孙义民-LDT研制技术规范

2014/6/191个体化个体化医学医学检测LDTLDT研制技术规范研制技术规范孙义民孙义民ymsun@capitalbio.comymsun@capitalbio.com博奥生物集团有限公司博奥生物集团有限公司北京博奥医学检验所北京博奥医学检验所生物芯片北京国家工程研究中心生物芯片北京国家工程研究中心全国生物芯片化技术委员会全国生物芯片标准化技术委员会纲要11••国外国外LDTLDT发展现状发展现状222••LDTLDT研制技术规范研制技术规范33••LDTLDT应用举例应用举例纲纲要要11••国外国外LDTLDT发展现状发展现状322••LDTLDT研制技术规范研制技术规范33••LDTLDT应用举例应用举例美国体外诊断监管体系美国体外诊断监管体系医疗保险和医疗补助服务中心（CMS）法律授权：1988年的临床实验室改进修食品药品监督管理局（FDA）法律授权：1976年联邦贸易委员会（FTC）法律授权：联邦贸易4的临床实验室改进修正案（CLIA）监管内容：临床实验室法律授权年的医疗器械修正案监管内容：检测试剂盒法律授权联邦贸易委员会法（FTCA）监管内容：虚假、误导性广告CMS：Centersfor Medicare & MedicaidServicesCLIA：ClinicalLaboratoryImprovementAmendmentsFDA：Food and Drug AdministrationFTC：Federal Trade CommissionFTCA：Federal Trade CommissionActIVDs IVDs vs. vs. LDTsLDTs生产出的检测试剂盒销售到多个实验室FDA批准检测试剂盒分销至患者、医院或临床实验室患者1)体外诊断产品（IVDs，In Vitro Diagnostics）5由实验室自行设计、生产，只在该实验室使用FDA行使自由裁量权LDTs可以不经过评审直接进入市场患者2) 实验室自用方法（LDTs，Laboratory Developed Tests）:Public Meeting on Oversight of LDTs. Office of In Vitro Diagnostic Device Evaluation and Safety Center for Devices and Radiological Health/FDA美国美国LDTLDT定义定义‹“Laboratory Developed Test (LDT) is a class of in vitro diagnostics (IVDs) that are manufactured, including being developed and validated, and offered, within a single laboratory”——U.S. Food and Drug Administration1LDT是一类用于体外诊断的临床检测方法，由具有相关资质的实验室单独开发并且只能在该实验室内进行检测。‹“A test developed within a CLIA-certified laboratory that is used in patient management and has both of the following characteristics2:1.Thetestisperformedbytheclinicallaboratoryinwhichthetestwasdeveloped.2.ThetestisneitherFDA-clearednorFDA-approved——College of American Pathologists2LDT是由具有CLIA资质的实验室开发出的用于病人管理的检测，具有以下特征：–在开发该检测的临床实验室中进行–该检测没有被FDA批准61.http://www.fda.gov/MedicalDevices/NewsEvents/WorkshopsConferences/ucm212830.htm2.CAP定义Arch PatholLab Med，20112014/6/1929地方性；9非商业性（大多数）；9临床医生/病理学专家/病人模式运行；9罕见病及其他需求；9以自由裁量权进行管理；9受1988年临床实验室改进修正案CLIA管理9分子检测技术迅速发展，出现多重检测；9DTC模式出现；9FDA相继出台IVDMIA指南草案（2007）、Research Use Only及Investigational Use Only（2011）监管条例，强调上市前审查和上市后监督必不可少美国美国LDTsLDTs发展史发展史7初始1990s2000s2010s9基因检测兴起；9大量研究级试剂应用与临床检测；9FDA首次就LDTs的监管发出书面声明，主要开始监管相关原料；9继续给予LDT自由裁量权，表示可能会随着检测风险的增加而增加监管9技术复杂化、自动化，应用范围极大扩展，数量和种类迅速增加，针对药物反应和疾病风险的检测增多；9突破临床专家/病理学家/患者的关系模式；9商业实验室和生物技术公司的主要部分；92010FDA曾召开会议终止LDT自由量裁权Public Meeting on Oversight of LDTs. Office