324红外谱图数据库

3.2.4红外谱图数据库.3.2.4红外谱图数据库.PAGE/NUMPAGES3.2.4红外谱图数据库.3.2.4.红外谱图数据库服务介绍：本数据用户能够在数据库中检索指定化合物的谱图，也能够依据谱图/谱峰数据检索相像的谱图，以辅助进行谱图判定。用户能够经过IE阅读器显示谱图，特别提示：用户阅读器请勿禁用javaapplet功能，不然可能致使谱图不可以正常显示。名词与观点：谱峰般配2张谱图上的2个特点峰进行比较，谱峰的数据差别（包含谱峰位置、谱峰透过率、半峰宽、峰差）均在可允许偏差范围以内，则系统以为这2个谱图上的2个谱峰属于般配关系。该偏差可由用户指定。如图3.2.4.1所示，谱峰a与谱峰1般配，而谱峰b和谱峰2不般配。40604020图3.2.4.1谱峰般配示图相像谱图如2张谱图的特点峰都逐个般配，或有未能般配的谱峰也在用户指定的允许范围以内，则系统以为两张谱图相互相像。未能般配的谱峰越少，般配谱峰的数据差别越小，则谱图相像度越高。图3.2.4.2所示的2张谱图，谱峰a与1般配，谱峰b与2般配，则我们以为这2张谱图相互相像。4020图3.2.4.2谱图相像表示图谱图分类指谱图/化合物用途的分类，拜见数据库介绍部分。同一个化合物可能拥有多个红外谱图，其谱图差别也可能很大。比如乙醇的气相谱和谱就很不相像，谱图可见图3.2.4.32和图。3.2.4.1相像谱图检索——输入谱峰检索基来源理用户输入某个谱图的特点谱峰数据，并指定数中谱图与输入的发问谱图的最低相像度、允许偏差范围等参数。系统依据这些参数，先进行初步挑选，获取候选红外谱图，而后将用户的发问谱数据与数据库中的全部候选红外谱图的特点谱峰数据进行逐个比较，找到与用户发问谱图相像的谱图，并将结果依据相像度递减次序摆列供用户比较。第一步：谱峰数据输入输入的用户发问谱图的每个特点谱峰数据都包含4项，谱峰地点、谱峰透过率、峰宽、峰差。系统老是假设用户发问谱图采纳透过率T来表示。峰宽是指谱峰的半峰宽。峰差是指谱峰的深度，本系统使用峰的极点投射到两翼最高点连线上的距离作为峰差，如图3.2.4.3所示。峰差特别小的谱峰，在检索过程中将被自动过滤。峰差(%半峰宽(cm-1图3.2.4.3谱峰的峰差与峰宽的表示图用户能够手动将发问谱图上的特点谱峰的数据，输入到表格中。请注意，每个谱峰都要有4项数据，不然被视为不完好的输入。如图3.2.4.4所示。假如谱峰超过10个，可点击图3.2.4.4中的左下角的按钮，翻开更多的谱峰输入界面。如图图3.2.4.4谱峰数据输入表示图图更多谱峰数据输入表示图第二步：检索参数选择谱峰数据输入达成后，即进入检索参数选择的页面。如图3.2.4.4和图3.2.4.5所示。页面的第一部分是输入谱峰的列表，供用户校订数据。每个谱峰后边有“不行丢掉”选项，勾选此选项，则要求检索命中的谱图中一定含有此特点峰，不包含这种特点峰的谱图，即便其余谱峰都能般配，系统也不会以为它是合格的候选谱图。假如用户不设定任何一个谱峰为不行丢掉，则系统以为任何单个峰没有般配时，都不影响候选谱图的挑选。图3.2.4.4检索参数选择(1图3.2.4.5检索参数选择(2谱图般配模式，是指谱图挑选过程中般配候选谱图的模式，单项选择，有3种模式能够选择：强峰般配、官能团般配、全峰般配。因为红外谱图的曲线上存在很多大小不一样的谱峰，部分特别轻微的峰往常不用来作为判定的依据，一般只察看比较强的特点谱峰，所以强峰般配在谱图挑选过程中只观察谱图的强峰，只需谱图的强峰索引与输入的发问谱图的强峰索引般配，则将此谱图作为候选谱图。官能团般配是将输入谱峰的数据依据红外分析的规律，判断该谱图对应的官能团，生成官能团索引，系统依据官能团索引挑选出候选谱图。全峰般配跟强峰般配的差别在于全峰般配挑选过程将观察全部谱峰。一般状况下，系统默认选择强峰般配模式，能够迅速检索出结果，如选择全峰般配模式则需要较长时间。官能团般配模式是与强峰般配模式同时进行的，对谱峰数据要求比较苛刻，检索命中率不如强峰般配模式。