,,,,,!,,,,,!,,,,,,!,, ,,!,,,,,,!,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,,,, ,,,,,!,,,,!,,,,,, ,,,,,,,!,,,,,,!,,,,,,,,,,,!,,:,,,,!,,,,,,!,,,,,!,, ,,表;, 第二质质质的质一步分析 根据表;,,,,～质定了一列以后～当比如我质质定了第二列～我质就可以把每蛋白质序列质化成一字序列。质定一个个数个断片～我质定质他的疏水力度质质个断断个断片疏水力的平均质。例如,质定片,,,,,,～质片的疏水力度就是, ;,,!,,,，,,!,,,，,,,!,,,，,,,,,,!，,,!,,,，,,,!,,,,,,,,,! 质之～任意质定的,,,～和任意的蛋白质序列质卣靠当…～质点。,。,…缶质第,“片断个氨～那质第,基酸的疏水力度就可以表示质,,??,;善。,～其中～,,,,, ,～,，,～…～?。,。,质质到,,～可以得到十字序列当从个数“。;,,～…～“?;,,～我质就可以质算当从数异,,质质到,,质由不同的据质得到的质,,质质度各的片断构数的疏水力度和二质质的,,,,,,相质系,,,,～质我质质算～无质质定表;,,,,的第列～,,质到,质～,,,,,,相质系着,的增加几当从数随而增 第四章质于疏水力度的信息学 加～,大于,质～疏水力度和,, ,,,,相质系就不质质化了～数怎当也就是,,,质的疏水力度就能反映二质质的信构当息。在表;,,,,我质列出了,由,质到,,质～质定表;,,,,的第四列作疏水力度指质质得到疏水力度和二质质的构,,,,,,相质系。数 ,,,,,,!,,,,数据质,, ,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,!;,,,,,, ,,,,,,,, ,,,,, ,,,,, !,,,, !,,!, ,,,,, ,,,,, ,,,,, ,,!!, ,,!,,,,,,,, ;,,,,, ,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,, ,,,!, ,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,, ,,!,, ,,!,, ;,,,,, 表;,,,, 当氨氨,山,质到,质～质基酸质予我质表;,,,,第四列得到的疏水力度质～基酸序列的 ,质移质平均二质质的,,,,,,系。与构数 在质质程中～我质质质质表;画当,,,,的第二列和第三列的质候～质形质果不是明质～很很而用第四列的质候～质果就明质～在质形;,,,,中～我质质取了蛋白质系列的几个断片的质形。 弱 加 佰 伯 , :,,,,,,,,,,,,,,,!, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, :::,,,,,,髓:::,,,,,,:::::,,,,,,,,,::,,,:::::::,,,雎,,,::,,,,质质, ,,,,:: 第四章质于疏水力度的信息学 ,, ,, , ,,!,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,:,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,:,,,,,,, ,::::::::::,,,,,,,,:::::,,,,旺,,::::,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,, ,,,::::: ,,一一一一一。—,, ,, ,, , , ,,卜质岫,!,,,,,,,,,,,,,,, ,:,,,,,,,,,,,,:,,,,,,,,,,,,,,,:,,,,,,,,,,,,,,,,,,:,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, :::::::: ,,,,,,,,, ,,,,,,,,, ,,,:::,,,,,,,,,,,,,:::,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,:::::,,,,,,,,,,,, 质形;,,,, 其中横氨坐质表示的是蛋白质的原始序列～质坐质表示的是基酸的疏水力度 从它质形;,,,,我质可以看出,,,,,部分质质的质形要明质高出其的部分。 当条一蛋白质序列质质,,,,,质质一质果就更明质。所以表;,,,,中的第四列 可以很很好的反映,,,,,的性质～可以好的质质,,,,,。 , 参献考文 参献考文 , ,:,,,,～,,,, ,,,,,,,～,,,,, ,,,,,,,,～,:,, ,,,,:,,,～,,, ,,【,,,,,,, ,,,,,,,:,,,, :,,,,,, ,,,,,,;,,,,,,, ,,, ::,,,,,,,:,,, ,,,,,,,,,, ,:, ,,!,,,,,,叩,:,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,, , ,,:,,,,,,,,,,,,,:,;,,,!,,,,～,,,,,,,,,,,,,,,,,, 【,,质质等,;,,,,,,蛋白质的质质质分子质质,来构与学北京大质出版社 ,,】王槐春,;,,,,,,蛋白质与医核酸序列分析基质,人民质出版社 ,,,,,:,～,,;, ,, ,,,,,, ,,,,,,,,, :, ,,,,,,,,,、,【,,,,,,,,,～,,～::,,弘 ,～,,,,,: :,,,,～,,,。,,,增,咖 :～～加,,,,,,,,,:,,,, ,,,,,,, ,:,,,,,,,,:,, :, ,:, ,,,,,,,, ,,,,,,日,,口如～可掣—,,,，,,～,!～,,,,,,,,,～,,,,,,】,,,,,,,～, ,,, ,:,,,～, ,;,,,,,,,:,,,,,,,,:,, :,,:,,,,,,,,, ,,,,,, ,, ,, ,,,:,,, ,,,,,,,,,:,, ,,:,,, ,:,,,,,’,: ,,, ,,,,,,, ?,,。