of In Vitro Diagnostic Device Evaluation and Safety Center for Devices and Radiological Health/FDAWhileWhilethetheFoodFoodandandDrugDrugAdministrationAdministration(FDA(FDA))assumesassumesauthorityauthorityforforregulatingregulatingLDTs,LDTs,andandisiscurrentlycurrentlyexercisingexercisingenforcementenforcementdiscretiondiscretion（（自由裁量权自由裁量权））,,itithashasindicatedindicatedititwillwillbebeincreasingincreasingoversightoversightofofLDTsLDTsininthethenearnearfuturefuture..Currently,Currently,thetheonlyonlyoversightoversightrequirementsrequirementsgoverninggoverningLDTsLDTsarearethethelaboratorylaboratoryrequirementsrequirements美国美国LDTLDT的监管的监管8governinggoverningLDTsLDTsarearethethelaboratorylaboratoryrequirementsrequirementsprescribedprescribedininthetheClinicalClinicalLaboratoryLaboratoryImprovementImprovementAmendmentsAmendmentsofof19881988(CLIA)(CLIA)..TheTheFDAFDAhashasnotnotyetyetmademadeanyanychanges,changes,butbutstricterstricteroversightoversightofofLDTsLDTsisiswidelywidelyanticipatedanticipated..CAPCAP推荐推荐的的LDTLDT的的9分级管理分级管理AgencyforHealthcareResearchandQuality(AHRQ)108121441纲纲要要11••国外国外LDTLDT发展现状发展现状1122••LDTLDT研制技术规范研制技术规范33••LDTLDT应用举例应用举例中国个体化医学检测中国个体化医学检测LDTLDT定义定义LDT定义：实验室自用方法（laboratory developed test，以下简称LDT）是指可单独使用或须与特定仪器、设备或系统组合使用的体外检测试剂（盒）、校准品、质控品等。LDT检测项目至少应该满足以下3个条件:由卫计委医政医管局批准的可以开展个体化医学检测的医疗机构开发，并在112其实验室提供检测服务；未获得食品药品监管部门的医疗器械注册证书；具备明确的临床适用范围和预期用途，即在疾病的预防、诊断、治疗监测、预后观察、健康状态评价以及遗传性疾病的预测过程中进行体外检测。23本规范仅阐述在个体化医学分子检测实验室开发LDT应遵循的基本规范2014/6/193第三章实验室质量管理第十条实验室应当使用经国家食品药品监督管理总个体化医学检测实验室管理办法个体化医学检测实验室管理办法13局批准的商品试剂开展个体化医学检测实验室项目；如为自制试剂，检验项目的临床意义应经过国家卫生计生委个体化医学检测专家委员会论证，并对试剂的性能充分确认后，方可使用。在实际应用中，个体化医学检测实验室所用方法应符合在实际应用中，个体化医学检测实验室所用方法应符合实验室服务用户的需求，优先使用公认、权威教科书，经业实验室服务用户的需求，优先使用公认、权威教科书，经业内评议较高水准的书刊或杂志，或国际、国家或地区的指南内评议较高水准的书刊或杂志，或国际、国家或地区的指南什么情况下开发什么情况下开发LDTLDT？？14中发表的程序。中发表的程序。所用检测程序如有食品药品监管部门批准的所用检测程序如有食品药品监管部门批准的试剂盒，宜采用此商用试剂盒；如无法满足检测需求可采用试剂盒，宜采用此商用试剂盒；如无法满足检测需求可采用LDTLDT，，LDTLDT的临床应用应当遵循科学、安全、规范、有效、的临床应用应当遵循科学、安全、规范、有效、经济、符合伦理的原则。经济、符合伦理的原则。上海百傲华法林试剂盒上海百傲CYP2C19试剂盒博奥生物CYP2C9*2-430C>T●CYP2C9*3-1075A>C●●VKORC1-1639A>G●●抗栓药物个体化用药指导基因芯片抗栓药物个体化用药指导基因芯片15VKORC1-1173T>C●CYP4F2-rs2108622C>T●GGCX-3261G>A●CYP2C19*2-681G>A●●CYP2C19*3-636G>A●●CYP2C19*17-806C>T●CYP3A4-894C>T●应用于临床的应用于临床的LDTLDT项目原则上遵循项目原则上遵循《《全国医疗服务价格项全国医疗服务价格项目规范目规范》》、、《《卫生部临检目录卫生部临检目录》》和国家卫生主管部门或各专业和国家卫生主管部门或各专业协会发布的疾病诊疗指南，或协会发布的疾病诊疗指南，或个体化医学检测技术专家委员会个体化医学检测技术专家委员会什么项目开发什么项目开发LDTLDT？？