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分子生物学重要概念解释

2012-04-10 24页 doc 192KB 14阅读

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分子生物学重要概念解释分子生物学重要概念解释 A Abundance (mRNA 丰度):指每个细胞中mRNA 分子的数目。 Abundant mRNA(高丰度mRNA):由少量不同种类mRNA组成,每一种在细胞中出现大量 拷贝。 Acceptor splicing site (受体剪切位点):内含子右末端和相邻外显子左末端的边界。 Acentric fragment(无着丝粒片段):(由打断产生的)染色体无着丝粒片段缺少中心粒,从而 在细胞分化中被丢失。 Active site(活性位点):蛋白质上一个底物结合的有限...
分子生物学重要概念解释
分子生物学重要概念解释 A Abundance (mRNA 丰度):指每个细胞中mRNA 分子的数目。 Abundant mRNA(高丰度mRNA):由少量不同种类mRNA组成,每一种在细胞中出现大量 拷贝。 Acceptor splicing site (受体剪切位点):内含子右末端和相邻外显子左末端的边界。 Acentric fragment(无着丝粒片段):(由打断产生的)染色体无着丝粒片段缺少中心粒,从而 在细胞分化中被丢失。 Active site(活性位点):蛋白质上一个底物结合的有限区域。 Allele(等位基因):在染色体上占据给定位点基因的不同形式。 Allelic exclusion(等位基因排斥):形容在特殊淋巴细胞中只有一个等位基因来表达编码的 免疫球蛋白质。 Allosteric control(别构调控): 指蛋白质一个位点上的反应能够影响另一个位点活性的能力。 Alu-equivalent family(Alu 相当序列基因):哺乳动物基因组上一组序列,它们与人类 Alu 家族相关。 Alu family (Alu家族):人类基因组中一系列分散的相关序列,每个约300bp长。每个成员 其两端有Alu 切割位点(名字的由来)。 α-Amanitin(鹅膏覃碱): 是来自毒蘑菇 Amanita phalloides 二环八肽,能抑制真核RNA聚 合酶,特别是聚合酶II 转录。 Amber codon (琥珀密码子):核苷酸三联体UAG,引起蛋白质合成终止的三个密码子之一。 Amber mutation (琥珀突变):指代表蛋白质中氨基酸密码子占据的位点上突变成琥珀密码 子的任何DNA 改变。 Amber suppressors (琥珀抑制子):编码tRNA的基因突变使其反密码子被改变,从而能识 别UAG 密码子和之前的密码子。 Aminoacyl-tRNA (氨酰-tRNA):是携带氨基酸的转运 RNA,共价连接位在氨基酸的 NH2 基团和tRNA 终止碱基的3¢或者2¢-OH 基团上。 Aminoacyl-tRNA synthetases (氨酰-tRNA合成酶): 催化氨基酸与 tRNA 3¢或者2¢-OH基团 共价连接的酶。 Amphipathic structure(两亲结构):具有两个表面,一个亲水,一个疏水。脂类是两亲结构, 一个蛋白质结构域能够形成两亲螺旋,拥有一个带电的表面和中性表面。 Amplification (扩增):指产生一个染色体序列额外拷贝,以染色体内或者染色体外DNA形 式簇存在。 Anchorage dependence (贴壁依赖):指正常的真核细胞需要吸附表面才能在培养基上生长。 Aneuploid (非整倍体): 组成与通常的多倍体结构不同, 染色体或者染色体片段或成倍丢失。 Annealing (退火):两条互补单链配对形成双螺旋结构。 Anterograde (顺式转运):蛋白质质从内质网沿着高尔基体向质膜转运。 Antibody (抗体):由 B 淋巴细胞产生的蛋白质(免疫球蛋白质),它能识别特殊的外源“抗 原” ,从而引起免疫应答。 Anticoding strand (反编码链):DNA 双链中作为膜板指导与之互补的 RNA 合成的链。 Antigen (抗原):进入基体后能引起抗体(免疫球蛋白质)合成的分子。 Antiparallel (反式平行):DNA双螺旋以相反的方向组织,因此一条链的 5¢端与另一条链的 3¢端相连。 Antitermination protein (抗终止蛋白质):能够使RNA聚合酶通过一定的终止位点的蛋白质 质。 AP endonucleases (AP 核酸内切酶):剪切掉 DNA 5¢端脱嘌呤和脱嘧啶位点的酶 Apoptosis (细胞凋亡):细胞进行程序性死亡的能力;对刺激应答使通过一系列特定反应摧 毁细胞的途径发生。 Archeae (古细菌):进化中与原核和真核不同的一个分支。 Ascue (子囊):真菌的子囊包含四个或八个(单一的)孢子,表示一次减数分裂的产物。 Att sites (Att位点):在噬菌体和细菌染色体中将噬菌体插入或切除细菌染色体的位点。 Attenuation (衰减):控制一些细菌启动子表达中涉及的转录终止调控。 Attenuator (衰减子):衰减发生处的一种内部终止子序列。 Autogenous control (自体调控): 基因产物减弱(负自体调控)或者激活(正自体调控)其编码基 因表达的作用。 Autonomous controlling element (自主控制元件):玉米中一种具有转座能力的转座元件。 Autoradiography (放射性子显影): 通过放射性标记分子在胶卷上留下图像检测分子的方法。 