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GBT 26436-2010 禽白血病诊断技术

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GBT 26436-2010 禽白血病诊断技术 ICS11.220 B41 园亘 中华人民共和国国家标准 GB/T26436—2010 2011-01-14发布 禽白血病诊断技术 Diagnostictechniquesforavianleukosis 2011-07-01实施 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局学寿 中国国家标准化管理委员会况111 前 言 GB/T26436—201 0 本标准的附录A、附录B、附录C、附录D、附录E、附录F为规范性附录,附录G、附录H为资料性 附录。 本标准由中华人民共和国农业部提出。 本标准由全国...
GBT 26436-2010 禽白血病诊断技术
ICS11.220 B41 园亘 中华人民共和国国家 GB/T26436—2010 2011-01-14发布 禽白血病诊断技术 Diagnostictechniquesforavianleukosis 2011-07-01实施 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局学寿 中国国家标准化管理委员会况111 前 言 GB/T26436—201 0 本标准的附录A、附录B、附录C、附录D、附录E、附录F为规范性附录,附录G、附录H为资料性 附录。 本标准由中华人民共和国农业部提出。 本标准由全国动物防疫标准化技术委员会(SC/TC181)归口。 本标准起草单位:山东农业大学、中华人民共和国珠海出入境检验检疫局、华南农业大学。 本标准主要起草人:崔治中、孙淑红、赵鹏、杨素、沙才华、廖明、曹伟胜。 GB/T26436--2010 引 言 禽白血病病毒(avianleukosisviruses;ALV)为反转录病毒科的n反转录病毒属,可诱发鸡不同组 织的良性和恶性肿瘤,是鸡群中除马立克氏病病毒(MDV)和禽网状内皮增生症病毒(REV)外的又一 类重要的致肿瘤病毒。 禽白血病是一类由ALV相关的反转录病毒引起鸡的不同组织良性和恶性肿瘤病的总称。随发生 肿瘤的主要细胞成分不同,分别称之为不同名称的肿瘤。ALv可分为A~J10个亚群,其中仅A亚 群、B亚群、c亚群、D亚群、E亚群、J亚群病毒与鸡相关。A亚群、B亚群、C亚群、D亚群、J亚群属外 源性ALV,与禽白血病的不同类型肿瘤发病相关。E亚群病毒基因组可完整地整合进感染鸡的染色体 基因组并稳定地遗传下去,也可从中再复制出传染性病毒颗粒,因而称之为内源性病毒。此外,在一些 鸡的染色体的不同部位,还可能带有一些ALV的基因组片段。E亚群ALv的致病性很低或没有致病 性,不属于净化对象,但很多鸡群中包括一些无特定病原(SPF)鸡群都可能带有E亚群内源性ALv,它 的感染不会给鸡群带来不良影响,但会干扰检测。 目前,该病对我国养鸡业的危害很大。在国际种禽贸易中,外源性白血病病毒感染是最主要的检测 对象之一。 Ⅱ 1范围 禽白血病诊断技术 本标准规定了病料中ALV特异血清抗体和外源性ALV的检测方法。 本标准适用于判断鸡群或病料中是否有外源性ALV感染。 