，口,,口幽掣厂?,,,,,,,～,!～,,,!,,!,,～,,,, :, ,,:,,,,,, ,:,,,,,,,,, :,,,;, ,,!,,,:,,,,】,,,,,,,,:, ,斟～,,,,～, ,:,,, ,～:, ,,～, ,,!,,:,,,,,～,把，,,::,,,,,,,,:, : , :, ,,, ,,,:,,,,, ,,,,,,,,, :, ,,:,!,,,:,～,, ,,,,,,～～,,,,,,,;,,!,,,,,,,,,,,:, ,,,,, ,,:,,,,,,,,,,,,,,,,,～,,爿?口，,,,加助互,州:,:,”,!～,,,,,,,,～,,!, ,:,,,,,,,,～,,,,,,,,,,,:,,:,～,;, ,!,,,,,,,,,,, :, ,,【,】,,,,,,, ,～,,,,,,:,,,～, ,, ,:, ,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,:,, :, ,,,,,, ,,,,,,:,,,,, ,,,,,,,,, :, ,, ,,:,,,,,,,, ,!,— ,,～, ,!,,,:,,,,,～如 ,“,,,?,质,,, ,,,,～,,?,～,如～,,,,～口, ,,:,,,,:,【,,,,,,,,～,,,～ ,,～,,,,,,,,,, ,:,,:,～,,;,,,!,,,,,,,,, ,,,,,:,,,,, , ,,,,,,,,,,,,,:,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,:,,,,,,,,:,,,,,:, ,,,:,,,,,, ,,,,:,,,,,,,,,:, :,,,,,,,如畹“,口,可,如,,,“枷,,。～,?～,,,,,～,,,,,,,,,,～,,,! ,,, :, ,,:,,,,,,,,～,,,～, ,～,,,～,,,,,,,～,,, ,】,,,,,,,,,,;,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,, :, ,,,:,,,,,,,,,,,,,,～砌厂“,，口～。:,,～印“,口,,:,口～口曲～,?～!,,,,～,,,,,,,,,,～,,,, ,:,,～,【 ,,】,,,,,、,～, ,,～,,,,,～,,～,:,,,～,,,～,,,,,,;,,,,,,,,,,,,, ,:,,:,,,,,,,,,:,,, ,,,,,,,,,, ,,,, ,,,,,:,,, ,, ,,, ,,,,,,,,,,,～尸,,,加,～,,,,～,,,,,,—,,,～,,,, ,,,,,,,,,, ,】,,:,,,～,,～ ,,,,,～,,,,～,,,,,:,,,,,～,～,,, ,;,,, ,,,, ,:,, ,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,:,,,,,,,,,,,,,,～,,,,,,,,,,,,,,,,“:,,,,,,,,,,～～切～,船～ ,,,,,“,,～,,,, ,,,,,,,,,:,, ,,,,,,,,,,, ,,,,:,,,～,,～,,,,,,,,～,,～,,,,;,,,,,,,,:,,,,, ,,,,,,,,,— , ,,:,,,,,,, ,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,, ,,,,, ,,,,,～尸～:把,,,～,,,,～,,,,,,—, ,,～,,,, ,,,】,,,,,,,:,～,,,～,,,,:,,,,～ ,,,,,,,～,,～,,,,,,,;,,!,,,,,, ,,,:,,,,, ,:,, ,,, ,,, , ,,,,,,,,,:,,,:,,,,:,:,,:,,,,,:,,,,,,,, ::～,,,,,,,,,,:,,,,～,,,,,,,～ , ,,,,!,,,,,～,,!, :, ,,,:,,,,, ,,,,,,,,,～,,, ,,,:,,～,,～,,, ,,,,,,～:;,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,:, ,,,,,,,,:, ,, ,,,,,,～,,,,,,,螂可,拓,,,,, 参献考质 ,,,,,～,,,,,,,～,～;,,,～,,:把 ,,,,,,,,～,,,,,,,跏“,～“旭,,陀,,,,,,,,,和,,:出口”,:,,,,:,～,,,～,, ! ,,,,～,,,, ,,,】,,,,,,,,,～ ,,;,,,!,,,:～,,,～,～,:月?～,爿佗??”口如括,～,,,加,,?,,,,口,,,一“,,旭～,,, ,,,,,,～,,,,,,,,,, :, ,,:,,,,,,,,, ,,, ,:,,,,,,, ,,:,:,,～,,,,,,,,,, : ,:,,:,～:,,,,, ,,,,,,,,, ,, ,,,,,, ,,,,,,,～,,,,,,,, ,,,,,,,,, ,,!～,,,, ,,,:, ,,,,,, ,,:,,,,,,, ,, ::,,,,,,,:::,,,～,;,,,,,,,,,,,,,,,:,,, !,,,,:,:,,～,,,, ,,,,,,,, :, ,,,, ,,,,,,,,,:,,～,,:,,,,,,, ,,,,,,, ,,,, , , !,,,,～,,,,,?,,～,,,质,, ,,,,,,,,, ,】,,,,,,,,,～,,～,,,,,～,,,,～,,,,,,,,,,,,,,～,,,,;,,, ,,,,:,,:,,,,:,,,,,,,,,,,,,,:,,, ,,, ,,:,,,,,,,,,,,,:,,,,,,～,,,:,,切～～爿??,髓,己质～,,;,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,, ,:,,,,,,,:, :,,:,,,【,,】,,,,,,,,,,,～,～,,,～,,～,,, ,,:,,,～,,,,;,,,,,,,,,,:,‘ ,,,,,,, ,,,,, ,,:,, ,,,, ,,, ,,,, ,,,,,,,:,,～』:“朋?～?,:～,,“～口～,:，日,口,:,,?