Autosomes (常染色体):除性染色体外的所有染色体。二倍体细胞拥有两套常染色体。 B B lymphocytes or B cell (B淋巴细胞或B 细胞):合成抗体的细胞。 Backcross (回交):杂交检测的另一种(早期的)说法。 Back mutation (回复突变):逆转产生基因失活效果突变的突变,从而使细胞恢复野生型。 Bacteriophage (细菌噬菌体):侵染细菌的病毒,通常简称为噬菌体。 Balbiani ring (B环):多线染色体条带中一个很大的泡状环。 Normal chromosomes (常染色体):相对较大,一定区域内在特定化学处理下保持着色。 Base pair (碱基对):是DNA双链中一对A和T 或G和 C。在RNA中特定条件下也能形 成其它的配对。 Bidirectinal replication (双向复制):当两个复制叉在同一起始点以不同的方向移动时形成。 Bivalent (二价染色体):在减数分裂初期一种包括四条染色单体的结构(两个染色单体代表 同源染色体)。 Blastoderm (囊胚层):昆虫胚胎发育的一个阶段,其中胚胎周围的一层细胞核或细胞围绕 着中央的卵黄。 Blocked reading frame (闭锁读框):由于被终止密码子打断而不能被翻译成蛋白质的读码 框。 Blunt-end ligation (平端连接):直接在末端连接两个 DNA 双链分子的反应。 bp:是碱基对的简称,表示DNA 之间的距离。 Branch migration (分支迁移):指双链中与其互补链部分配对的 DNA链通过延伸与其同源 的固定链配对的能力。 Breakage and reunion (断裂与重连):指一种遗传重组的模式,其中两个DNA双链分子在相 应的位置打断并十字交叉重新连接(涉及在连接位点异源双链的形成)。 Buoyant density (漂浮密度):衡量一种物质漂浮在一些标准液体上的能力,如 CsCl。 C C banding:在着丝粒附近产生着色区域的染色体分带技术。 C gene (C 基因):编码免疫球蛋白质链恒定区域的基因。 C value (C值):单倍体基因组中DNA 的总量。 CAAT box (CAAT盒):真核生物转录单位起始点上游的保守序列,被一组转录因子识别。 Cap (帽):是真核生物mRNA 5¢端的结构,在转录后通过末端 5¢ GTP的磷酸基团和 mRNA 的末端碱基而引入。增加的G(有时是其它碱基)是甲基化的,产生了Me G5¢ pppNp… 的 结构。 CAP(CRP):由 cAMP 激活的正调控蛋白质。对 RNA 聚合酶起始 E.coli 中一些操纵子(分 解代谢——敏感)是必须的。 Capsid (衣壳):是病毒微粒外部的蛋白质衣壳。 Caspases:一个蛋白质酶家族,其成员在调亡(细胞程序性死亡)中起作用。 Catabolite repression(分解代谢物阻碍):由于葡萄糖增加引起一些细菌操纵子表达降低。是 cAMP 水平降低使CAP 调控蛋白质失活所导致。 cDNA:与RNA 互补的单链DNA,通过体内RNA 逆转录而合成。 cDNA clone (cDNA 克隆):代表一个RNA 的双链 DNA 进入一个克隆载体。 Cell cycle (细胞周期):一次细胞分裂到另一次分裂的时期。 Cell hybrid (细胞杂交):包含来自不同种属亲本细胞染色体的体细胞(如人-鼠融合细胞杂 交),通过融合细胞形成融合的异型核而产生。 Centrioles (中心粒):在减数分裂期聚集在中轴附近、由微管组成的小空圆柱体,位于着丝 粒上。 Centromere (着丝粒):染色体聚集区域,包含减数分裂或有丝分裂纺锤体结合位点。 Centrosomes (中心体):减数分裂细胞微管组织的区域。在动物细胞中,每一个中心体包括 一对由微管附接的、高密度不定型区域围绕的中心粒构成。 Chaperone (分子伴侣):使一些蛋白质装备或者恰当折叠所需的蛋白质,但是这种蛋白质并 不是目标复合物的成分。 Chemical complexity (化学复杂度):化学测量的 DNA 成分量。 Chi sequemce (Chi序列):一个提供E.coli中 RecA 介导遗传重组热点的八聚体序列。 Chi structure (Chi结构):两个双链DNA之间的接头通过去掉两个连在一起的环而使每个 环产生线形末端暴露出来。它类似于希腊文 chi,从而得此名字。 Chiasma (交叉):两个同源染色体在减数分裂中交换物质的位点。 Chromatids (染色单体):复制时产生的染色体拷贝。此名字通常用来形容处于随后的细胞 分裂期它们分开的之前的染色体。 Chromatin (染色质):是细胞中期核内DNA和蛋白质复合体。个别的染色体不能区分开。 它只能通过与DNA 特异性作用的染料而识别。 Chromatin remodeling (染色体重建):指发生在基因活化转录时核小体能量-依赖型的排列或 重排。 Chromocenter (染色中心):来自不同染色体的异染色质聚集。 Chromomeres (染色粒):在某一时的期染色体中,特别是减数分裂初期,染色很深的可见 小颗粒,此时染色体可能表现为一系列的染色粒。 Chromosome (染色体):携带很多基因的基因组的分离单位。每一条染色体包含长的双链 DNA 分子以及等量的蛋白质。只在细胞分裂中才为可见的形态单位。 Chromosome walking (染色体步移):连续分离携带重叠DNA序列的克隆,使染色体大部 分被覆盖。步移通常用于获得某个感兴趣的位点。 cis-acting locus (顺式作用位点):只影响处于同一DNA分子上的DNA序列,此性质通常 暗示该位点不编码蛋白质。 