16发布的个体化医学检测指南发布的个体化医学检测指南（以上统称“相应目录”）。（以上统称“相应目录”）。LDTLDT研制技术规范的建立及实施是保证检测方法可靠性的重要手段。研制技术规范的建立及实施是保证检测方法可靠性的重要手段。本规范仅阐述在个体化医学分子检测实验室开发本规范仅阐述在个体化医学分子检测实验室开发LDTLDT应遵循的应遵循的基本规范。基本规范。本规范是对本规范是对LDTLDT验证的一般要求，实验室应依据具体检测验证的一般要求，实验室应依据具体检测项目的特性对验证内容进行充实和细化。并依据检测方法的自项目的特性对验证内容进行充实和细化。并依据检测方法的自一套技术规范如何实现综合管理？一套技术规范如何实现综合管理？17身特点确定其中的具体内容是否适用，若不适用，需具体阐述身特点确定其中的具体内容是否适用，若不适用，需具体阐述其理由及相应的科学依据，并由个体化医学检测技术专家委员其理由及相应的科学依据，并由个体化医学检测技术专家委员会组织的专家评定其科学性。会组织的专家评定其科学性。本技术规范适用范围本技术规范适用范围国家卫生行政管理部门明令禁止未列入相应目录，且未通过个体化医学检测技术专家委员会组距上次同一检测项目未通过批准时间国家卫生行政管理部门规定的其他情形本规范适用于本规范适用于LDTLDT的开发。的开发。18的检测项目测技术专家委员会组织的专家论证未满6个月门规定的其他情形LDT检测项目不得递交开展申请2014/6/194LDTLDT项目的申请和批准项目的申请和批准LDT在用于临床检测前，需进行充分、严格的验证和性能评估，并向国家卫生计生委临检中心递交申请，临检中心组织专家批准通过后方可用于临床检测。需提交资料有：1.个体化医学检测实验室的医疗机构名称、级别、类别、相应诊疗科目登记情况及相应检验项目开展情况。2.LDT检测项目属于相应目录的说明，或该LDT检测项目通过个体化医学检测技术专家委员会组织的专家论证的证明。193.综述资料，包括开展该项LDT检测项目的目的、意义和实施；该项LDT检测项目的基本概况，包括国内外应用情况、适用范围、技术路线、质量保证措施、判定标准、评估方法，与其他检测技术检测同种疾病的风险、疗效、费用比较等；开展该项LDT检测项目具备的条件，包括主要技术人员的情况、资质、相关履历，医疗机构的设备、设施、其他辅助条件、风险评估及应急预案。4.主要原材料研究资料。5.分析性能评估资料：包括准确性、重复性、灵敏度、特异性、线性范围等研究资料。6.参考值研究资料。7.医疗机构内的伦理审查报告。LDTLDT项目的研制项目的研制物料控制物料控制临床性能临床性能质量保证质量保证20体系研制体系研制分析性能分析性能评估评估参考区间参考区间临床性能临床性能评估评估物料控制总体原则物料控制总体原则物料分类及供应商管理物料分类及供应商管理见质量保证－采购文件要求。见质量保证－采购文件要求。物料质量控制物料质量控制99LDTLDT物料质量控制应提供主要原材料如引物、探针、企业参考品或标准物料质量控制应提供主要原材料如引物、探针、企业参考品或标准品等的选择与来源制备过程质量分析和质量标准等的相关研究资料品等的选择与来源制备过程质量分析和质量标准等的相关研究资料21品等的选择与来源、制备过程、质量分析和质量标准等的相关研究资料。品等的选择与来源、制备过程、质量分析和质量标准等的相关研究资料。99如果主要原材料来自市场（从其他单位购买），应提供的资料包括：购如果主要原材料来自市场（从其他单位购买），应提供的资料包括：购买合同、供货方提供的质量标准、出厂检定报告等。买合同、供货方提供的质量标准、出厂检定报告等。99LDTLDT中核酸类的包装材料和耗材应无中核酸类的包装材料和耗材应无DNaseDNase和和RNaseRNase污染，蛋白类应无污染，蛋白类应无蛋白酶的污染等。蛋白酶的污染等。物料分类与质量控制物料分类与质量控制LDT物料分类生物辅料商用试剂盒化学原辅料生物原料酶类/缓冲液杂交缓冲液样本提取无机类基片其他材料22校准品等dNTP引物及接头探针标记物蛋白鱼精DNA封闭用蛋白样品纯化样品标记其他有机类特殊类磁珠耗材LDT研制体系原材料筛选检测体系建立与优化软件及配套设施检测体系定型性能指标体系研制体系研制23检测对象及范围对照体系防污染体系检测体系优化质控体系检测性质指标及数量技术路线原料分类及供应商评价酶类物料评价要求引物及探针评价要求抗原及抗体评价要求软件设备设施30次检测分析性能评估分析性能评估准确度重复性/精密度分析性能评估，是旨在确认LDT在预期使用条件下能满足预期用途所必须的性能研究，也是检测方法针对待测物质的准确性及可24分析性能评估分析特异性分析灵敏度线性/检测范围方法针对待测物质的准确性及可靠性验证。对于基于多指标检测的LDT，分析性能评估应根据检测原理注重于检测技术的准确性及可靠性，应科学合理，满足实际检测需求。2014/6/195分析性能评估分析性能评估分析特异性分析灵敏度线性/检测范围重复性/精密度准确度9准确度是指检测结果与参比方法所得结果相比的一致性。