2临床症状和病理变化 GB/T26436—201 0 ALv主要引起感染鸡在性成熟前后发生肿瘤死亡,感染率和发病死亡率高低不等,死亡率最高可 达20%。一些鸡感染后虽不发生肿瘤,但可造成产蛋性能下降甚至免疫抑制。 淋巴样白血病是最为常见的经典型白血病肿瘤,肿瘤可见于肝、脾、法氏囊、肾、肺、性腺、心、骨髓等 器官组织,肿瘤可表现为较大的结节状(块状或米粒状),或弥漫性分布细小结节。肿瘤结节的大小和数 量差异很大,表面平滑,切开后呈灰白色至奶酪色,但很少有坏死区。在成红细胞性白血病、成髓性细胞 白血病、髓细胞白血病中,多使肝、脾、肾呈弥漫性增大。J亚群ALV感染主要诱发髓细胞样肿瘤,它最 常见的特征性变化主要为肝脾肿大或布满无数的针尖、针头大小的白色增生性肿瘤结节。在一些病例 中,还可能在胸骨和肋骨表面出现肿瘤结节。 单纯苏木精伊红染色(H.E染色)的病理组织切片观察在诊断上有一定参考意义。在表现为淋巴 样细胞肿瘤结节时,要注意与马立克氏病病毒(MDV)和禽网状内皮增生症病毒(REV)诱发的肿瘤相 区别;在表现为髓样细胞瘤时,既要与REV诱发的类似肿瘤细胞相区别,也要与嗜中性白细胞浸润性 炎症相区别,如鸡戊型肝炎病毒感染引起的肝局部炎症。最终的鉴别诊断以肿瘤组织中的病毒抗原检 测或病毒分离鉴定为最可靠依据。 3病毒的分离培养、检测和鉴定 3.1试剂和仪器 3.1.1试剂 DMEM液体培养基(pH7.2)、0.25%胰酶、磷酸盐缓冲液(o.01mol/LPBS,pH7.2)、抽提缓冲液、 青霉素(10万u/mL)、链霉素(10万U/mL)、抗ALV单抗、抗ALV单因子鸡血清、异硫氰酸荧光素 (FITC)标记的山羊抗小鼠IgG抗体、ALV-p27抗原酶联免疫吸附试验(ELIsA)检测试剂盒、聚合酶链 反应(PCR)试剂、RT-PCR试剂、生理盐水(0.9%氯化钠)、无水乙醇(分析纯)、丙酮(分析纯)、甘油(分 析纯)、75%酒精、碘酒、细胞生长液(含有5%胎牛血清或小牛血清的DMEM液体培养基)、细胞维持液 (含有1%胎牛血清或小牛血清的DMEM液体培养基)、大肠杆菌(TGl)、蛋白酶K、70%冷乙醇、乙酸 钠(分析纯)、三氯甲烷(分析纯)、异戊醇(分析纯)、异丙醇(分析纯)、10×加样缓冲液、琼脂糖、DL2000 DNAMarker、TAE电泳缓冲液、氯化钙(o.1mol/L)、氨苄青霉素(100/-g/tLL)、双蒸水、LB液体培养 基、TE缓冲液、RNase、细胞裂解液、0.1%的DEPC(焦碳酸乙二酯)水等(除特殊说明外,上述试剂均为 分析纯)。 3.1.2仪器 锥形瓶、荧光显微镜、恒温培养箱,冰冻台式离心机(≥12000r/min)、一20℃冰箱、一80℃冰箱、 1 GB/T26436—2010 Eppendorf管(离心管)、棉棒、载玻片、盖玻片、细胞培养平皿、37℃数显恒温水浴锅、37℃摇床、96孔 培养板、SPF隔离器、紫外光凝胶成像分析仪、微量移液器、低温恒温水槽(16℃)、吸水纸。 3.2分离病毒用细胞 3.2.1鸡胚成纤维细胞(CEF) 鸡胚成纤维细胞制备方法见附录A。 3.2.2鸡胚成纤维细胞自发永生株(DFl)细胞 DFl细胞培养基制备方法见附录B。 3.3病料的采集与处理 3.3.1全血、血清或血浆 取疑似病鸡的全血、带有白血细胞的血浆或血清,无菌接种于长成单层的CEF或DFl,置于含5% 二氧化碳的37℃恒温培养箱中培养。 3.3.2脏器 采集疑似病鸡的脾脏、肝脏、肾脏,按脏器质量的1倍~2倍加入灭菌生理盐水(含青霉素和链霉素 各1000Iu/mL)研磨,直至成匀浆液。