cis-acting protein (顺式作用蛋白质):不同寻常的、只作用于表达它的DNA序列上的蛋白 质质。 cis configuration (顺势构型):指在同一个DNA 分子上的两个位点。 cis/trans assays(顺/反测验):分析两个突变相对构型对表达的影响,双杂合体中,同一基因 上的两个突变在反式构型中表现出突变表型,顺势构型中表现出野生表型。 Ciston (顺反子):是由顺/反测验定义的遗传单位,与基因等同,都是代表一个蛋白质质的 DNA 单位组成。 Class switching (类别转换):在淋巴细胞分化过程中免疫球蛋白质重链 C 区表达的转换。 Clone (克隆):指大量与祖先细胞和分子相同的细胞和分子。 Cloning vector (克隆载体):携带插入外源片段的质粒或噬菌体,从而产生更多物质或蛋白 质产物。 Closed reading frame (关闭读框):包含阻碍它翻译成蛋白质的终止密码子。 Coated vesicles (包被膜泡):膜表面有一层蛋白质,如网格蛋白质、COP-1、COP-II的膜泡。 Coconversion (共转变):在基因转换中两个位点的同时修改。 Coding strand (编码链):与mRNA 有相同序列的 DNA 链。 Codominant alleles (共显性等位基因):两个都对表型有贡献,谁也不占优势。 Codon (密码子):三连体核苷酸,代表一个氨基酸或者终止信号。 Coevolution (共进化):见协同进化。 Cognate tRNAs (同功tRNA):能够被一个特殊的氨酰基-tRNA 合成酶识别的 tRNA。 Coincidental evolution (重合进化):见协同进化。 Cointegrate structure (共合结构): 两个复制子融合产生的结构, 一个复制子带有一个转座子, 另外一个缺少,但是整合体中出现两个在复制子汇合处的转座子,方向是正向复制。 Cold-sensitive (冷敏):这种突变在低温下是缺陷型的,但是在高温下正常。 Colon hybridization (菌落杂交):使用原位杂交来确定携带一个特定同源序列的插入 DNA 片段载体的技术。 Compatibility group (相容组):含有不能同时存在一个细菌细胞内的质粒。 Complementation (互补):不同的(非等位)基因提供扩散型产物,从而使含有两个反式突变 的杂合体产生野生表型的能力。 Complementation assay (互补测验):见体内互补测验。 Complementation group (互补群):互相反式重组时不互补的一系列突变,它定义了一个遗 传单位(顺反子)。 Complex locus(复合基因座): 果蝇中拥有与代表单个蛋白质的基因功能不一致的遗传性质。 在分子水平上复合基因座通常很大(>100kb)。 Complexity (复杂度):在给定样本中不同 DNA 序列的总长度。 Composite transposons (复合转座子):两个插入序列包围着一段中央区域,这两个序列中的 一个或者两个可能使整个元件转座。 Concatemer (多联体DNA):包含一系列一前一后重复的基因组单位。 (Con)catenated circle (多联环):DNA 环如同链上的环一样连接起来。 Concerted evolution (协同进化):两个相关基因如同组成一个等位基因那样共同进化。 Condensation reaction (缩合反应):由于失去水分子使共价键形成,例如往多肽链中加入氨 基酸的反应。 Conditional lethal mutations (条件致死突变):在特定的(非许可的)条件下杀死一个细胞或病 毒的突变,但是在其它(许可的)条件下使其存活。 Conjugation (接合):指两个细菌之间的杂交,部分染色体从一个细胞转入另一个细胞。 Consensus sequemce (共有序列):当许多实际序列比较时,每个位点上的碱基能够代表最 常出现的碱基理想序列。 Conservative recombination (保守重组):在没有任何新 DNA链形成情况下,已经存在 DNA 链的打断和重新连接。 Conservative transposition (保守转座):即大的序列移动,原认为是转座子,现在认为是附 加体。这种机制类似于噬菌体λ位点。 Constant regions (恒定区):免疫球蛋白质的保守区由 C基因编码,是变化很少的链的一部 分。重链的恒定区决定免疫球蛋白质的类型。 Constitutive genes (结构基因):由于RNA聚合酶与启动子作用而表达的基因,不需要额外 的调控。有时候也被称为看家基因,因为它在所有细胞中都有低水平表达。 Constitutive heterochromatin (组成型异染色质):指永久不表达序列的钝化状态,通常是卫 星DNA。 Constitutive mutations (组成型突变):引起需要调控的基因在不被调控的状态下持续表达。 Contractile ring (收缩环):在有丝分裂后期中轴附近形成的激动蛋白质纤维环,负责将子代 细胞分开。 Controlling elements (控制成分):玉米中的控制成分是最初由其遗传性质确认的转座单位。 分自主(能够独立转座)或者非自主(只有在一个自主元件存在下转座)两类。 Coordinate regulation (协同调控):即对一组基因的调控。 Cordycepin (蛹虫草菌素):是3¢脱氧腺苷,是RNA 聚腺苷化的阻扼子。 