2. 性能分析方法1. 被检样品选择3. 评价指标要求25与参比方法对比金标准-标准诊断方法:目前公认的最可靠、最准确、最好的诊断方法;或者室间比对;定性检测：一致率应不小于90％；定量检测：线性回归的相关系数r≥0.900，或相对标准偏差不超过10％。样本数量：检测范围内平均分布或按照高、中、低级别分布的至少50个样品；如需要阳性样品，则阳性样品的百分率一般不低于30％。样本类型：国家标准物质；国际标准物质；行业内公认的标准物质；符合需求的临床样品；可溯源的标准细胞株或标准核酸或蛋白。3. 评价指标要求分析性能评估分析性能评估分析特异性分析灵敏度线性/检测范围重复性/精密度准确度9重复性/精密度是指在规定条件下，相互独立的测试结果之间的一致程度。1. 被检样品选择2. 性能分析方法定性检测的结果与对照品的已知结果相比，一致率不低于90％；定量检测的结果，变异系数（CV）不大于10％。26在检测范围内:定性检测至少选择阴、阳2个样品；定量检测须选择检测范围内涵盖高、中、低不少于3个浓度的样品。需要检测：批内/批间精密度；日内/日间精密度；不同人员操作精密度；如需要,还需：室间精密度。分析性能评估分析性能评估分析特异性分析灵敏度线性/检测范围重复性/精密度准确度9检测范围指能够稳定给出正确检测结果的样品中被测物质的浓度（或含量）范围，适用于定性检测技术；9线性范围指测量结果与实际存在的被测物质的值成比例关系的样品中被测物质的27浓度范围，适用于定量检测技术。„LDT的线性范围/检测范围可以采用阳性样品的梯度稀释法确定，须保证检测范围的可靠性。分析性能评估分析性能评估分析特异性分析灵敏度线性/检测范围重复性/精密度准确度9分析灵敏度是指可得到正确检测结果的样本中被测物质的最低浓度（或含量）；9分析灵敏度须根据LDT的具体检测技术的特性确定该方法的灵敏度3. 评价指标要求1. 被检样本选择2. 性能分析方法28评价指标要求以90％标本都可得到正确检测结果的浓度为灵敏度。梯度稀释的阳性样品；至少对3个在分析灵敏度或接近分析灵敏度浓度的样品进行试验验证。分析性能评估分析性能评估分析特异性分析灵敏度线性/检测范围重复性/精密度准确度9分析特异性指当干扰物质或可能发生交叉反应的物质存在时，检测方法只测定目标被测物质的能力。3. 评价指标要求1. 被检样本选择2. 性能分析方法29检测结果应与阳性被检物质检测结果完全吻合。综合考虑样品类型、干扰物质、药物、其他疾病等因素进行选择可能的干扰物质和交叉反应物质。至少对不低于3种可能存在的干扰物质或可能发生的交叉反应物质进行试验验证。参考区间或参考区间或cutcut--offoff值值9通过对按明确标准选择的参考个体某一特定量进行测量得到参考值，用于分类目的的参考值为参考限，参考区间即两参考限（包括两参考限）之间的区间。9参考区间或cutoff值的确定应采用公认或合理的统计学方法如回309参考区间或cut-off值的确定应采用公认或合理的统计学方法，如回归分析，受试者工作特征（receivingoperatingcharacteristic,ROC）曲线分析等。9如果开发的LDT适用于多种类型的临床样品，则参考值范围确定时选取的样品应尽量涵盖不同类型。2014/6/196临床性能评估临床性能评估9临床性能评估是检测方法针对临床样品的灵敏度及特异性评价。9LDT检测项目在通过分析性能评估后应咨询个体化医学检测技术专家委319LDT检测项目在通过分析性能评估后应咨询个体化医学检测技术专家委员会，确定是否需要进行临床随访观察，如需要，则在核查时提供样本的随访指标及统计学结果，直至检测样本达到足够例数后，继续随访不再做强制要求，但提倡实验室沿袭随访机制。纲纲要要11••国外国外LDTLDT发展现状发展现状3222••LDTLDT研制技术规范研制技术规范33••LDTLDT应用举例应用举例生物芯片技术的临床应用生物芯片技术的临床应用遗传病与出生缺陷检测遗传病与出生缺陷检测微生物分型、鉴定与耐药检测微生物分型、鉴定与耐药检测肿瘤个体化医学检测肿瘤个体化医学检测心脑血管个体化用药指导心脑血管个体化用药指导‹‹染色体异常遗传病染色体异常遗传病，简称染色体病，指由于染色体数目数目和结构异常结构异常所引起的疾病统称，是导致出生缺陷的重要原因之一。我国每年新增染色体异常疾病的患儿估计总数达10-20万之多，每年仅新出生的唐氏综合征生命周期的总经济负担超过100100亿亿元。推广适宜技术适宜技术，落实出生缺陷的三级预防措施具有重要的社会意义染色体疾病发病率染色体疾病发病率34防措施，具有重要的社会意义。