DNA拷贝数的计算方法

DNA拷贝数的计算方法 分步推理如何计算核酸拷贝数 1A260吸光度值=dsDNA 50ug/ml=ssDNA 33ug/ml=ssRNA 40ug/ml 核酸浓度=(OD260)×稀释倍数×(33 或40 或50)=ng/ul MW 代表克/摩尔,单位dolton:1dolton 即表示1g/mol 1 摩尔=6.02×1023摩尔分子(拷贝数) 平均分子量(MW):dsDNA=碱基数×660 道尔顿/碱基 ssDNA=碱基数×330 道尔顿/碱基 ssRNA=碱基数×340 道尔顿/碱基 得到拷贝数计算公式:6.02×1023拷贝数/摩尔×(浓度)/(MW g/mol)= copies/ml. 即(6.02×1023)×(g/ml)/(DNA length×660)=copies/ml. 或(6.02×1023)×(ng/ul×10-9)/(DNA length×660)=copies/ul. 例:3000 碱基质粒,浓度100 ng/ul MW=3000bp×660dalton/bp=1.98×106daltons,即1mol=1.98×106g(100ng×10-9)g/1.98×106=摩尔数 copy 数=摩尔数×6.02×1023=3×1010copies/ul. 1. dsDNA : (6.02×1023)×(ng/ul×10-9)/(DNA length×660)=copies/ul= (9.12×1011)×(ng/ul)/(DNA length) 2. ssDNA: (6.02×1023)×(ng/ul×10-9)/(DNA length×330)=copies/ul= (1.82×1012)×(ng/ul)/(DNA length) 3. ssRNA: (6.02×1023)×(ng/ul×10-9)/(DNA length×340)=copies/ul= (1.77×1012)×(ng/ul)/(DNA length)