将悬液移至离心管中充分摇振后,4℃,10000r/rnin离心 5min,收集上清液。按3.4.1.1中的方法接种培养或一70℃保存备用。 3.3.3疫苗样品 疫苗样品处理后接种CEF培养扩增病毒。但为了鉴别是否是外源性ALV,应接种DFl细胞或其 他抗E亚群自血病鸡细胞(C/E)鸡来源的细胞。 3.3.4咽喉、泄殖腔棉拭子 取咽喉棉拭子时,将棉拭子深入喉头口及上颚裂来回刮3次~5次取咽喉分泌液;取泄殖腔棉拭子 时,将棉拭子深入泄殖腔转3圈并沾取少量粪便;将棉拭子头一并放人盛有1.5mL磷酸盐缓冲液的无 菌离心管中(含青霉素和链霉素各1000Iu/mL),盖上管盖并编号,10000r/rain离心5rain后取上清 备用。 3.4病毒的分离培养与鉴定 3.4.1病毒的分离培养 3.4.1.1接种培养:病料接种细胞单层后,置于37℃培养箱中培养2h。然后吸去细胞生长液,换入细 胞维持液,继续培养5d~7d。 3.4.1.2细胞传代:将3.4.1_1培养的细胞传代于加有盖玻片的平皿中,培养5d~7d。 3.4.2病毒的鉴定 3.4.2.1间接免疫荧光抗体反应(IFA) 3.4.2.1.1固定 将盖玻片上的单层细胞,在自然干燥后滴加丙酮一乙醇(6:4)混合液室温固定5min,待其自然干 2 燥,用于IFA,或置于--20℃保存备用。设未感染的细胞单层为阴性对照。 3.4.2.1.2加第一抗体 GB/T26436--2010 用0.01mol/L磷酸盐缓冲液(pH7.4)将单克隆抗体(如抗ALV-J亚群特异性单克隆抗体)或抗 ALV单因子鸡血清(抗ALV单因子鸡血清的制备见附录c)稀释到工作浓度,在37℃水浴箱作用 40rain,然后用磷酸盐缓冲液洗涤3次。 3.4.2.1.3加FITC标记二抗 按商品用磷酸盐缓冲液稀释FITC标记的山羊抗小鼠IgG抗体或山羊抗鸡IgY抗体(当第 一抗体为ALV特异性单克隆抗体,选用FITC标记的山羊抗小鼠IgG抗体作为第二抗体;当第一抗体 为鸡抗ALV单因子血清,则选用FITC标记的山羊抗鸡IgY抗体作为第二抗体)。37℃水浴箱作用 40rain,用磷酸盐缓冲液洗涤3次。 3.4.2.1.4加甘油 滴加少量50%甘油磷酸盐缓冲液于载玻片上,将盖玻片上的样品倒扣其上。在荧光显微镜下 观察。 3.4.2.1.5结果观察与判定 被感染的CEF细胞内呈现亮绿色荧光,周围未被感染的细胞不被着色或颜色很淡。在放大200×~ 400×时,可见被感染细胞胞浆着色,判为ALV阳性,无亮绿色荧光者判为阴性。 3.4.2.2ALV—p27抗原ELISA检测 3.4.2.2.1抗原样本制备 将病料同3.4.1.1和3.4.1-2所述方法接种细胞,培养7d~14d后取上清液直接检测;也可取细 胞培养物冻融后检测;或用从泄殖腔采集的棉拭子。 3.4.2.2.2p27抗原ELISA检测 ALV—p27抗原可用商品试剂盒检测,对不同来源的样品,按厂家的说明书操作。当样本在DFl细 胞或CEF(C/E品系)上检测出ALV-p27抗原时,判为外源性ALV阳性,否则判为阴性。直接用泄殖 腔棉拭子样品检测出p27,说明有ALV,但不能严格区分外源性或内源性。 3.5 ALV亚群鉴定 3.5.1利用J亚群ALV特异性单克隆抗体进行IFA检测,可以鉴定J亚群ALV,但不能鉴别其他 ALV亚群如A亚群、B亚群、C亚群、D亚群。 