•1％的新生儿；•2％的超过35岁高龄产妇；•3.7％的患有全身性发育迟缓的新生儿；•7.4％的患有孤独症或房间隔缺损的新生儿；•50％的早期自然流产胎儿基因组变异类型基因组变异类型Moleculargeneticdetection分子遗传检测测序、芯片、定量PCR35NatureGenetics,2007,39:S7-S15Cytogeneticdetection细胞遗传检测核型分析，FISH，芯片检测基因组结构变异的技术方法检测基因组结构变异的技术方法NatureReviewsGenetics,2006,7:85-972014/6/197不同检测技术的分辨率不同检测技术的分辨率ClinicalChemistry,2009,55:41kb-5Mb:亚微观（submicroscopic）>5Mb：微观（microscopic）CGHCGH－比较基因组杂交－比较基因组杂交CComparative omparative GGenomic enomic HHybridization (ybridization (CGHCGH))比较基因组杂交比较基因组杂交AArrayrray--based based CComparative omparative GGenomic enomic HHybridization (ybridization (aCGHaCGH))基于芯片的比较基因组杂交基于芯片的比较基因组杂交38国际上第一篇国际上第一篇CGHCGH文章文章39Science,1992,258:818-821KallioniemiAnneUniversityofTampere•Celllines•Bladdertumor•16amplifiedregions国际上第一篇国际上第一篇aCGHaCGH文章文章PeterLichterDKFZ,德国癌症研究中心•PACclones•19spots•CancercelllinesDanielPinkel通过通过BACBAC克隆完成克隆完成aCGHaCGH研究研究DanielPinkelUCSFNatureGenetics,1998,20:207-211•BACclones•Chromosome20•3Mresolution•BreastcancerPatrickO.BrownStfdUiitNatureGenetics,1999,23:41-46通过通过cDNAcDNA芯片完成芯片完成aCGHaCGH研究研究StanfordUniversity,,•cDNAmicroarray•30,000genes•Wholegenome•Breastcancercellline2014/6/198MichaelWigler通过通过OligoOligo芯片完成芯片完成aCGHaCGH研究研究43MichaelWiglerColdSpringHarborLabScience,2004,305:525-528•ROMA(representationaloligonucleotidemicroarrayanalysis)•85,000probes•20individuals,221CNVs•oneofthefirsttwopapersdescribingglobalCNVsinhumangenome•2632BACclones•55individuals,255CNVs•oneofthefirsttwopapersdibi正常人群的全基因组正常人群的全基因组CNVCNV扫描扫描CharlesLeeHarvardUniversityNatureGenetics,2004,36:949-951describingglobalCNVsinhumangenomeCNVs: 66741Inversions: 953http://projects.tcag.ca/variation/DDatabaseatabaseofofGGenomicenomicVVariantsariantsInDels(100bp-1Kb): 34229Total CNV loci: 15963Lastupdated:Nov02,2010Thecontentofthedatabaseisonlyrepresentingstructuralvariationidentifiedinhealthycontrolsamples.晶芯晶芯TMTM染色体异常检测芯片数据支持染色体异常检测芯片数据支持染色体变异数据库疾病种类致病基因致病CNV区段Decipher581922NAISCA843964061OMIM3392928NA46GRCP108NA125Decipher:DatabaseofChromosomalImbalanceandPhenotypeinHumansUsingEnsemblResources;ISCA:InternationalStandardsforCytogenomicArrays;OMIM:OnlineMendelianInheritanceinMan;GRCP:GeneticResourceofChinesePopulation,中华民族健康与疾病遗传资源共享平台数据库中华民族健康与疾病遗传资源共享平台是根据生命科学和医学研究的需要，以资源整合共享为核心，以共享网络建设为基础，最大限度地拓展、整合全国人类健康与疾病的遗传资源，构建一个布局合理、动态发展、拥有多病种、大数量的国家级遗传资源实物和信息集成共享平台，为人类健康的科学研究提供科技创新支撑平台。本平台在教育部领导下，由四川大学、中南大学、西安交通大学三所大学共同建设。