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QPCR算法(相对定量,相对标准曲线法)

2021-09-25 2页 doc 14KB 516阅读

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QPCR算法(相对定量,相对标准曲线法)QPCR算法(相对定量,相对标准曲线法)算法:1待测样品Ct值-对照样品Ct值,2差值的取对数,3目的基因的对数除以内参基因的对数值。公式:RQ=AssayACTBTNF1-ACTB1-TNF2-ACTB2-TNF3.00sample116.2120.260.000.001.001.001.00sample218.3821.262.171.000.250.512.06sample315.1820.49-1.030.231.940.860.44sample4...
QPCR算法(相对定量,相对标准曲线法)
QPCR算法(相对定量,相对曲线法)算法:1待测样品Ct值-对照样品Ct值,2差值的取对数,3目的基因的对数除以内参基因的对数值。公式:RQ=AssayACTBTNF1-ACTB1-TNF2-ACTB2-TNF3.00sample116.2120.260.000.001.001.001.00sample218.3821.262.171.000.250.512.06sample315.1820.49-1.030.231.940.860.44sample418.3122.402.102.140.260.240.921待测样品Ct值-对照样品Ct值,对照样品为sample1,1-ACTB为减去样品sample1基因ACTB的Ct值(16.21),1-TNF为减去样品sample1基因TNF的Ct值(20.26)2差值的负数取对数,如ACTB扩增效率为90%,则取以1.9为底的对数,Excel函数为“=power(1.9,-0.00)”。TNF扩增效率为95%,则取以1.95为底的对数,Excel函数为“=power(1.95,-0.00)”。3以2-TNF除以2-ACTB。备注:1本算法应用范围,选择1个样品,2倍或5倍梯度稀释5个点,分别检测目的基因和内参基因的Ct值,取两者的差值拟合直线方程,如果直线方程的斜率的绝对值大于等于0.1,可以用该方法计算。如果小于0.1,也可以使用2-ΔΔCt法。2由于考虑不同引物之间的扩增效率,本方法比2-ΔΔCt法算出的结果更准确,如果需要比较不同基因之间的表达差异,可以参照本方法,建议使用绝对定量,计算不同基因的拷贝数,然后进行比较。
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