【doc】武汉汉族4个Y-STR基因座遗传多态性调查
武汉汉族4个Y-STR基因座遗传多态性调
查
皇堇生箜
武汉汉族4个Y.STR基因座遗传多态性调查
?
技术交流?
杨荣芝,钱水,黄代新,陈慧,余纯应,杨庆恩(华中科技大学同济医学院法医学系,武汉430030)
摘要:目的调查汉族人群DYS19,GATA—A10,GATA-A7.2和DYS~58Y染色体STR基因座的遗传多态
性.方法4,1PCR和PAGE技术对160例无关男性血样进行4个Y—STR基因座分型.结果4个Y—STR
基因座群体调查分别发现5,5,6和9个等位基因,基因座GD值分别为0.6365,0.6996,0.6377和0.8239.共
检出107种单倍型,单倍型GD值为0.9867.结论4个Y—STR基因座均具有较高的遗传多态性,在法医学个
人识别和亲子鉴定有实用价值.
关键词:STR;Y染色体;遗传多态性
中图分类号:DF795.2文献标识码:A文章编号:1008—3650(2005)ol
一0027-04
Astudyofgeneticpolymorphismsof4Ychromosomespecifics陬
lociinWuhanHanpopulation
YANGRong—zhi,QShui,HUANGDai—xin,atal(TongiMedicalCollegeo
fHuazhongUniversityofScienceand一
nology,Wuhan430030,China)
AB!RACr:ObjectiveTostudythegeneticpolymorphismsofDYS19,GATA-A10,GATA-A7.2andDYX458Ychrom~ome
specificRTRlociinWuhanHanpopulation.MethodsTheDNAextractedfrombloodsamplesofunrelatedmeninHanpopulationliving
inWuhanwereamplifiedbyPCR.ThePCRproductswereanalyzedusingPAGE.Results5,5,6and9alldesweredetectedinDYS19,
GATA-A10,GATA-A7.2andDYs4584Y—SIRlocirespectivelyinHanpop
ulation.Geneticdiversityvalueforthe4was0.6365,
0.6996,0.6377and0.8239respectively.Total107haplotypesmuldbeidentified,ThehaplotypeGDofthe4Y-SIRwas0.9867.Con-
dusionThe4Y-specificSIRlociarehighlypolymorphicandaresuitableforindividualidentificationandpaternitytesting,
KEY?
lRDS:Shorttandemrepeat(SIR);Ychromosome;Geneticpolymorphism
Y染色体短串联重复,序列是一类呈父系遗传的
多态性标记,在人类起源的研究,法医学个人识别,如
父系亲缘关系鉴定;男女混合成分的男性成分的检测
及多个男性混合成的同一性认定的鉴定等有重要的
应用价值[1--5].但与常染色体的STR相比较,Y染
色体上的STR数目较少,多态性相对较低.本文从
GDB中筛选4个Y染色体特异的STR基因座,调查
其在武汉地区汉族人群的遗传多态性,对其在法医学
中的应用价值进行初步探讨.
1材料与方法
1.1实验材料
武汉地区汉族160例无关男性个体枸橼酸钠抗
凝血,取自武汉同济医院血库和本室检验案例男性血
样.
1.2引物序列
DYS19,GATA—A10,GATA—A7.2和D84个
作者简介:杨荣芝(1962一)男,湖北潜江市人.主管技师,主
要从事法医物证检验工作.Td:(027)83692645
E-maihygen@mails.tjmu.edu.cn
基因座引物序列摘自数据库(GenomeDatabase,
GDB)资料,由佳力生物有限公司合成,引物序列及其
相关资料见表1.
1.3DI提取和扩增
Chelex-100法提取基因组DNA.PCR扩增条件
参见参考文献[.
1.4PCR产物的分离与检测
4个Y—STR基因座的扩增产物用非变性PAG(T
=6%C=5%)电泳分离,银染显示电泳结果.参照
等位基因梯阶对照,命名等位基因.
1.5等位基因梯阶的制备及结果判断
筛选不同基因分型的样本进行扩增,将扩增产物
混合作为等位基因分型梯阶对照
(allelicladder).
每个基因座取2个等位基因进行测序,确定等位基因
中主型及其重复次数.按照重复次数命名等位基因.
1.6结果判断及数据处理
等位基因检出频率用直接计数法,遗传差异度值
按公式GD=1一?Pi2(Pi为等位基因频率)计算[.
2结果
武汉地区160例汉族DYS19,GATA—A10,GA一
?
27?
TA-A7.2和DYS458四个Y染色体基因座的多态性因(见图1--4),均具有较高的多态性.
调查显示(见表2,3),分别发现5,5,6和9个等位基
表1DYS19,GATA-A10,GATA-A7.2和DYS458基因座相关资料
表24个Y-STR基因座的等位基因频率和GD值(n=160)
表3武汉汉族男性DYS19,GATA-A10,GATA-A7.2和DYS458基因座单倍型频率(n=160)
?
28?