～:,,,,, ,:, ,～,:,,～,,,,,,, ,,,,,,,:, :,::,,:,,,,,,,,,,,～,,;,,,,,,,,,,【,,】:,,,～,?,～,,,,,,,:,,,,～,～,,,,,～,, ,,:,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,:,,,,,～～可,,!印“,,,:,日～,,。～,弘,,,,,～皋,:,,～,, ,, :,,,, ,,,,,,,,,,,～,,, ,,,～,,,, ,,,,,,,,,,,,, ,,, ,,,,,,;,,:,, ,,,,【,,】,,,,:,,, ,,,,, ,,, ,,,:,,,,,,,,,,,,,;待质表,, 附质 附质 ,,,,,,,,～,,,,,,,,,,,,,:,,,,,,,, ,,,,,,:,,,天质天质半胱谷氨甘氨质氨丙氨精氨异亮谷氨 冬质酸酸冬氨氨酸酸质胺酸酸氨酸 酸胺 ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,～?,质氨亮氮甲硫脯氨质氨色氨质氨苯丙酪氨质氨 酸酸氨酸酸酸酸氨酸酸酸酸 ,,质基酸的全名质质的质质表氨与称 ,;～,～,爿爿,;～,～,爿爿所有配质所有配质,:, ,,,,,,;～,～,爿爿,;～,～,爿爿,,, ,,,, ,!,, ,,,,!,,,,,!,,!,, ,,,,,,!,,,,,,,,, ,!,!,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,!,!,! ,,,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,!,,!!, ,,,:,,!,,,,,,,, ,,,, ,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,, ,,,,,!,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,!,,,,,,, !,,,,,,,,,,,, ,,, ,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,, ,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,, ,,, ,,,,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,!,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,, ,,, !,,,,,,,,,!,,, ,,,,,,,,,, ,,,,,,,,!,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,】～,,,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,～,,, ,,, ,!,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,, ,,,,,,,,,,!, 附质 ,,,,,,,, ,,,!!,,,,,,质,,,,,,!, ,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,,,, ,,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,:, ,,,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,,, ,,,,,, ,,,,,,, ,,,,,,,,, ,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,, ,,,,,,, ,,, ,,,!,, ,, ,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,,,,,, ,,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,!,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,!,,,,!,,,,,,, ,,,,!,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,, ,,,,,,,,,, ,,!, , ,,,,,,,,,,! , ,,,,,, ,,,,!,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,丁,,,,,, ,,,,,! , ,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,!,,,,,,, ,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,!,,, ,,!,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,!, ,,,,,,,,,,, ,,,,, ,,, ,,,, ,!,,,,,,,,,, ,,,:,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,, , ,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,, ,,,, ,,,,!,,,, ,,!,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,! ,,,,,,,,,!,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,,!, ,,, ,,, !,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,!,,,,,,,,,!,, ,,,,, ,,,,!,,,,,,, ,,,,,,,,,,!,,, ,,, ,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,!!,,,,,,,,～,,, ,,,,,, ,,,一,,,,,,,,,,,,,,,,～,,,,,, , ,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,, ,, !,,,,,, ,,!,,,,,, ,,,,,,,,!,,, ,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,!,,,,,!,,,,,,,, ,,,,!!,, ,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,, 