谱峰般配参数谱图挑选过程中，判断谱峰能否般配的参数，可多项选择。系统默认依据峰值（谱峰地点+透过率）来判断，如2个谱峰的谱峰地点的差距、透过率的差距都在允许偏差以内，则以为这2个谱峰般配。如还选择了其余谱峰般配参数，比如峰宽，那么判断谱峰般配的标准还要加上峰宽的差距在允许偏差以内。全部数据间都是AND关系，即任一个数据的差距超出允许偏差，就以为这2个谱峰不可以般配。谱图检索结果的重要指标就是谱图相像度，任何2个谱图的相像度都在0%到100%之间。用户指定同意的最低谱图相像度，只有与发问谱图相像度等于或高于用户指定相像度的谱图才是命中的目标谱图。考虑到试验偏差等要素，有些用户能够接受检索命中的目标谱图的谱峰多于或少于比发问谱图的谱峰。这种状况能够用命中谱图的特点峰多于发问谱图（谱峰冗余率），或许少于发问谱图（谱峰丢掉率）来表示。明显，谱峰丢掉率和谱峰冗余率越高，初筛获取候选谱图越多，检索结果的噪音也越大。可是这2个参数太小，也可能会丢掉一些实用的结果。系统缺省值为30%，用户能够依据自己的状况适合调整。谱图权重谱图权重就是候选谱图与发问谱图比较的时候，强峰、中峰、弱峰和指纹区的谱峰对谱图相像度的权重影响。权重越大，越能表现出这部分谱峰对谱图相像度的影响。明显，设置不一样的权重值，最后计算获取谱图相像度的数值也会不一样。tips:显出某些谱图特点。谱峰分级前面已经说到强峰和中峰、弱峰对谱图相像度的影响是不同样的。每个用户关于强峰的观点也不同样，可在此设置强峰下限与中峰下限。透过率<=强峰下限的谱峰就是强峰，强峰<透过率<=中峰下限的谱峰就是中峰，透过率>中峰下限的就是弱峰。允许偏差范围是用户关于谱峰般配设置的重要参数。只有2个谱峰的各项数据差距在允许偏差范围以内，才被以为是般配的。第三步：检索结果列表查察检索结果依据相像度递减的次序列表，用户能够点击查察谱图的连结查察谱图，也能够点击谱峰列表查察该谱图的峰数据，方便与发问谱图比较。图3.2.4.6检索结果列表图3.2.4.7查察命中谱图与其化合物构造把鼠标挪动到红外谱图上的峰上，能够在窗口下方的状态栏查察谱图上的对应坐标。谱图的三个按钮图3.2.4.8命中谱图的谱峰列表3.2.4.2相像谱图检索——上载谱图文件检索基来源理本部分与3.2.4.1的差别仅在于发问谱图的数据提交方式不一样。用户第一将原始谱图的数据文件（如prn格式等）变换成本系统指定的谱图文件格式(nyy格式，而后上传nyy文件。系统会依据用户设定的取峰参数对用户nyy文件进行剖析，获取发问谱图的谱峰数据。用户可指定待命中的谱图与输入的发问谱图的最低相像度、允许偏差范围等参数。系统依据这些参数，先进行初步挑选，获取候选红外谱图，而后把用户输入的数据与数据库中的全部候选红外谱图的特点谱峰数据进行逐个比较，找到与用户输入谱图相像的谱图，并将结果依据相像度递减次序摆列供用户比较。第一步：谱图文件的数据格式变换本系统接受的谱图数据文件为自定义的nyy格式。用户使用本服务，需要先将原始的谱图文件变换成nyy格式。nyy文件的大小均为7602个字节，可依据这一点初步确认文件变换成功。本系统供给prn格式和asc格式对nyy的变换工具，请在以下地点下载变换工具：windows版prn变换成nyy的工具：dos版prn变换成nyy的工具：dos版asc变换成nyy的工具：变换工具下载达成以后，先解压缩到当地硬盘。分别获取prn2nyy_win.exe,prn2nyy.exe和asc2nyy.exe.本工具合用的prn文件格式以下表所示，第一列为波数（cm-1）,第二列为透过率(%：75.949409表3.2.4.1prn文件格式1.windows下变换工具prn2nyy_win.exe的使用双击prn2nyy_win.exe即可翻开如图3.2.4.9的对话框，输入prn文件的路径，并指定要生成的nyy文件的储藏路径与名称。点击变换成nyynyy文件。nyy文件名如不存在，会自动创立；如已经存在，则会覆盖原有文件。