Core DNA (核心DNA):核心颗粒中包含的 146bp DNA。 Core particle (核心颗粒):核小体的消化产物,包含组蛋白质八聚体和 146bp DNA,其结构 与核小体本身相似。 Corepressor (共阻碍物):是一个小分子,通过结合到调控蛋白质上抑制转录。 Cosmid (粘粒):包含l噬菌体cos位点的质粒,因此,质粒DNA能够在体内被噬菌体衣壳 包裹。 Cot (浓度时间常数):在复性反应中DNA 浓度和反应时间的乘积。 Cot1/2(半变Cot值):反应完成一半时所需的 Cot值,它直接与复性 DNA 成正比。 Cotransfection (共转染):两个标记的共同转染。 Crossing-over (交换):发生在减数分裂中染色体间互相交换物质,引起遗传重组。 Crossover fixtion (交换固定):不均等交换的一种可能结果,能使前后连接簇中一个成员的 突变延伸到每一簇。 Cruciform (十字架):在同一链中插入其互补链(而不是与双链中另一条链中的互补片段)配 对的DNA 重复序列所形成的结构。 Cryptic satellite (隐蔽卫星):不能通过密度梯度上的峰值分离的卫星,即隐藏在主带中。 ctDNA:即叶绿体DNA。 cAMP:磷酸基团连接核糖 3¢和 5¢位置的 AMP 分子,其结合可激活 CAP,原核生物转录 中的正调控因子。 Cyclins (细胞周期蛋白质):在细胞周期中连续积累的蛋白质,随后在减数分裂中被蛋白质 水解作用消除。 Cytokinesis (胞质分裂):在减数分裂中涉及子代细胞分裂和离开的最终过程。 Cytological hybridization (细胞学杂交):见原位杂交。 Cytoplasm (细胞质):指质膜和核之间的物质。 Cytoplasmic inheritance (胞质遗传): 定位在线粒体或者叶绿体(也可能是其它细胞器)的基因 性质。 Cytoplasmic protein synthesis (胞质蛋白质合成):代表核基因 mRNA的翻译,通过附加在细 胞骨架上的核糖体进行。 Cytoskeleton (细胞骨架):真核细胞质中纤维组成的网络。 Cytosol (胞质溶胶):容纳细胞器(如线粒体)的胞质容积。 D D loop (D环):线粒体DNA上的一个区域,其上一小段RNA与DNA的一条链配对,使 DNA 原始配对链在此区域闲置。也用来描述在 RecA 蛋白质催化的反应中单链“入 侵者”的进入,使双链DNA 中的一条被闲置。 Degeneracy (简并性):指密码子的第三个碱基上的变化不会改变它所代表的氨基酸。 Deletion (缺失):一段DNA 序列被删除,两边的区域连接起来产生的。 Denaturation of DNA or RNA (DNA或RNA变性):指它们从双链转变成单链状态,双链分 开一般因加热产生。 Denaturation of protein (蛋白质变性):指蛋白质的物理结构向另一结构(不活泼的)转变。 Depressed state (抑制状态):指关闭的基因。当描述一个基因的一般状态时,它与“诱导” 同义。在描述突变的效果时,它与“组成型”同义。 Dicentric chromosome (双着丝粒染色体):两个染色体片段融合的产物,每一片段都有一个 着丝粒。通常稳定,在减数分裂中当两个中心粒向两极运动时被拉断。 Diploid (二倍体):二倍体染色体包括两个拷贝的常染色体和两个性染色体。 Direct repeat (同向重复):在同一个DNA分子中,相同的(或者相近的)序列以相同的方向 出现两次或多次,但并不一定相邻。 Discontinuous replication (不连续复制):指DNA 以小片段(岗崎片段)合成然后连接起来。 Disjuction (间断分布):指在细胞分裂中染色体成分向两极运动。在减数分裂和有丝分裂 II 期,分裂的是姊妹染色单体,在有丝I期分裂的是姊妹染色单体对。 Divergence (差异百分率): 两个相关DNA的核苷酸序列或者两个蛋白质氨基酸序列间差异 百分率。 Divergent transcription (异向转录):相反方向两个启动子之间的转录起始,因此转录从中央 区域开始向两边进行。 dna mutant (dna 突变):这种突变的细菌是温度敏感型的,它们不能在 42℃下合成DNA, 但是能在 37℃合成。 DNAase (DNA 酶):攻击DNA 之间化学键的酶。 DNAase I hypersensitive (DNA酶I超敏位点):由于对 DNA酶 I和其它核酸酶切割高度敏 感而被发现的染色单体上一小段区域。可能由不包括核小体的区域构成。 DNA-driven hybridization (DNA驱动杂交):涉及到额外 DNA 与 RNA 反应的杂交。 DNA poymerase (DNA聚合酶):合成子代DNA链(在 DNA模板的指导下)的酶。可能在修 复或复制中涉及。 DNA replicase (DNA 复制酶):在复制中特异性需要的一种 DNA 合成酶。 Domain of a chromasome (染色体结构域):指一个连续的结构整体,其中超螺旋结构独立于 其它结构域。也可指包含表达基因的一个广泛区域,这个基因对DNAase I 有高度敏 感性。 Domain of a protein (蛋白质结构域):氨基酸序列的一个整体连续的部分,具有某种具体的 功能。 Dominant allele (显性等位基因):决定杂合中表型的等位基因。 Donor splicing site (供体剪接位点):见左剪切点。 Dosage compensation (剂量补偿效应):补偿一个性别中出现两条X 染色体和另一个性别中 出现一条 X 染色体偏差的机制。 