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原位杂交

2017-09-19 4页 doc 20KB 28阅读

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原位杂交(一)DEPC水 DEPC水是经DEPC处理过的灭菌蒸馏水。DEPC即二乙基焦碳酸酯(diethylprocarbonate),可灭活各种蛋白质,是RNA酶的强抑制剂。原位杂交在杂交及其以前的各步处理中,所有液体试剂都应经DEPC处理。方法是:取市售DEPC 1ml,加入1L待处理水(蒸馏水等)中,经猛烈振摇后,于室温静止数小时,然后高压灭菌,以除去降解DEPC(DEPC分解为C02和乙醇)。试剂可直接加入DEPC,终浓度一般为0.1%-0.4%,原则上在杂交及其以前的步骤中,所有液体试剂均需用DEPC处理,或用DEPC水配制...
原位杂交
(一)DEPC水 DEPC水是经DEPC处理过的灭菌蒸馏水。DEPC即二乙基焦碳酸酯(diethylprocarbonate),可灭活各种蛋白质,是RNA酶的强抑制剂。原位杂交在杂交及其以前的各步处理中,所有液体试剂都应经DEPC处理。方法是:取市售DEPC 1ml,加入1L待处理水(蒸馏水等)中,经猛烈振摇后,于室温静止数小时,然后高压灭菌,以除去降解DEPC(DEPC分解为C02和乙醇)。试剂可直接加入DEPC,终浓度一般为0.1%-0.4%,原则上在杂交及其以前的步骤中,所有液体试剂均需用DEPC处理,或用DEPC水配制,包括乙醇的稀释。此外,接触标本以及标本有关的容器的洗涤也需DEPC水洗涤。 注意:(1)DEPC是一种潜在致癌物质,操作中应通风条件下进行,避免皮肤接触。(2)含有Tris缓冲液的溶液中不能加入DEPC。 (二)载波片的处理 组织原位杂交,常在载玻片上进行,故载玻片的洗涤至关重要,必须保持清洁,并且不能任何核酸酶的污染。处理方法如下: (1)先经洗衣粉浸泡过夜,次日自来水流水冲洗后,泡酸数小时以上,取出后再用流水、双蒸水冲洗2—3次,置160℃以上烤箱中烘烤4h以上,或经15磅高压灭菌20min。经以上处理可清除载片上的核酸酶。 (2)HCl处理法 玻片在室温下于1mol/L HCl中浸泡30min;DEPC水中洗片;95%乙醇洗片;空气中干燥。重复上述过程,铝箔包好备用。 (三)载片的包被 1.黏附剂有: (1)多聚赖氨酸(Poly-L-Lysine, PLL) 储备液(0.5%) PLL      25mg DEPC水  5ml 按上述剂量充分混合,即为浓度为5mg/m1(0.5%)的PLL液。常分装成1m1的包装, -20℃存放。该液为储备液,可反复冻融,无明显影响。用前充分混合。 工作液(0.01%): 0.5% PLL      1ml DEPC水      50ml 充分混合,静止待气泡消失。 (2)明胶液 明胶      2.4g 甲明矾    2.4g DEPC水  1000ml 配法:先称取明胶溶于500—800ml DEPC水中,加热搅拌助溶,待明胶完全溶解以后,加入甲明矾溶解后即可使用。注意,包被玻片时,明胶液温度最好保持在60℃左右,效果最佳。方法同PLL包被玻片。 2.多聚赖氨酸包被玻片的制作方法(其它包被剂相同) (1)将事先准备好的经160℃以上烘烤,并冷却至室温的玻片(载片或盖片),在0.05%(也 有用0.1%)的PLL液中上下浸蘸几下,分散开竖放在架子上,于空气中自然干燥,4℃备用。 注意:①浸蘸时,务必使整个玻片完全浸于液体中,否则,包被不完全会产生标本脱落现象;②干燥过程中注意避免尘埃污染;③按上法处理的玻片通常可存放一定时间(室温1月以上,4℃更长),但仍建议尽早使用。 二、操作过程 以针对人Cathepsin B靶基因的mRNA序列为例。本试剂盒采用针对Cathepsin B的寡核苷酸探针,经地高辛标记。  可以检测出常规福尔马林固定,石蜡包埋标本的Cathepsin B之mRNA序列。针对Cathepsin B靶基因的mRNA序列为:   (1)    5’—CATCC  CTCCC  TGTGA  GCACC  ACGTC  AACGG—3’;   (2)    5’—GGCCA  TGCCA  TCCGC  ATCCT  GGGCT  GGGGA—3’;   (3)    5’—GCTGG  AATTC  CACGC  ACCGA  TCAGT  ACTGG—3’; 大鼠、小鼠和人的序列有7bp/90bp不同。 适用种属:人、大鼠、小鼠组织。 试剂盒中内容 1.胃蛋白酶(×10;Pepsin ) 2m1;  2.预杂交液2m1;  3.