国际主流染色体异常检测芯片国际主流染色体异常检测芯片公司产品名称疾病种类博奥生物晶芯TM染色体异常检测基因芯片509RocheNimbleGenCGHISCAPlus418AgilentISCACNV+SNP400＋47AgilentISCACNV+SNP400＋AffymetrixCytoScanHD300+IlluminaHumanCytoSNP-12245SignatureGenomicsCGX200+GeneDXPrenatalTargetedArray101华联生物CytoOneArray264香港中文大学FetalDNAchip122实验流程实验流程482014/6/199晶芯晶芯TMTM染色体异常检测基因芯片染色体异常检测基因芯片49单位Sex Age Race DiseaseKaryotype (ISCN) 八一儿童医院Female3MonChineseTRISOMY21(21三体)47,XX,+21DOWNDOWN综合症综合症（八一儿童医院）（八一儿童医院）50单位Sex Age Race DiseaseKaryotype (ISCN) 八一儿童医院Male1YRChinesePRADER-WILLISYNDROME(普瑞德威利综合症)46,XY.（15q11.2q26)x1PRADERPRADER--WILLI WILLI 综合症综合症（八一儿童医院）（八一儿童医院）••隐睾隐睾--侏儒侏儒--肥胖肥胖--智力低智力低下综合征下综合征51下综合征下综合征••肌张力减退肌张力减退--智力减退智力减退--性性腺功能减退与肥胖综合腺功能减退与肥胖综合征。征。单位Sex Age Race DiseaseKaryotype (ISCN) 八一儿童医院Male6YRChineseANGELMANSYNDROME(天使综合症，UPD）46,XY11p15.4(9604412-10107157)x1,15q11.1q26.3(18331686-99858666)x2天使综合症天使综合症（八一儿童医院）（八一儿童医院）52患者脸上始终带着笑容，但动作患者脸上始终带着笑容，但动作机械，智力低下，同时还有癫痫机械，智力低下，同时还有癫痫等症状。病征包身边经常发笑，等症状。病征包身边经常发笑，双手举高，挥舞，脚下不稳，痉双手举高，挥舞，脚下不稳，痉挛，缺乏语言能力及智障，因此挛，缺乏语言能力及智障，因此被称为“快乐木偶综合症”。被称为“快乐木偶综合症”。单位核型样品来源附加信息西南医院46，XY，der（12）t(9;12)脐血非平衡易位从芯片数据可以推测从芯片数据可以推测染色体非平衡易位染色体非平衡易位（西南医院）（西南医院）••表型：先天性小耳畸形，表型：先天性小耳畸形，胸腺缺如胸腺缺如53••从芯片数据可以推测，从芯片数据可以推测，chr9chr9长臂末端的一段约长臂末端的一段约16Mb16Mb长度长度DNADNA转位到转位到chr12chr12的短臂末端，转位的短臂末端，转位过程中过程中chr12chr12的短臂末端的短臂末端约约1.7Mb1.7Mb丢失丢失。形成一个。形成一个新的新的1212号染色体号染色体derder(12)(12)1212号染色体号染色体1.7Mb1.7Mb的缺失的缺失是传统核型分析无法检测是传统核型分析无法检测的。的。男性不孕不育男性不孕不育（烟台毓璜顶医院）（烟台毓璜顶医院）542014/6/1910•样品编号：13013013.1       •订单编号：MD－aCAD-2013013-004 •样品类型：羊水细胞•样品接收时间：2013-04-28•病史：案例案例11--病史及临检结果病史及临检结果•病史：1. 2007年足月剖宫产一男婴，新生儿因水肿出生20天后死亡（确切病因不详）。2.2011年孕5+月行羊水穿刺结果是46,XX,14p+，B超提示胎儿水肿，故予引产。•临检结果：此次妊娠孕中期行羊水穿刺胎儿染色体未见明显异常，孕22周行胎儿筛查B超胎儿未见明细畸形。55案例案例11--芯片检测结果芯片检测结果是一种先天过度生长的疾病是一种先天过度生长的疾病，，通常患者在出生前即已有可能发通常患者在出生前即已有可能发生过度生长的情形生过度生长的情形，，出生后可能发生新生儿低血糖出生后可能发生新生儿低血糖，，并伴随有并伴随有巨舌巨舌、、内脏肿大内脏肿大、、半边肥大等病症半边肥大等病症，，耳朵上会出现特殊的折痕耳朵上会出现特殊的折痕56及小凹陷及小凹陷,,胚胎肿瘤胚胎肿瘤（（如肾脏的如肾脏的Wilm'sWilm'stumortumor，，及肝脏的肝及肝脏的肝母细胞瘤母细胞瘤）），，孕期孕期，，羊水过多羊水过多，，易早产易早产，，心脏异常心脏异常，，早夭的原早夭的原因主要包括早产儿因主要包括早产儿、、心肌症心肌症、、血糖过低血糖过低、、巨舌及肿瘤巨舌及肿瘤。。过度生过度生长在长在77--88岁后逐渐减缓岁后逐渐减缓..医生在向夫妇二人解释了检测结果后，二人初步意愿为保留胎医生在向夫妇二人解释了检测结果后，二人初步意愿为保留胎儿，并进一步采集自身外周血样品用于进一步的芯片检测，以儿，并进一步采集自身外周血样品用于进一步的芯片检测，以分析致病原因（结果显示，该扩增为新发变异）分析致病原因（结果显示，该扩增为新发变异）怀孕怀孕88个月，出现早产症状，产后胎儿多内脏器官肿大（医生个月，出现早产症状，产后胎儿多内脏器官肿大（医生认为是代偿性的），但无巨舌症状（可能与早产有关），胎儿认为是代偿性的），但无巨舌症状（可能与早产有关），胎儿在孵箱中抢救后，生命指症开始恢复，但其父母放弃治疗。在孵箱中抢救后，生命指症开始恢复，但其父母放弃治疗。案例案例22--基本信息基本信息•样品编号：CAD130012MU_1•订单编号：MD－aCAD-2013013-004•样品类型：外周血•样品接收时间：20130620•样品接收时间：2013-06-20•主诉：患者智力低下，有2次流产史（8个月）57•病史：1.