3.5.2对分离到的病毒用RT—PCR(上清液中的游离病毒)或PCR(细胞中的前病毒cDNA)扩增和克 隆囊膜蛋白gp85基因,测序后与基因序列数据库(GeneBank)中的已知A亚群、B亚群、C亚群、D亚群 的gp85基因序列做同源性比较,即可对病毒进行分群。ALV病毒分群方法见附录D。 3.6荧光定量PCR扩增ALV-J 该方法适用于鸡群的检疫或ALv-J感染的净化,可在较短时间内完成大量样品的特异性检测。血 浆或泄殖腔棉拭子样品可直接用于检测,见附录E。 GB/T26436—2010 4血清特异性抗体的检测 4.1仪器和试剂 4.1.1试剂:磷酸盐缓冲液洗液、禽白血病抗体ELISA检测试剂盒、FITC标记的山羊抗鸡IgY抗体、 甘油。 4.1.2仪器:酶标仪、荧光显微镜、37℃恒温培养箱。 4.2样品的采集 样品的采集见3.3。 4.3抗体的检测 4.3.1ELISA检测 可选用禽白血病A亚群、B亚群及J亚群抗体ELISA检测试剂盒,严格按商品提供的说明书操作 和判定。 4.3.2IFA检测 4.3.2.1抗原 抗原制备方法见附录F。 4.3.2.2操作步骤 在相应的盖玻片上或抗原孔中加入用磷酸盐缓冲液(1:50)稀释的待检鸡血清,在37℃下作用 40min,用磷酸盐缓冲液洗涤三次。再加入工作浓度的FITC标记的山羊抗鸡IgY抗体(第二抗体),在 37℃作用40min,用磷酸盐缓冲液洗涤3次,加少量50%甘油磷酸盐缓冲液后在荧光显微镜下观察。 4.3.2.3结果的判定 结果的判定方法同3.4.2.1.5。不论是商品鸡群还是SPF鸡群,只要检出A亚群、B亚群及J亚群 抗体阳性的鸡,就表明该群体曾经有过外源性ALv感染。 附录A (规范性附录) O系SPF鸡胚成纤维细胞(cEF)的制备 GB/T26436—201 0 选择9日龄~10日龄发育良好的SPF鸡胚。先用碘酒棉再用酒精棉消毒蛋壳气室部位,无菌取出 鸡胚,去头、四肢和内脏,放人灭菌的玻璃器皿内,用无血清的DMEM液洗涤胚体。用灭菌的剪刀剪成 米粒大的小组织块,再用无血清的DMEM液洗2次~3次,然后加0.25%胰酶溶液(每个鸡胚约加 1 mL),在37.5℃~38.5℃水浴中消化10min~15min。吸出胰酶溶液消化产生的悬液,再加入适量 的营养液(用无血清的DMEM液,加青霉素、链霉素200IU/mL~500Iu/mL)吹打,用4层纱布滤过。 取少量过滤后的细胞悬液做细胞计数,其余在l000r/rain下离心5rain。将细胞沉淀再混悬于细胞培 养液中,制成每毫升含活细胞数约100万~150万的细胞悬液,分装于培养瓶(皿)中,进行培养,形成单 层后备用(一般在24h内应用)。 GB/T26436--2010 附录B (规范性附录) DFl细胞培养基配制 B.1商品化的DMEM液,pH7.2,加5%胎牛血清。青霉素、链霉素:各250Iu/mL。 B.2培养条件:37℃,5%二氧化碳。 附录C (规范性附录) 抗ALV单因子鸡血清的制备 GB/T26436--201 0 选择经鉴定无任何其他潜在病毒的ALV参考株作为种毒(如经ALv_J全基因组cDNA克隆质粒 DNA转染SPF鸡的CEF所产生的分子克隆化ALV),接种C/ECEF后复制和扩增病毒。病毒接种 CEF继续培养5d后,再传代一次。将传代长成单层的CEF换成含1%小牛血清的DMEM维持液,继 续培养72h~96h后收取上清液(通常可达到最高病毒效价),分装在离心管中,每支1mL,于一70℃ 冰箱保存。2d~3d后,取出一支,用细胞培养液作10倍系列稀释后,分别接种于含有新鲜配制的CEF 单层(细胞覆盖面应70%)96孔培养板上,每个稀释度8孔。