以CATHEPSIN B寡核苷酸探针杂交液  2m1;    4.封闭液  5m1;    5.生物素化鼠抗地高辛  5m1;  6.SABC—POD  5m1;7.生物素化过氧化物酶  5m1。 用户自备试剂:原位杂交专用盖玻片;Poly-L-Lysine ; DEPC;20%甘油;缓冲液(3%柠檬酸,2×SSC,0.5×SSC,0.2×SSC,  0.5×PBS)    (一)、石蜡切片 准备工作液:缓冲液的配备 3%柠檬酸——100ml蒸馏水中加柠檬酸(C6K807·H20)3g,PH2.O左右。 2×SSC——l000ml蒸馏水中加氯化钠17.6g,柠檬酸三钠(C6H507Na3·2H20,分294)8.8g 0.5×SSC——300ml蒸馏水加l00ml 2×SSC即可。 0.2×SSC——270ml蒸馏水加30ml 2×SSC即可。 20%甘油——20ml甘油加80ml蒸馏水即可。 0.5M PBS一一l000ml蒸馏水加氯化钠30g, Na2HP04·12H20  6g,  NaH2PO4·2H2O 0.4g,PH7.2—7.6。 如果有条件的话,应尽可能地采用新鲜标本。标本离体后,及时予以固定。固定液为4%多聚甲醛/0.1M PBS(PH7.0—7.4),含有l/1000DEPC。标本较大时用刀片切成厚度不超过4mm的小块,固定2小时即可,较大的标本固定不要超过4小时。某些组织对过度固定尤其敏感,如动物大脑,固定时间一定不要超过2小时。 1.常规脱水、浸蜡、包埋。切片厚度6-8μm。 2.玻片的处理:一般采用多聚赖氨酸。 3.石蜡切片经常规脱蜡至水。3%H202室温处理10分钟。蒸馏水洗涤2次。 4.暴露mRNA核酸片段: 切片上滴加3%柠檬酸新鲜稀释的胃蛋白酶(1ml 3%柠檬酸加2滴浓缩型胃蛋白酶,混匀),37℃消化10-60分钟。可以比较不同的消化时间,例如10分钟,20分钟,30分钟和60分钟,以找到最佳的消化时间。0.5M PBS洗3次×5分钟。 5.预杂交:湿盒的准备一干的杂交盒底部加20%甘油20ml以保持湿度。按每张切片20μl加预杂交液。恒温箱37-40℃ 2-4小时。吸取多余液体,不洗。 6.杂交——按每张切片20 μl杂交液,加在切片上。将原位杂交专用盖玻片的保护膜揭开后,盖在切片上。恒温箱40-42℃杂交过夜c 7.杂交后洗涤:揭掉盖玻片,30-37℃左右水温的2×SSC洗涤5分钟×2次;0.5×SSC洗涤15分钟×1次;0.2×SSC洗涤15分钟×1次(如果有非特异性染色,重复0.2×SSC洗涤15分钟×l-2次)。 8.滴加封闭液:37℃30分钟。甩去多余液体,不洗 9.滴加生物素化鼠抗地高辛:  37℃60分钟或20℃左右120分钟。0.5M  PBS洗5分钟×4次。勿用其它缓冲液和蒸馏水洗涤。 10.滴加SABC:37℃20分钟或20℃左右30分钟。0.5M  PBS洗5分钟×3次。勿用其它缓冲液和蒸馏水洗涤。    11.滴加生物素化过氧化物酶:37℃20分钟或20℃左右30分钟。0.5M  PBS洗5分钟×4次。 12.DAB显色:使用DAB显色试剂盒,用lml蒸馏水加显色剂A,B,C各一滴,混匀,加至标本上。一般显色20-30分钟。若无背景出现则可继续显色。也可自配DAB显色剂后显色。充分水洗。 13.必要时苏木素复染,充分水洗。 14.酒精脱水,二甲本透明,封片。 (二)、培养细胞和冰冻切片 注意:最重要的是及时固定,并在固定液中加入0.1%的DEPC处理,以抑制RNA酶对mRNA的分解作用。此外,过度固定对原位杂交有明显的不利影响。 1.玻片的处理:一般采用多聚赖氨酸。切片厚度20 μm。 2.细胞在多聚赖氨酸处理的盖玻片上进行培养,条件为37℃和5%的CO2,所用培养基为Dulbecco基础培养基。细胞长好后O.1M PBS(PH7.4)洗2分钟×3次。 3.培养细胞和冰冻切片均可用下述方法固定:固定液为4%多聚甲醛/0.1M PBS(PH7.2—7.4),含有l/l000 DEPC。室温固定30—60分钟。蒸馏水充分洗涤洗涤,干燥后-20℃冰冻可保存2周以上。 4.新鲜配制0.5%H202/甲醇室温处理30分钟以灭活内源性过氧化物酶。蒸馏水洗涤3次。 5.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%柠檬酸新鲜稀释的胃蛋白酶(1ml 3%柠檬酸加2滴浓缩型胃蛋白酶,混匀),37℃消化30—120秒钟。有时也可以不消化。0.5M PBS洗3次×5分钟。蒸馏水洗1次。 其余步骤同上5—14。 文档已经阅读完毕,请返回上一页!
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