Down promoter mutation (启动子下降突变):减少转录起始频率的突变。 Dowmstream (下游):沿着表达方向的序列。例如,编码区是在起始区的下游。 E Early development (早期发育):指噬菌体侵染中在DNA 复制起始前的一段时期。 Ectopic expression (异位表达):基因在它通常不表达的组织中的表达,例如,在转基因动 物中或感染进入胚胎中不常见的位置。 Elongation factors (延伸因子):原核中为EF,真核中为 eEF),在每一个氨基酸加入多肽链 的过程中周期性作用于核糖体的蛋白质。 End labeling (末端标记):指在链5¢或者3¢端加上放射性标记的 DNA 分子。 End-product inhibition (终产物抑制):代谢过程中的一个产物能够抑制途径中前些阶段所需 酶活性的能力。 Endocytic vesicle(内吞膜泡):通过内吞运输蛋白质的包被膜泡,也称为网格膜泡。 Endocytosis (内吞作用):细胞表面的蛋白质内聚,在包被膜泡中转移到细胞内部的过程。 Endonucleases (内切核酸酶):切割核酸链内的化学键。可能特异性的切割 RNA 或者单链 或双链DNA。 Endoplasmic reticulum (内质网):高度回绕的膜结构,从核膜最外层延伸到细胞质内。 Enhancer (增强子):是一个顺式作用序列,能够提高一些真核生物启动子的利用,并能够 在启动子任何方向以及任何位置(上游或者下游)作用。 Enelopes (包膜):某些细胞器外膜(如细胞核或线粒体),由同中心的膜构成,每一个膜由磷 脂双分子层组成。 Episome change (后天改变):不影响基因型但是改变表型。它们包括细胞性质的改变,这 是遗传的但是在遗传信息上没有表现出改变。 Episome (附加体):能够整合进细菌DNA 中的质粒。 Epistasis (上位性):指一个基因的表达会模糊另一个基因的表型效果。 Essential gene (必须基因):缺失会使生物致死的基因(见致死等位基因)。 Established cell lines (确立细胞株):能够在不确定培养基中生长的真核细胞(它们据说是永 生的)。 Eubacteria (真细菌):组成原核生物中的大部分。 Euchromatin (常染色体):间期核内除了异染色质之外的所有基因组。 Evolutionary clock (进化钟):特定基因突变积累的速度定义。 Excision (切除):噬菌体、附加体或其它序列的切除是指它们以自主 DNA分子形式从宿主 染色体中释放出来。 Excision-repair (切除修复):这个系统移开包含损伤和错误配对碱基的DNA序列,在双链 中通过合成与保留链互补的链来替换它们。 Exocytosis (外排):从细胞向培养基中分泌蛋白质的过程,通过以膜被小泡从内质网、高尔 基体向储存器官运输,最终(依赖调控信号)通过质膜。 Exon (外显子):割裂基因中在成熟mRNA 产物中表达的任何片段。 Exonucleases (核酸外切酶):从核酸链中每次从一头切割一个核苷酸, 可能特异性切割DNA 或者RNA 的5¢或者3¢端。 Expression vector (表达载体):好的克隆载体,使编码序列插入特定的位点,能够转录 和翻译成蛋白质。 Extranuclear genes (核外基因):核外的、定位在细胞器,如线粒体或叶绿体中的基因。 F Ffactor (F 因子):细菌性或繁殖质粒。 F1 generation (F1代):两个亲本系(同源)杂交后的第一代。 Facultative heterochromatin (兼并性异染色质):指同时存在活泼型拷贝的惰性序列。如,哺 乳动物雌性中的一条X 染色体。 Fast component (快速变性区): 复性反应中的快成分是首先复性, 含有高重复DNA的成分。 Fate map (原基分布图):在胚胎上标示该区域内细胞的后代将会发育而成的成熟组织。 Figure eight (8字型):由尚未完成的重组生成的两个相互连接的环状 DNA。 Filter hybridization (滤膜杂交):将变性DNA样本固定于硝酸纤维膜上,然后用放射性标记 的DNA 或RNA 进行杂交。 Fingerprint of DNA (DNA 指纹图谱):指不同基因组间的不同多形态限制性片段模式。 Fingerprint of protein (蛋白质指纹图谱):酶(如胰蛋白酶)切割蛋白质后产生的片段模式(通 常用双向凝胶电泳分离)。 Fluidity (游动性):指膜的性质,脂质在其单层膜上双向移动的能力。 Focus formation (转化灶形成):指转化后的真核细胞以高密度的簇生长。 Focus formation units (转化灶单位):转化灶的数量单位。 Foldback DNA (折回DNA):指插入重复组成 DNA 通过变性后重新复性产生的结构。 Footprinting (足纹法):一种检测 DNA 位点的技术,通过某些蛋白质结合保护化学键,使 被保护位置免受酶切割。 Forward mutations (正向突变):失活野生型基因的突变。 Founder effect (始创效应):指从一个祖先起源、具有相同染色体(或者染色体一个区域)的 个体集合。 Frameshift mutations (移码突变):因非3bp整数倍碱基插入或缺失造成的、改变三联体翻 译成蛋白质读框的突变。 G G banding (G 分带):在中期染色体上产生条纹,从而区分出单倍体各个成员的技术。 