在37℃下培养6d后,弃上清液,用磷酸 盐缓冲液洗一次后,加入预冷的丙酮一乙醇(6:4)固定。待自然干燥后,用抗ALv_J的单克隆抗体进行 IFA(见3.5),以IFA的结果来判定病毒感染的终点,测定其中ALv的组织细胞半数感染量(TCIDs。)。 选用6周龄以上SPF鸡,SPF隔离器饲养。每只鸡皮下接种104个TCID;。的ALv悬液。4周~ 6周后采集血清。IFA抗体滴度应≥1:i00。 GB/T26436—2010 D.1 克隆载体和宿主菌 附录D (规范性附录) ALV亚群鉴定程序 商品化的PCR产物克隆载体质粒,或其他类似载体质粒。可用多种大肠杆菌作为宿主菌,如 TGl等。 D.2病毒模板的制备 按照以下程序或商品化提取细胞DNA试剂盒的说明书提取细胞DNA。 1)接种病毒的细胞经磷酸盐缓冲液洗涤3次,加入适量0.25%胰酶,37℃温箱中放置5rain 10min,将细胞消化吹打后收集于1.5mL离心管中。 2)2000r/min离心收获细胞,然后加入500pL抽提缓冲液(100mmol/L氯化钠,10mmol/L Tris.C1pH8.0,25mmol/LEDTApH8.0,0.5%SDS)悬浮后,加入5pL蛋白酶K (100btg/mL),56℃水浴中消化5h。 3)加入等体积的苯酚一三氯甲烷溶液(苯酚:三氯甲烷;异戊醇一25:24:1)约500“L抽提一 次,将上层液体转移到另一1.5mL离心管中,加入1/10体积3mol/L的乙酸钠和2倍体积 无水乙醇后,置于一20℃冷却2h或者更长时间。 4)取出后12000r/min离心10rain沉淀DNA,弃去上清液。再小心加入70%冷乙醇轻洗DNA 沉淀,弃去上清液。 5)经乙醇沉淀后的DNA,空气中室温自然干燥后,溶解于50pL双蒸水中,即为模板DNA。 D.3囊膜蛋白eny基因的扩增 D.3.1引物 可根据已发表资料合成扩增ALV—J的前病毒DNA特异性PCR引物,本例示范引物为: 正向引物:5,_CTTGCTGCCATCGAGAGGTTACT一37,相当于ALV·J原型毒株HPRS-103前病 毒基因组DNA序列的第5394对~第5416对碱基。 反向引物:5『_AGTTGTcAGGGAATcGAC-3’,相当于ALV-J原型毒株HPRS-103前病毒基因组 DNA序列的第7811对~第7794对碱基。 引物用双蒸水稀释为25pmol/pL,一20℃保存备用。 D.3.2PCR 以第D.2章中提取的细胞DNA为模板,扩增ALV—J的囊膜蛋白基因(env)特异性2.2kb条带,其 PCR反应体系(50pL)见表D.1。 8 表D.1ALV-Jenv基因PCR反应体系 GB/T26436—201 0 组 分 体积/儿 双蒸水 30.5 10×缓冲液(无Me+)(成分:100mmol/LTris.CIpH8.0,500mmol/L氯化钾,1%明胶) 5 氯化镁(15retool/L) 4 dNTPs(2.5retool/L) 4 正向引物(25pmol/t-L) 2 反向引物(25pmol/t-L) 2 DNA聚合酶(5U/t1L) 0.5 模板DNA(约100ng//1L) 2 总体积 50 将上述成分分别加入灭菌的PCR管中,轻轻混和均匀,离心后置于PCR扩增仪。按照以下扩增程 序进行反应: 首轮循环:95℃5rain,50℃1min,72℃1min; 中间循环:95℃1min,50℃1min,72℃2min30s,进行30个循环; 72℃延伸10rain;4℃保存。 