续表3
注:单倍型GD值=0.9867
Ll7l6l5l4l3LL2322212019L
图1DYS19等位基因分型图2GAIA—A10等位基因分型
L17I6I5I41312LL2120I9I8I7I6151413L
图3GAIA—A7.2等位基因分型图4DYS458等位基因分型
3讨论
人类Y染色体属近端着丝粒染色体,由长臂Yq
和微小的短臂Yp组成,DNA长度约60Mb.Y染色
体两端各有一小部分称拟常染色区(pseudoautosomal
region),在减数分裂过程中,拟常染区可与X染色体
的相应区段进行交换,重组.其余大部分为Y一特异
性区,为非重组区,所有Y—STR基因座之间存在遗传
连锁的关系,基因频率均视作单倍型频率.Y—DNA
中STR基因座是重要的遗传标记.目前大约发现有
55个Y—STR.
Y—STR有父系遗传特征,只能由父亲传递给儿
子.同一父系的成员中Y-STR基因型是一致的,这
在父系亲源关系鉴定有实用价值.本文案例是利用
父系亲缘关系成员的Y—STR具有共同单倍体型特
征,作为认定叔侄关系的旁证.通过Y—STR单倍型
分析,可进行父子,同胞兄弟,同父异母兄弟,叔侄,祖
孙等父系同代或隔代的亲缘关系鉴定.
由于Y一特异性区遗传标记之间存在遗传连锁的
关系,评估Y—STR基因座鉴别能力的指标采用遗传
差异度(geneticdiversity,GD).GD=1一?p2(P指
等位基因频率).GD值即该Y—STR基因座的个体识
别能力Dp值,数值也等于该座位的非父排除率
(PE).单个Y—STR基因座上,等位基因越多,GD值
?
29?
越高.但是从单个座位看,遗传差异度有限,本文调
查160份男性血样的4个座位的GD值在0.6365,
0.8239范围,共检出107种单倍型,单倍型基因座多
样性为0.9867,具有较高的个体识别能力.
与常染色体STR类似,Y—STR等位基因片段长
度多在400bp以下,检测灵敏度高,扩增稳定,能够准
确分型,可重复性好.因此,Y—STR逐渐在法医鉴定
中普遍应用.
本文研究调查4个Y—STR个体识别率高,PAGE
谱带清楚,分型准确.为法医学个人识别及亲权鉴定
中常规STR检测提供了辅助检测手段,有较好的应
用价值.
4案例应用
2003年11月,安徽省某市法院委托本实验室做
一
亲子鉴定.被鉴定人可疑父亲陈某已去逝,陈某包
养的”二奶”范某所生的儿子陈某某要求继承陈某遗
产,家系情况见图5.对陈某某和陈某的弟弟进行Y—
STR位点检测,本文研究的4个和另外6个Y—STR
的基因型均相同.结合我室32个常染色体STR位
点检测结果.认定陈某某与陈某弟弟是叔侄关系.
参考文献:
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图5陈某家系图
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收稿日期:2004—10—21
?
案例分析?
陈梅梅(江苏省张家港市公安局刑警大队,215600)
关键词:眼部钝挫伤;眶内壁骨折;眼部cr;法医学检验
中图分类号:DF795.4文献标识码:C
文章编号:1008—3650(2005)01—0030—01
1案例简介
在基层法医I临床检验中,被他人用拳击伤眼部的事件较
为多见.眼部损伤多简单地表现为眶周青紫,肿胀等眼钝挫
伤表现,短时间内能恢复正常,办案人员多不引起重视.但
是,笔者作为一名基层法医工作者,却认为眼部钝挫伤应详细
检验.在2002年11月至2003年10月的法医工作中,笔者接
到的涉及眼部钝挫伤的检案共有20例,其中伤者配合检验,
遵嘱做眼部cr检查,确证眼眶内侧壁骨折的案例有10例.
在此20例检案中,全部伤者均有视物不清,眼睑青紫肿
胀等眼钝挫伤的临床症状和体征,均角膜明,前房清,眼底未
检见异常,临床诊断为眼钝挫伤.经法医建议,作cr检查的
?
30?
检案13例,确证眼眶内侧壁骨折的10例,阳性率占眼部钝挫
伤的50%.其中:合并鼻腔出血者三例,合并筛窦积液者三例,
合并内直肌受累及复视者五例.另有7例检案伤者不合作,
眶壁骨折情况不祥.
2讨论
眼眶位于颅面中央垂直线两侧,由额骨,颧骨,上颌骨,泪
骨,筛骨,蝶骨和腭骨七块骨构成.其中眶内侧壁呈长方形,
与正中面平行,由4块骨构成.额骨角突与泪骨构成前部及
泪囊窝,中部占内壁最大部分的是筛骨纸板,厚0.2,0.4mm,
后部小块为蝶骨.由于眼眶位于颅面中央向前突起,容易遭
受外力打击,如常见的拳头正面打击眼部,可使眶内压力突然
升高,外力借液压传导至眶壁,致眶部最薄弱的骨性结构即眶
内侧壁中部发生骨折.眶内侧前面与泪囊和鼻腔为邻,中间
大部分与筛窦相接,眶内侧壁最易发生与筛窦和鼻腔相通的
骨折,在临床上表现为眶外伤后鼻出血及筛窦积液.在法医
临床检验中,眼部受到外力打击所致的外伤各不相同,其临床
表现和体征有很大的差异.部分病例外伤后仅表现为眼睑水
肿,眶周血肿和瘀斑,颜面部肿胀等软组织钝挫伤的临床表
现,由筛骨和上颌骨骨折导致的眶外伤后鼻出(下转第60页)