G1:真核细胞周期中减数分裂后期到DNA 复制开始的时期。 G2:真核细胞周期中DNA 复制结束到下一次减数分裂开始的时期。 Gamete (配子):指任何一种类型的生殖细胞,精子或者卵,具有单倍体染色体物质。 Gap in DNA (DNA 裂隙):在双链中的一条上一个或多个核苷酸缺失。 Gene /ciston (基因/顺反子):指能产生一条多肽链的DNA片段。包括编码区和其上下游区 域(引导区和尾),以及在编码片段间(外显子)的割裂序列(内含子)。 Gene cluster (基因簇):一组相同或者相似的基因。 Gene conversion (基因转换):指异源双链DNA中的一条链转换,使其在出现碱基配对处与 另一条链互补。 Gene dosage (基因剂量):在一个基因组中某个基因的重复数量。 Gene family (基因家族):一系列外显子相关联的基因,其成员是由一个祖先基因复制或趋 异产生。 Genetic code (遗传密码):DNA(或RNA)三联体与蛋白质中氨基酸的对应关系。 Genetic marker (遗传标记):见标记。 Genomic (chromosomal) DNA clone (基因组或染色体DNA克隆):由克隆载体携带的基因 组序列。 Genotype (基因型):一个生物的遗传组成。 Golgi apparatus (高尔基体):在内质网附近由膜堆积而成结构,在蛋白质糖基化和存储转运 中起重要作用。 G protein (G蛋白质):位于质膜上的鸟嘌呤核苷酸结合蛋白质三聚体。当三聚体结合 GDP 时,它保持完整并且没有活性。当结合在a亚基上的 GDP 被 GTP 代替时,a 亚基与 bg二聚体脱离。分离得亚基(a或者bg)随后激活或者抑制一个靶蛋白质。 Gratuitous (安慰诱导物):与转录中实际诱导物相似,但不是该诱导酶的底物。 GT-AC rule (GT-AG 规则):指在核基因内含子开始和结束出现的两个固定的脱氧核苷酸。 Gyrase (螺旋酶):大肠杆菌中II型拓扑异构酶,能够向 DNA 中引入负超螺旋。 H Hairpin (发夹):指在单链RNA 或DNA 相邻的互补区域形成的双螺旋结构。 Haploid (单倍体):单倍染色体组中仅含有每个常染色体的一个拷贝和一个性染色体。单倍 体数n是二倍体生物配子的特征常数。 Haplotype (单元型):一些染色体特定区域内等位基因的特殊组合, 其缩小模型就是基因型。 本来是用来描述MHC 等位基因组合的,现在用来描述 RELPs 之间的特殊组合。 Hapten (半抗原):一些小分子物质,与蛋白质结合后能像抗原一样引发免疫应答。 Histone acetyltransferase ,HAT(组蛋白乙酰化酶):向组蛋白添加乙酰基团来修饰它的酶, 一些转录辅激活物有 HAT 活性。 Histone deacetyltransferase , HDAC(组蛋白去乙酰化酶): 从组蛋白质上除去乙酰基团的酶, 通常与转录阻遏子相联系。 Helper virus (辅助病毒):提供缺陷型病毒缺乏的功能,使后者能完成侵染循环。 Hemizygote (半合体):失去某个基因拷贝(如,由于一条染色体的丢失),从而只有一个拷 贝的单倍体个体。 Heterochromatin (异染色质):永久处于高聚集状态的基因组区域,它不转录而且复制较晚。 可能是组成型的或者兼性的。 Heteroduplex (hybrid) DNA (异源双链DNA):由不同亲本双链分子中的互补单链产生碱基 配对的双链DNA,在遗传重组中产生。 Heterogametic sex (异配性别):具有2A+XY 的双倍染色体组成。 Heterogeneous nuclear (hn) RNA (不均一核RNA):由RNA聚合酶 II产生的核基因转录无。 它有宽广的范围和低的稳定性。 Heterokaryon (异核体):在一个共同的细胞质中包含两个核的细胞,由体细胞融合产生。 Heteromultimeric proteins (异源多聚体蛋白质):有不同的亚基(不同基因编码)组成的蛋白 质。 Heterozygote (杂合体):在某个位点上有不同等位基因的个体。 Highly repetitive DNA (高度重复DNA):即卫星DNA,是复性中的第一成分。 Histones (组蛋白):真核生物中保守的DNA 结合蛋白质,是染色质的基本亚单位。 Homeobox (同源框):黑腹果蝇同源基因编码区域的一部分保守序列。在两栖和哺乳动物早 期胚胎发育中也已发现。 Homeotic genes (同源异形基因):由将身体的一部分转化成另一部分的突变所定义,例如, 昆虫的腿可以代替触角。 Homogametic sex (同配性别):单倍染色体组成为 2A+XY。 Homologs (同源染色体):携带同样的遗传位点的染色体,二倍体细胞含有每个同源染色体 的两个拷贝,分别来自父母本。 Homomultimeric protein (同源多聚体蛋白质):由相同亚基组成的蛋白质。 Homozygote (纯合体):同源染色体相应位点有相同等位基因的个体。 Hotspot (热点):突变或者重组频率显著增加的位点。 Housekeeping (constitutive) genes (持家或组成型基因):是那些(理论上)在所有细胞中都表 达的基因,因为其功能对任何细胞型都是必要的。 HOX genes (HOX 基因):包括同源框的哺乳动物基因簇,单独成员与黑腹果蝇中 ANT-C 和-BX-C 座位相近。 Hybrid-arrested translation (杂交捕获翻译):确定与 mRNA相应的 cDNA的一种技术,它依 赖其与RNA 配对的能力阻止翻译。 