D.3.3PCR产物DNA电泳 用微量移液器取4.5止PCR产物加入0.5儿的10×进样缓冲液(o.25%溴酚蓝,0.25%--甲苯 苯胺,15%聚蔗糖400),在浓度为0.8%的琼脂糖凝胶上进行电泳,同时在另一加样孔加入5tLL DL2000DNAMarker。在TAE电泳缓冲液中,90v电压,电泳50min后,于紫外光凝胶成像分析系 统中观察并结果。 D.3.4PCR产物的回收与定量 可采用商品化PCR产物回收试剂盒进行回收。 1)将病毒e”。基因的PCR产物在0.8%的琼脂糖凝胶上进行电泳,90V电压,电泳50rain。 2)将目的条带切割下来,置于已经称重的1_5mL离心管中。 3)再次称重,计算含目的条带的凝胶块的质量。 4)按每毫克加入100tLLUltraSalt,在55℃~65℃水浴锅中使琼脂糖凝胶融化。 5)加入5pLGlassMilk,混匀后室温下放置5min。 6) 12000r/min离心,去掉上清液。 7)加人1mLUltraWash洗涤沉淀。 8) 12000r/min离心,去掉上清液。再次离心,用微量移液器吸出剩余液体。 9)干燥后,加入15pL双蒸水,用微量移液器吹打混匀后,室温下放置5min,12000r/min离心, 将上清液转移至另一离心管中。 10)取1pL回收产物在0.8%的琼脂糖凝胶上进行电泳,另加5pLDL2000DNAMarker,用以 估计回收DNA的浓度。 GB/T26436—2010 D.4 PCR产物的克隆 D.4.1连接反应 将载体与纯化回收PCR产物于16℃下连接6h~8h。 连接体系为: 载体 25ng 纯化Pn"基因PCR产物 100ng 溶液I 5pL 加双蒸水至 10pL D.4.2质粒转化用感受态大肠杆菌的制备 用氯化钙法制备大肠杆菌TGl菌株的感受态细胞,步骤简述如下: 1)一个盛约50mLLB液体培养基的锥形瓶,接种大肠杆菌TGl菌株,在37℃恒温振荡器中振 荡培养至半浑浊半透明状态。 2)在无菌条件下将细菌转移到一个无菌的--20℃保存的50mL离心管中,冰上放置10rain,使 培养物冷却至0℃。 3)4℃以4000r/min离心10min,回收细菌细胞。 4)倒出上清液,将管倒置1min,以使残余的培养液流尽。 5)用10mL用冰预冷的O.1mol/L氯化钙重悬每份沉淀,冰浴上放置30min。 6)4℃以4000r/min离心10min,回收细菌细胞。 7)倒出上清液,将管倒置1min,以使残余的培养液流尽。 8)每50mL初始培养物用lmL用冰预冷的0.1mol/L氯化钙重悬每份沉淀,4℃保存备用。 D.4.3质粒的转化 将D.4.1中得到的连接产物转化大肠杆菌,步骤简述如下: 1)10pL连接产物加入200pL新鲜制各的TGl感受态细胞中,混匀内容物,冰浴上放置 30min。 2)放人42℃循环水浴中,准确热激90s。 3)快速转移到冰浴中,使之冷却2min~3min。 4) 每管加LB培养基800pL,在37℃摇床上(转速不超过225r/min),温育45min,使细菌复苏。 5)取200pL菌液均匀涂布到含有100pg/pL氨苄青霉素的LB琼脂平板上。 6)将平板置于37℃温箱中培养12h,挑取单个菌落培养后,进行质粒DNA的制备与鉴定。 D.5质粒DNA的提取和鉴定 D.5.1质粒DNA的提取 挑选平板上的白色菌落,接种至氨苄青霉素浓度为50t-g/mL的5mLLB液体培养基中,于37℃ 摇床上振荡培养6h,提取质粒。 