附质 ,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, , ,,,,,!,,, ,,,,,!,,,,!,,,,,,:,,,,,,,,, ,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,, , ,,!,,,,,,,,,, ,,,,,, ,,,!!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,!,!,,,,,,,,!,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,!,,, ,,,,,,, ,,,,,,,, , ,,!,!,,, ,,, ,,,, ,,,, ,,,,,,,,,!,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,, !,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,, ,,,,,,,,::,, ,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,!,,,,, 一,,,,,,,,,,,,,,,,,!, ,!,,,,,,:,:,,,!,,,,,,,, ,,,,, ,,,,,,,, ,,,,,, ,,!,!,,,!,,,,,,,, ,,,,,,,:,,, !!,,,,,,,,,,,, ,,,, ,,,,,:,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,:,:,,,, ,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,:,, ,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,:,, ,!,,,,,,,,,,,!, ,,,,,,!,:,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,!,:,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,!,,,,,:,,,,,,,!,,:,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,:,,,,,,,,,:,,,,,,,,,,,,,,,,,,, , ,,,,,,,,,!,,,,!,,,,,,,!,,,:,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,!,,,,,!,,,,,,,,,,,,,!, ,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,, ,,,,,, ,,,,,,,,!,,,,,,, ,,,,,,, ,,,,,,,,,,, !,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,, ,, 附质 ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,!,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,!,,,,,,,,,,,,,】,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,!,,, ,,,, ,,,!, ,,,,!,,, ,,,, !,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,, ,,,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,,, ,,,!,,,,,,,,,,,,,,,,,!,,,,,,,!,,,,, ,,,,,,,,,,,,!,, ,!,,,,,,,,,!,, ,, 表;,,,, ,,“,中所有配质的质率和他质的质和性 致质 致质 光质似箭～在三年的质生活中～我学寿教首先要衷心的感质我的质质阮吉授和同质质的沈世质授～位教两渊学老质的博的质～质质的作质～敏质的思质以及待人质厚的作质质了我深刻的影～质得了我响并寿深深的尊敬。阮吉老质的悉心指质使我的知质从广很决深度到度都有了大的质展～使我分析解质质的能力得到和提高。 在质去三年的究生质和生活中～南质大科研学学数学学学学院生物信息质个体来气氛研质质所质出的融洽和究精神使得我愉快地度质了质段美好的质光～质不质是一个气体个极研充质朝～充质快质的质～而且是一富究质新精神和究质研体献份潮的集～每一位成质都在质着自己的一力量。 感质同质质的中质～吴学帮与胡质～王奎～董质质质兄在质上质我的助～他质多次有益的探质使我很启学受质～感质同魏佳～李彦娟～李昕～质志欣～质杰～质质～质国国尚冰根～质拓～质祥～李质琦～玉～高建召～质质哲等质予我的质心和支持。质大家个学研庭质予我的不质是质究上的启帮迪和质助～而且所建立起来笔的身后友质也是我质身受用的一质富。 最后～非常感质我的父母质我的培质的支持～质使得我可以安心学并质质完成质。学