Hybrid DNA (杂交DNA):见异源双链 DNA。 Hybrid dysgenesis (杂种败育):指黑腹果蝇某些株系杂交后代不育(尽管它们在表型上是正 常的)的现象。 Hybridization (杂交):使互补DNA、RNA 配对形成杂合 RNA 或 DNA。 Hybridoma (杂交瘤):通过骨髓瘤细胞与淋巴细胞融合产生的细胞株,它们能无限制的产 生两种亲本的免疫球蛋白。 Hydrolytic reaction (水解反应):伴随着水分子解离而使共价键打开的反应。 Hydropathy plot (亲水性分析):蛋白质某区域疏水度的检测,也是其位于膜表面的可能程 度的检测。 Hydrophilic groups (亲水基团):与水结合从而蛋白质的亲水区域或脂质双分子层处于水环 境中。 Hydrophobic groups (疏水基团):排斥水分子,因此互相作用产生非水性环境。 Hyperchromicity (增色效应):当DNA 变性时吸光度增加的现象。 Hypervariable region (高度可变区):当不同抗体比较时表现出最大变化的区域。 I Ideogram (理数图):代表染色体 G 带图表。 Idling reaction (空转反应):当空载tRNA进入A位点时,核糖体产生 pppGpp 和 ppGpp, 诱发应急型反应。 Immortalization (永生或无限增值化):指真核细胞系获得在培养基中进行无数次分裂的能 力。 Immunity in phages (噬菌体免疫):由于原噬菌体基因组合成的噬菌体抑制物,而阻止同一 类型噬菌体侵染细胞的能力。 Immunity in plasmids (质粒免疫):一个质粒阻止其它同类型质粒在细胞中存活的能力。主 要是阻碍复制能力。 Immunity in transposons (转座子免疫):指某些转座子阻止其它同类型转座子向相同 DNA 分子中转移的能力。有多种机制。 Imprinting (印记):指一个基因通过精子或者卵子发生的改变,使在早期胚胎中父本和母本 等位基因有不同的性质。可能是由于DNA 甲基化产生的。 In situ hybridization (原位杂交):变性压在显微镜切片中的细胞 DNA,当加入放射性标记 的单链RNA 时可以进行反应,杂交接过可通过自动放射性自显影检测。 In vitro complementation assay (体外互补分析):确定野生型细胞成分的方法,可以赋予从 突变细胞获得的提取物活性。可用于分析确定由突变造成失活的细胞成分。 Incompatibility (不相容性): 某些细菌质粒不能共存在一个细胞中的能力, 由质粒免疫造成。 Indirect end-labeling (间接末端标记):检查DNA组织的一种技术,是通过在特殊位点上加 入一个切口,分离出含有与切口一端相邻序列的所有片段,可揭示从切口到DNA上 另一断点的距离。 Induced mutation (诱发突变):加入诱变剂造成的突变。 Inducer (诱导物):通过与调控蛋白结合激活基因转录的小分子。 Induction (诱导):指细菌或者酵母只有当底物存在时才会合成某种酶的能力。当用在基因 表达中,指诱导物与调控蛋白结合造成的转录转换。 Induction of prophage (原噬菌体诱导):由于溶源阻碍物的破坏,噬菌体从宿主基因组切除 进入溶源(非感染的)循环。 Initiation factors (起始因子,原核中IF,真核中 eIF):在蛋白质合成起始阶段特异性作用于 核糖体小亚基的蛋白质。 Insertion sequence (插入序列,IS):仅携带其转座所需基因的小型细菌转座子。 Insertions (插入):DNA 中碱基对的增加。 Integral membrane protein (嵌膜蛋白质):通过非共价键插入膜中的蛋白质,它通过 25个不 带电的或者疏水性氨基酸与膜保持联系。 Integration (整合):病毒或者其它DNA序列插入到宿主基因组中,并且与宿主DNA序列 两端共价结合。 Interallelic complementation (等位基因间互补):指异源多具体蛋白质由两个不同突变等位 基因编码的亚单位间作用引起的性质改变。混合型蛋白质可能比一种类型亚单位构 成的蛋白质活性强或者弱。 Interbands (间带):多线染色体中位于带之间相对较分散的区域。 Intercistronic region (顺反子间区):一个基因终止密码和另一个基因起始密码间的距离。 Intermediate component (中间组分):复性反应中处于快成分(卫星 DNA)和慢成分(非重复 DNA)之间的组分,由中度重复DNA 组成。 Interphase (间期):减数细胞分裂间的时期,分为 G1、S 和 G2 期。 Intervening sequence (间插序列):即内含子。 Intron (内含子):一段DNA片段,它转录但通过将其两端的序列(外显子)剪接在一起而被 移出转录本。 Inversion (倒位):是染色体的一种改变,一个片段相对两端区域旋转了 180°,然后又重新 插入。 Inverted repeats (反向重复):同一个序列的两个拷贝在一个分子中以相反的方向重复,相邻 重复组成回文序列。 Inverted terminal repeats (末端反向重复):在一些转座子末端以相反方向出现的、小的相关 或同样序列。 IS:是插入序列的缩写,只携带其转座必须遗传功能的小型细菌转座子。 Isoaccepting tRNAs (同工tRNA):携带相同的氨基酸的 tRNA。 