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12贵州畜牧兽医2009年第33卷第1期
(图2).从图中显示的拓补结构
明马头山羊品种(群体)
可分为2个支系即支系A(LineageA)和支系B(LineageB),
支系A包括MTG1,MTG2,MTG3,MTG6,MTG7,MTG9,
MTG10,MTG11,MTG12,MTG18,MTG19,MTG20;支系B包括
MTG14,MTG15,MTG16,MTGI7.
图2基于马头山羊Cytb基因构建的邻接树(NJTree)
3讨论
3.1马头山羊线粒体Cytb基因遗传多态性我国山羊在地
理上分布广泛,在不同的生态环境下形成了丰富的地方品种,
养殖方式长期以零星散养为主.人为干预较少,再加上民间的
品种交流,导致我国的地方品种大多表现出遗传多态性.刘
若余(20o6)对13个家山羊品种183个个体mtDNA控制区序
列的测定显示,中国山羊品种具有很高的遗传多样性.
本文通过对马头山羊线粒体Cytb基因序列的
,在
l6个样本上就观察到8个变异位点,6种单倍型,单倍型多
样度为0.808,核苷酸多样度为0.00243.对于编码重要功
能蛋白质的线粒体Cytb基因来说,由于在DNA水平上受自
然选择压力的影响,密码子第3位点的突变率高于第l和第
2位点,而且密码子第3位点的突变绝大多数是同义突变,受
自然选择压力较小,突变后易固定,第1,第2位点则相反.
对本次所测定的序列分析表明,群体的一个显着特点就是转
换率较高,在8个变异位点中T—C间的转换发生了23次,
其中的5次突变发生在密码子的第1位,(4次发生在721位
点,为同义突变;1次发生在361位点,为非同义突变);其余
都发生在密码子的第2位点,均表现为同义突变.T—G间
的颠换观察到11次,均为发生在密码子第2位点的同义突
变.从以上可以看出该群体核苷酸的变异替换主要以转换
为主,转换多于颠换,表现出较高的转换偏倚.
3.2马头山羊的起源进化mtDNA的研究已成为分析家畜
系统发育的理想模式,在探讨品种起源及分化,种间的系统
演化,种内母系演化,地方品种资源与地理分布的关系等方
面有广泛的应用.已经证实,Cytb基因序列在解决亲缘
关系很近的阶元间的系统关系方面非常有用,被认为是解决
系统发育问题最可信的mtDNA标记之一l.在本研究获
得的邻接树(NJTree)拓补结构来看,马头山羊品种(群体)
可分为两个支系,即支系A(75%,12/16)和支系B(25%,
4/16).该结果与刘若余等”通过对山羊的线粒体DNA
D—loop~全序列研究提出的中国家山羊主要存在两个母系
起源,其中支系A占多数达70%以上的结论一致.
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