1)菌体的收集: a)将培养液倒人1.5mL离心管中,12000r/min,离心1min,倒掉上清液。 b)用1mLTE缓冲液悬浮菌体沉淀,再离心回收菌体。 】O GB/T26436—201 0 2)将沉淀悬浮于100pL用冰预冷的溶液I,在振荡器上强烈振荡混匀。 3)加200pL溶液1I(不超过5min,溶液Ⅱ需现配),颠倒5次(不要强烈振荡),冰浴中放置 3min。 4)加150pL溶液Ⅲ,温和振荡10S,冰浴中放置3min~5min。 5)12000r/min离心5min,将上清液转移至另一离-Ii,管中,加入等体积的苯酚一三氯甲烷,在振 荡器上振荡混匀。 6) 12000r/min离心5min,将上清液转移至另一离心管中,加入2倍体积的无水乙醇。 7)12000r/min离心10min~15min,用1mL70%乙醇漂洗沉淀,干燥DNA沉淀。 8)用50pL双蒸水或TE缓冲液溶解沉淀,同时加入0.5btL~lpLRNase。--20℃保存备用。 D.5.2重组质粒DNA的酶切鉴定 质粒以EcoRI和HindⅢ这两种酶进行双酶切鉴定。 酶切体系如下: 总体积 20pL 质粒DNA 双蒸水 lo×缓冲液K EcoRI HindⅢ 10“L 7“L 2uL 0.5“L 0.5“L 以上组分混匀后,轻微离心,37℃酶切2h。于0.8%的琼脂糖凝胶中90V电泳45rain,在凝胶成 像系统下观察并记录结果。 D.6克隆序列的测定 将上一步经EcoRI和HindⅢ双酶切鉴定的阳性克隆测序。所得序列与GeneBank中发布的 ALv的A亚群、B亚群、c亚群、D亚群、E亚群和J亚群的囊膜蛋白gp85基因做同源性比较分析,并 确定属于哪个亚型。可参考的GeneBank中序列编号分别为:M37980和DQ365814(A亚型); AF052428(B亚型);J02342(C亚型);D10652(D亚型);M12172、EF467236和AY013303(E亚型); Z46390、AF247391、DQll6805、AY897219和EU264064(J亚型)。对于A亚群、B亚群、c亚群、D亚 群和E亚群,核苷酸或氨基酸的同源性应分别大于90%,与哪个参考亚型的同源性最高,即确定是这个 亚型。对于J亚群,应与大多数已知J亚群序列的同源性大于80%。 GB/T26436—2010 E.1试剂 附录E (规范性附录) 荧光定量PCR扩增ALv_J 引物和探针序列: 选择ALv—J特异性env基因序列作为ALv_J检测的靶序列,产物长度为138bp。 上游引物:5’AGAAAGACCCGGAGAAGAC3’; 下游引物:5’AcAcGTTTccTGGTTGTT3’; TaqMan探针:5’ATTTCCGTTGTccCAGGGGTGG3’,其5’端和3’端分别标记FAM和BHQ。 E.2样品采样和前处理 样品采样和前处理见3.3。 E.3 核酸抽提及荧光定量PCR检测 E.3.1注意事项 实验室注意事项参见附录G。 E.3.2核酸抽提 1)取n个灭菌的1.5mLEppendorf管编号(n为被检样品与阴性对照、阳性对照之和)。 2)每管加入600pL细胞裂解液,分别加入被检样本、阴性对照、阳性对照各200pL,再加入 200pL三氯甲烷,混匀器上振荡混匀5s(不能过于强烈,以免产生乳化层,也可以用手颠倒混 匀)。于4℃、12000r/rain离心15min。 3)取与E.3.2的1)相同数量灭菌的1.5mLEppendoH管,加入400止异丙醇(--20℃预冷), 做标记。