患者智力低下；2.患者有两次流产史，都是在8个月的时候流产。案例案例22--病史及临检结果病史及临检结果•临检结果：医生通过核型分析方法检测患者样本，发现为21三体，但患者本身出了智力低于常人以外，没有唐氏综合征的其他典型症状。58案例案例22--芯片检测结果芯片检测结果4q部分三体区域中，4q33-q34区域一般不会引起明显的临床症状；而4q35区域的扩增则被认为是主要的引起头小畸形、发育迟缓及精神发育迟滞的主要59迟滞的主要原因。21q11.2-q22.11并不在唐氏综合症的核心区域，目前的研究认为该区域的扩增可能导致上倾的眼裂、布鲁士菲尔德斑、皮纹异常、掌纹异常、轻微的精神发育迟滞，但不会导致其他的严重的明显的异常或者畸形症状。结论：该患者并不是21三体，而是4号染色体的一部分与21号染色体的一部分重组成一条新的染色体。该患者的症状主要来自于4号染色体的扩增。编号细胞学检测样品来源附加信息CAD130027L1_1芯片：47，XY，+15流产绒毛膜组织临床：不明原因胎停育。CAD130030L1_1芯片：47，XY，+16流产绒毛膜组织临床：不明原因胎停育。流产组织分析：孕早期胎停育流产组织分析：孕早期胎停育60•清华大学附属玉泉医•15三体综合征：较为少见的一种三体综合征，多引起流产，一般发生于怀孕的前三个月内。•16三体综合征：是导致流产最常见的三体综合征，是导致流产的第二常见的染色体异常原因，位于X染色体单体综合征之后；流产一般发生于怀孕的前3个月内。Confidential!Confidential!2014/6/1911编号细胞学检测样品来源附加信息CAD2130020S1_1芯片：22q11.2微缺失外周血临床：身材矮小，有先心病史芯片：22q11.2微缺失综合征9北京儿童医院，患者22q11.2微缺失。922q11.2微缺失综合征包括腭心面综合征和DiGeorge综合征。儿科检测应用：先心病儿科检测应用：先心病61g9腭心面综合征表现有腭咽发育不良，心脏缺陷和特殊面容。部分患者轻度智力低下、非语言性学习障碍。小头畸形，长脸，颧骨平坦，下颌后移，杏仁样眼睑裂，鼻尖呈灯泡样，鼻根窄小，鼻翼小，腭裂、咽腭发育不良，咽扁桃体小或缺失。室间隔缺损。喂养困难，生长障碍，身材矮小，手、指细长。9DiGeorge综合征以先天性心脏病、免疫缺陷和低血钙三大症状为特点，包括动脉干狭窄，室间隔缺损，甲状旁腺发育不良或缺失，轻到中度智力低下，小颌、耳廓异常，食管闭锁等。Confidential!Confidential!临床检验服务流程临床检验服务流程62ACOG2009CCMG2010ISCA2010数据解读依据国际权威机构指南63ACOG,2009美国妇产科学会产前诊断核型分析的补充手段CCMG,2010加拿大医学遗传学会出生后/产前诊断ACMG,2011美国医学与遗传学会临床应用临床应用（出生后）实验指南及标准ECA,2012欧洲细胞遗传学协会实验指南及质控要求ISCA,2010国际基因组芯片标准联盟出生后诊断ACMG,2013美国医学与遗传学会临床应用临床应用（出生后）实验指南及标准肿瘤相关的转化医学研究肿瘤相关的转化医学研究肿瘤病人肿瘤病人外周血白细胞外周血白细胞DNA/CTCDNA/CTC术后组织样品术后组织样品RNARNA肿瘤转移肿瘤转移//复发复发肿瘤放化疗敏肿瘤放化疗敏感性评估感性评估肿瘤预后肿瘤预后肿瘤预警肿瘤预警血浆蛋白血浆蛋白//游离核酸游离核酸肿瘤早期辅助肿瘤早期辅助诊断诊断65662014/6/1912到到20202020年，基本建立覆盖全生命周期、内涵丰富、结构合理的健康服务业体系，打造一年，基本建立覆盖全生命周期、内涵丰富、结构合理的健康服务业体系，打造一批知名品牌和良性循环的健康服务产业集群，并形成一定的国际竞争力，基本满足广大人批知名品牌和良性循环的健康服务产业集群，并形成一定的国际竞争力，基本满足广大人民群众的健康服务需求。健康服务业总规模达到民群众的健康服务需求。健康服务业总规模达到88万亿万亿元以上，成为推动经济社会持续发元以上，成为推动经济社会持续发展的重要力量。展的重要力量。————医疗服务能力大幅提升。医疗卫生服务体系更加完善，形成以非营利性医疗机构医疗服务能力大幅提升。医疗卫生服务体系更加完善，形成以非营利性医疗机构为主体、营利性医疗机构为补充，公立医疗机构为主导、非公立医疗机构共同发展的多元为主体、营利性医疗机构为补充，公立医疗机构为主导、非公立医疗机构共同发展的多元办医格局。办医格局。康复、护理康复、护理等服务业快速增长。各类医疗卫生机构服务质量进一步提升。等服务业快速增长。各类医疗卫生机构服务质量进一步提升。国务院关于促进健康服务业发展的若干意见国务院关于促进健康服务业发展的若干意见67————健康管理与促进服务水平明显提高。健康管理与促进服务水平明显提高。中医医疗保健中医医疗保健、健康养老以及、健康养老以及健康体检健康体检、咨、咨询管理、询管理、体质测定体质测定、体育健身、医疗保健旅游等多样化健康服务得到较大发展。、体育健身、医疗保健旅游等多样化健康服务得到较大发展。————健康保险服务进一步完善。商业健康保险产品更加丰富，参保人数大幅增加，商健康保险服务进一步完善。