图3.2.4.9用prn2nyy_win.exe变换成nyy2.dos下变换工具prn2nyy.exe的使用图3.2.4.10用prn2nyy.exe变换成nyy将需要办理的目标文件*.prn与prn2nyy.exe放在同一个目录下.启动dos,进入该目录,输入prn2nyy*.prn。回车确认即可履行prn2nyy.exe,获取*.nyy文件,可供检索使用.操作步骤与输入的命令以下图。3.dos下变换工具asc2nyy.exe的使用图3.2.4.11用prn2nyy.exe变换成nyy操作过程与prn2nyy.exe相像.进入工作目录后，输入asc2nyy*.asc，回车确认即可履行asc2nyy.exe,获取*.nyy文件,可供检索使用.以下图。第二步：谱图文件的上传与取峰系统读取用户上传的nyy文件，对谱峰曲线进行逐点扫描，依据谱图的曲线变化获取谱峰及各项数据。先选择需要检索的nyy文件，以下图。图3.2.4.12选择nyy文件图3.2.4.13谱图文件上传与取峰参数设置选择文件以后，先要设定取峰参数。用于取峰的参数有：基线、取峰上限、最小峰差、零线校订，如图3.2.4.13所示。其含义分别是：基线BaseLineHeightofIRSpectrum(%：系统在取峰时要先对谱峰曲线进行扫描，透过率大于基线的点不在扫描范围以内。所以，那些透过率比基线更高的曲线变化不会被纪录，系统也不会计算该段曲线能否有谱峰存在。取峰上限UpperLimitofPeakTransmittance(%：扫描曲线获取的谱峰，只有其透过率在取峰上限以下才会被当作有效的谱峰。取峰上限的值不超出基线值。比如，系统默认谱图的取峰基线为85%，取峰上限为70%。那么那些透过率超出85%的点将不会被扫描到，而忽视详细的谱图形状。在85%以下可能有2个谱峰，其透过率分别是71%和69%，在本例中将只取透过率为69%的谱峰，而另一个谱峰（透过率71%）则被忽视。最小峰差MinimumDifferentiationofPeak(%：谱图的曲线上老是有一些不够光滑的轻微的颠簸，此中有相当一部分是仪器的噪音。考虑到红外光谱图的实质应用，系统设置了最小峰差，只有某个波的峰差大于最小峰差的时候，系统才会以为曲线上的一个波是一个真实意义上的谱峰。那些峰差不够大的波将被以为没存心义。不一样的最小峰差值，决定了某些峰能否会被作为存心义的谱峰而被抓拿出来，同时也会影响到其余一些峰的峰数据。零线校订ZeroErrorofIRSpectrum(cm-1：零线校订是为了校订谱图因为丈量仪器产生的整体红移/蓝移的偏差。正当表示蓝移，负值表示红移，零表示该谱图无需校订。第三步：谱峰数据校订与检索参数选择过程，并进入第三步。页面的第一部分是输入谱峰的列表，供用户校订数据。假如用户发现系统列出的谱峰数据不切合需求，可返回上一页从头设定取峰参数。如图。图3.2.4.14检索参数选择本部分的参数含义与上一节的完好同样。独一有区其余是，图按钮，点击可弹出窗口，显示出用户上载的发问谱图的形状。以下图。图3.2.4.15用户上载的发问谱图用户能够点击谱图上方的，图中点击图3.2.4.16用户上载的发问谱图（吸光率模式）除此以外，用户还能够经过1452，点击如图3.2.4.17所示。图中点击Transmittance按钮即可恢复全图显示。图3.2.4.17用户上载的发问谱图（放全局部）第四步：检索结果列表查察），获取检索结果，内容与上一节相像,见图。能够将检索命中的谱图与发问谱图比较，如图。图3.2.4.18命中的谱图结果列表（部分）图3.2.4.19检索命中目标谱图与发问谱图比较3.2.4.3化合物检索基来源理用户输入化合物的英文名称，或许CAS号，或许分子式，选择精准检索或许模糊检索。系统依据用户输入的重点词检索该化合物的红外谱图并列表显示。输入化合物的名称用户可输入化合物的重点词，比如英文名称的精准检索如图，表示检索化合物名称为“chalcone字”符串的化合物的谱图，检索结果如图。