Isotype (同型):一组密切相关的免疫球蛋白链。 K Karyotye (核型):一个细胞或种属中整个染色体物质。 Kilobase, kb (千碱基):1000个DNA 碱基对或 1000 个 RNA 碱基的缩写。 Kinase (激酶):磷酸化(加上一个磷酸基团) 底物的酶,蛋白质激酶的底物是其它蛋白质的 氨基酸,分为酪氨酸特异性及丝氨酸/苏氨酸特异性激酶两类。 Kinetic complexity (动力学复杂度):DNA 复性动力学检测的 DNA 成分的复杂度。 Kinetochore (动粒纤维):染色体的结构特点,减数分裂纺锤体的微管通过它与染色体相连。 L Lagging strand of DNA (DNA后随链):总体上沿着 3¢到 5¢方向延伸,但以小片段形式(5¢-3¢) 不连续合成,最后共价连接起来。 Lampbrush chromosomes (灯刷染色体):在两栖卵母细胞内发现的减数分裂大染色体。 Lariat (套索):RNA 剪接过程中的中间结构,其中有由 5¢-2¢键形成的带尾巴的环形结构。 Late period of phage development (噬菌体发育晚期):噬菌体 DNA 复制后的部分感染期。 Late-replication materials (延迟复制物):在S 期前不复制,通常由异染色体组成。 Leader (前导区):在mRNA 5¢端起始密码子之前的非翻译区。 Leader sequence of a protein (蛋白质前导序列):短的 N 端序列,负责进出膜。 Leading strand (前导链):以5¢-3¢方向连续合成的DNA 链。 Leaky mutations (渗漏突变):允许残留水平的基因表达。 Left splicing junction (左剪接点):一个外显子右末端和内含子左末端的分界点。 Lethal locus (致死座位):可以获得致死突变(通常是该基因被删除)的任何基因。 Library (文库):代表整个基因组的一系列克隆片段集合。 Ligation (连接反应):在双螺旋DNA单链上,连接缺口处两个相邻碱基形成磷酸二脂键(也 可用于连接RNA 平末端连接)。 LINES: 哺乳动物基因组中长散布序列,由RNA 聚合酶 II转录本反转座产生。 Linkage (连锁):指由于位于同一染色体上的基因具有一起遗传的倾向,用位点间的重组率 来表征。 Linkage disequilibrium (连锁不平衡):指某些遗传标记的重组发生在物种中的频率高于或低 于从其距离位点推测的值。表明一组标记是协同遗传的,可能是由于某个区域的退 化重组或始创效应,当一个标记引入时无足够时间达到平衡。 Linkage group (连锁群):包括通过连锁关系联系起来的(直接或者间接的)所有位点,等同 于染色体。 Linker DNA (连接DNA):核小体中除146bp 核心 DNA 外的所有 DNA。 Linker fragment (连接片段):指包含几个限制性酶靶位点的合成双链寡核苷酸。在重组DNA 的重建中可加在准备用其它酶切割的DNA 片段末端。 Linker scanner mutations (接头分区突变):体外在限制性片段加上位点,使两个 DNA分子 发生重组产生,结果在重组的位点加上连接序列。 Linking number (连环数):闭合DNA 双螺旋一条链绕过另一条链的次数。 Linking number paradox (连接数矛盾):指核小体DNA中-2超螺旋的存在和当组蛋白质移 开时测量的-1超螺旋间不一致。 Lipids (脂质):具有极性头,包括磷酸盐(磷脂)、固醇(如胆固醇)或糖类(糖脂)与由脂肪酸 组成的疏水性尾结合。 Lipid bilayer (脂质双分子层):脂质聚集形成的形式,疏水性的脂肪酸在外边而极性头朝向 中间。 Liquid (solution) hybridization (液相杂交):在溶液中进行互补核酸链的反应。 Locus (基因座):染色体上某个具有特殊作用的基因所处的位置。它可能被等位基因中一个 所占据。 LOD score (LOD分数):遗传连锁的一种计算,定义为连锁基因的可能性数据与非连锁基 因的可能性数据之比率的 Log10。通常认定基因连锁时 LOD 值应为 3.0,即 1000:1 的比率(必须同任何两各位点不连锁的可能性 50:1相比较)。 Long-period interspersion (长周期散布):一种基因组类型,其上一长段重复序列与非重复 DNA 交替出现。 Loop (环):RNA(或者单链DNA)发夹结构末端的单链区域,与双链DNA中反向重复之间 的区域一致。 LTR:是长末端重复的缩写,在逆转录病毒 DNA 两端的正向重复序列。 Lumen (腔):由膜围绕的器官,通常指内质网或者线粒体的内部。 Luxury genes (奢侈基因):在特别细胞类型中大量(通常)表达并编码特殊功能产物的基因。 Lysogen (溶原): 指在噬菌体感染后期, 当它们冲破细胞来释放感染噬菌体子代时细胞死亡。 也可用于真核细胞,例如,感染细胞被免疫系统攻击时。 Lysogenic immunity(溶原免疫):前噬菌体阻止另一相同噬菌基因组在细胞中存活的能力。 Lysogenic repressor (溶原阻遏蛋白):阻止原噬菌体再次进入溶原循环的蛋白质。 Lysogeny (溶原性):指噬菌体能够以稳定的细菌基因组原噬菌体形式在细菌中存活的能力。 Lysosomes (溶酶体):由膜包围的小体,在真核细胞中包括水解酶。 Lytic i
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