吸取E.3.2的1)各管中的上清液转移至相应的管中,上清液应至少吸取500pL,尽 量避免吸出中间层,颠倒混匀。 4)于4℃、12000r/rain离心15min(Eppendorf管开口保持朝离心机转轴方向放置),小心倒去 上清液,倒置于吸水纸上,沾干液体(不同样品需在吸水纸不同地方沾干)}加人600/-L75%乙 醇,颠倒洗涤。 5)于4℃、12000r/min离心10min(Eppendorf管开口保持朝离心机转轴方向放置),小心倒去 上清液,倒置于吸水纸上,尽量沾干液体(不同样品需在吸水纸不同地方沾干)。 6)4000r/min离心10s(EppendoH管开口保持朝离心机转轴方向放置),将管壁上的残余液体 甩到管底部,小心倒去上清液,用微量加样器将其吸干,吸头不要碰到有沉淀一面,室温下干燥 5min~10min。 7)加入15pLDEPC(焦碳酸乙二酯)水,溶解管壁上的RNA,5000r/min离心5S,冰上保存备 用。若需长期保存则需放置在一70℃冰箱。 E.3.3扩增检测 E.3.3.1扩增试剂准备 GB/T26436—2010 在反应混合物配制区进行。 取出J亚群禽白血病病毒一步法荧光定量RT—PCR检测试剂盒(参见附录H),在室温下融化后, 6000r/rain离心5s,每个PCR反应按表E.1所示用量配制PCR反应混合液(需配制反应液数量=样 本个数+阴性对照+阳性对照+1)。 表E.1 PCR反应体系 试 剂 用量/pL RT-PCR反应液 14.5 Taq酶(5U/pL) 0.25 逆转录酶 0.25 将以上PCR反应试剂按使用量吸取到一个离心管中,充分混匀,然后在每个PCR管中分装15pL 转移至样本处理区。 E.3.3.2加样 在已分装有PCR反应混合液的PCR管中分别加入已提取好的核酸10pL,盖上管盖,将PCR管放 人荧光PCR检测仪内,记录样本放置顺序。 E.3.3.3PCR扩增检测 在扩增检测区进行。 E.3.3.4反应条件 第一步:42℃30rain,95℃5rain; 第二步:95℃10s,55℃10s,72℃30s,5个循环 第三步:95℃5s,60℃30s,40个循环; 60℃时设置采集荧光。 E.3.3.5荧光素设定 基团(reportdye)设定为FAM,淬灭基团(quenchdye)设定为BHQ(或Tamra或Eclipse),参 考标记物(referencedye)设定为None。 E.4分析条件设定及结果判定 E.4.1质控标准 E.4.1.1综合分析仪器给出的各项结果,基线(baseline)以仪器给出的默认值作为参考,周值 (threshold)设定原则以阈值线刚好超过正常阴性对照品扩增曲线的最高点为准,具体根据仪器噪音情 况进行调整,选择FAM通道进行分析。 E.4.1.2ALV_J阳性对照和阴性对照质控标准:阳性对照有s型PCR扩增曲线,而且ct值(每个反 应管内的荧光信号量达到设定的阈值时所经历的循环数)≤30;阴性对照无s型PCR扩增曲线,且ct 13 GB/T26436—2010 值为无。否则此次试验结果无效。 E.4.2结果判定及描述 E.4.2.1有S型PCR扩增曲线,且Ct值≤30的样本为阳性,表明ALv-J核酸阳性。无s型PCR扩 增曲线,且ct值为无的样本为阴性样本,表明ALV-J核酸阴性。 E.4.2.2对于30
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