图3.2.4.20化合物名称的精准检索图3.2.4.21化合物名称的精准检索的结果用户也可输入化合物的名称进行模糊检索，如图和图。例1输入“chalcone表”示检索所出名称中含有“chalcone字”符串的化合物的谱图，例2输入“%oxychalcone表”示检索名称以“oxychalcone字”符串结束的化合物的谱图。检索结果分别如图和图3.2.4.25所示。提示：如检索命中结果超出100条谱图纪录，则只显示前面100条纪录。图3.2.4.22化合物名称的模糊检索(例1图3.2.4.23化合物名称的模糊检索(例2图3.2.4.24化合物名称的模糊检索结果(例1图3.2.4.25化合物名称的模糊检索结果(例2输入化合物的CAS号输入CAS号，有无短划线均可，比如“94-41-7”或许“94417，”分别如图3.2.4.26和图所示。这两种输入的检索结果同样，见图。图3.2.4.26CAS号的输入(例1图3.2.4.27CAS号的输入(例2图3.2.4.28CAS号的检索结果输入化合物的分子式输入化合物的分子式（化学元素符号按C、H次序，其余元素按字母次序排列）。为方便查问时的输入操作，输入元素符号不划分大小写，数字不考虑上下标。拜见图（例1）和图（例2），两个输入的意义完好同样。分子式也能够进行模糊检索，输入的界面如图（例3），检索结果见图。图3.2.4.28分子式的输入(例1图3.2.4.29分子式的输入(例2图3.2.4.30分子式的模糊检索(例3图3.2.4.31分子式的模糊检索结果(例3在化合物检索的结果列表中，能够看到化合物的名称、分子式、CAS号和谱图分类。一个化合物可能在不一样的谱图分类中有多个谱图，也可能在同一个分类中有多个谱图。不一样分类的谱图的形状可能差别较大，即使是同一个分类的不一样谱图，可能也会有较大差别，用户使用时候请务必注意。图所示的例3中，CAS号64-17-5且分子式C2H6O对应的都是同一个化合物，乙醇EthylAlcohol，共有从第3条到第7条共5条记录。假如选用列表中的第5条纪录和第7条纪录查察，分别如图和图所示。图3.2.4.32例3中检索结果的第5条纪录图3.2.4.33例3中检索结果的第7条纪录3.2.4.4用户常有问题与解决问：本系统只接受化合物的英文名称检索，那只有中文名称的化合物怎么检索它的红外谱图？答：请先在左侧的化学工作辅助工具栏目里选择化合物名称中英互译，将中文名称译成英文名称，而后再检索。名称翻译工具的使用请见图和。图3.2.4.34化合物名称输入图3.2.4.35化合物中文名称翻译成英文名称问：假如只有化合物的构造，没出名称与CAS号，怎么检索它的红外谱图？答：有2种方法。第1种：先经过化学工作辅助工具栏里的化合物构造变换成名称成名称并获取该化合物的分子式，见图3.2.4.36和。用户即可用生成的名字来检索红外谱图。特别要，本工具生成的名字都是IUPAC命名，而红外谱图数据库使用的名字相当一部分是通用的俗名。假如用系统命名的名字检索不到结果，用户能够试试用分子式检索。图3.2.4.36输入化合物构造图3.2.4.37获取化合物的中英文名称与分子式除了上述的方法，还有第2种方法：1请选择“化合物综合检索”，选择“化合物构造检索”，如图3.2.4.38所示。所示。所示。点击化合物名称的链接，即可进入化合物属性和更多信息的页面。如图3.2.4.41所示。在图中最下方，更多信息的项目里，能够看到红外光谱的链接。全部化合物的信息里，出现某个链接项目就表示该化合物拥有该属性的数据。点击红外光谱的链接，即可检索到该化合物全部的红外谱图。如图。点击查察谱图，就能够显示对应谱图，如图3.2.4.43所示。图3.2.4.38进入化合物综合检索图3.2.4.39输入化合物构造图3.2.4.40化合物构造检索结果列表图3.2.4.41化合物属性与更多信息图3.2.4.42化合物的红外谱图列表图3.2.4.43化合物的红外谱图58