商业健康保险产品更加丰富，参保人数大幅增加，商业健康保险支出占卫生总费用的比重大幅提高，形成较为完善的健康保险机制。业健康保险支出占卫生总费用的比重大幅提高，形成较为完善的健康保险机制。————健康服务相关支撑产业规模显著扩大。药品、医疗器械、康复辅助器具、保健用健康服务相关支撑产业规模显著扩大。药品、医疗器械、康复辅助器具、保健用品、健身产品等研发制造技术水平有较大提升，具有自主知识产权产品的市场占有率大幅品、健身产品等研发制造技术水平有较大提升，具有自主知识产权产品的市场占有率大幅提升，相关流通行业有序发展。提升，相关流通行业有序发展。————健康服务业发展环境不断优化。健康服务业政策和法规体系建立健全，行业规范健康服务业发展环境不断优化。健康服务业政策和法规体系建立健全，行业规范、标准更加科学完善，行业管理和监督更加有效，人民群众健康意识和素养明显提高，形、标准更加科学完善，行业管理和监督更加有效，人民群众健康意识和素养明显提高，形成全社会参与、支持健康服务业发展的良好环境。成全社会参与、支持健康服务业发展的良好环境。健康管理健康管理是以现代健康概念和中医“治未病”思想为指导，运用医学、健康管理是以现代健康概念和中医“治未病”思想为指导，运用医学、管理学等相关学科的理论、技术和方法，对个体或群体健康状况及影管理学等相关学科的理论、技术和方法，对个体或群体健康状况及影响健康的危险因素进行全面连续的响健康的危险因素进行全面连续的检测、评估和干预检测、评估和干预，实现以促进人，实现以促进人人健康为目标的新型医学服务过程。人健康为目标的新型医学服务过程。•《卫生行业职业技能培训教程：健康管理师》•2013年，卫生部人才交流服务中心健康健康亚健康亚健康高危高危早期临床早期临床症状症状疾病疾病健康信息健康信息收集收集健康管理实施路径69健康风险健康风险评估评估健康健康干预干预动态跟踪动态跟踪随访随访古为今用古为今用——传统与现代不谋而合传统与现代不谋而合70国家医学科技十二五发展规划重点任务国家医学科技十二五发展规划重点任务GWASGWAS项目推动－政府支持项目推动－政府支持722014/6/1913冠心病冠心病2012, 2012, 44:89044:890--44医科院阜外医院医科院阜外医院肝癌肝癌20102010, , 42:75542:755--88军事医学科学院军事医学科学院食道癌食道癌20112011, , 43:67943:679--8484医科院肿瘤医院医科院肿瘤医院冠心病冠心病20112011, , 43:34543:345--99华中科技大学华中科技大学肺癌2011, 2011, 43:79243:792--66南京医科大学南京医科大学胰腺癌胰腺癌20122012, , 44:6244:62--66医科院肿瘤医院医科院肿瘤医院非梗阻性无精症非梗阻性无精症2012, 2012, 44:18344:183--66南京医科大学南京医科大学大数据时代给疾病遗传研究带来的硕果大数据时代给疾病遗传研究带来的硕果医科院阜外医院医科院阜外医院军事医学科学院军事医学科学院医科院肿瘤医院医科院肿瘤医院华中科技大学华中科技大学南京医科大学南京医科大学医科院肿瘤医院医科院肿瘤医院南京医科大学南京医科大学青光眼青光眼2012, 44:11422012, 44:1142--4646北京同仁医院北京同仁医院食道癌食道癌2013, 45:6322013, 45:632--3838医科院肿瘤医院医科院肿瘤医院宫颈癌宫颈癌2013, 45:9182013, 45:918--2222同济医院同济医院先天性心脏病先天性心脏病2013, 45:8182013, 45:818--2121同济医院同济医院肺癌肺癌2012, 44:8952012, 44:895--99南京医科大学南京医科大学食道癌食道癌2012, 44:10902012, 44:1090--9797医科院肿瘤医院医科院肿瘤医院干燥综合症干燥综合症2013, 6 Oct, On line2013, 6 Oct, On line医科院协和医院医科院协和医院Genome-wideAssociationStudy,GWAS疾病风险评估－爱身谱疾病风险评估－爱身谱®®针对中国人群定制开发针对中国人群定制开发Risk Reduction through Modifiable Risk FactorsEx1Ex2Ex3Ex4Ex5Ex6Ex7Ex8TransaminaseonlyHBV(+)HBV(+)HCV(+)LifestyleimprovedHBV(+)HCV(+)NormaltransaminaseHBV(+)AbnormaltransaminaseHBV(-)LifestyleimprovedAbnormaltransaminaseHBV(-)NormaltransaminaseHCV(+)Age6060606060606060GendermalemalemalemalemalemalemalemaleAST(IU/L)6060606020606020AST(IU/L)6060606020606020ALT(IU/L)3030303020303020Smoking(Pack-yrs)101001010010DrinkingyesyesnoyesyesnoyesActivitynonoyesnonoyesno