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新抗生素和糖尿病治疗药物开发的靶标——葡糖胺-6-磷酸合酶

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新抗生素和糖尿病治疗药物开发的靶标——葡糖胺-6-磷酸合酶 ·472· 文章编号:1000—1336(2008)04-0472-05 《生命的化学》2008年28卷4期 CHEMIsTRYoFuFE-2008,28(4).!曼!旦业皇!堕型璺翌垡竺型型旦皇 新抗生素和糖尿病治疗药物开发的靶标——葡糖胺-6-磷酸合酶 费良润,吴宗辉。 王洪海3 谢建平1·, (1西南大学生命科学学院现代生物医药研究所,重庆400715;2西南大学校医院,重庆400715;3复旦大学生命科学学院,遗传学研究所,遗传工 程国家重点实验室,上海200433) 摘要:葡糖胺一6一磷酸合酶催化氨基...
新抗生素和糖尿病治疗药物开发的靶标——葡糖胺-6-磷酸合酶
·472· 文章编号:1000—1336(2008)04-0472-05 《生命的化学》2008年28卷4期 CHEMIsTRYoFuFE-2008,28(4).!曼!旦业皇!堕型璺翌垡竺型型旦皇 新抗生素和糖尿病治疗药物开发的靶标——葡糖胺-6-磷酸合酶 费良润,吴宗辉。 王洪海3 谢建平1·, (1西南大学生命科学学院现代生物医药研究所,重庆400715;2西南大学校医院,重庆400715;3复旦大学生命科学学院,遗传学研究所,遗传工 程国家重点实验室,上海200433) 摘要:葡糖胺一6一磷酸合酶催化氨基己糖代谢和细胞壁合成的第一步反应,即利用D.果糖.6一磷酸和L一谷氨酰胺生 成衙糖胺一6一磷酸和谷氨酸,该途径的终产物N一乙酰葡糖胺是细菌和真菌细胞壁构建的基本成分。真菌、昆虫和 甲壳类动物的几丁质,哺乳动物的糖蛋白和黏多糖都是通过N.乙酰葡塘胺最终合成的。葡塘胺一6一磷酸合酶是一 个胰岛素调节酶,介导II型糖尿病的胰岛素抵抗。因此葡糖胺一6.磷酸合酶被认为是开发抗细菌、抗真菌、治疗II 型糖尿病及其相关并发症等疾病的药物的分子靶标。 关键词:葡糖胺.6.磷酸合酶;抗生素;分子靶标 中图分类号:Q936 1.葡糖胺一6一磷酸合酶的基本概述 葡糖胺一6一磷酸合酶(glucosamine一6-phosphate synthase,GImS;EC2.6.1.16)在细菌、真菌、哺乳动物 中分别称GlmS、GFA、GFAT[11,本文中统一使用GlmS。 至少有40种原核生物、7种真核生物和1种滤过性病 毒序列编码该酶。GlmS是一种相对较大的蛋白质,研 究发现,酵母的肽链最长,有716个氨基酸残基(aa); Methanobacterium的最短,有589个aa[¨。从GenBank 数据库中获得不同种类生物GImS蛋白质序列,进行 比对获得系统进化树,发现各种生物GlmS具有较高 的同源性,与已有研究一致啦'3】,明该酶在原核生 物、真菌、植物、昆虫和高等生物中高度保守。天 然的GlmS结构和分子大小存在差别:原核生物中由 两个相同弧基形成二聚体,分子量为130-150kDa; 真核生物和哺乳动物中都是四聚体结构,分子量分 别为320—340kDa和340-360kDa。GImS是偏酸性蛋 白质,其pH值介于4.1-5.0t¨。大肠杆菌(Escherichia 收稿日期:2008—04·12 作者简介:费良润(1982一),女,硕士生, E-mail: feilr@swu.edu.eta;吴宗辉(1967-),男,剐主任医师,E—mail: zhwu@sina.com.cn;王洪海(1945.),男,教授,博士生导 师,E-mail:hhwang@fudan.edu.cn;谢建平(197l一),男,博 士,教授,博士生导师,联系作者,E—mail:georgex@swu.edu. Cn coli)的GlmS由608个aa组成,由约67kDa单体组成 的130kDa同型二聚体。白念珠菌(Candidaalbicans) 的GlmS含712个aa,由约79kDa单体形成的320kDa 的同型四聚体【4—1。节肢动物硬蜱长角血蜱 (Haemaphysalislongicornis)的GlmS有696个aa,分子 量为78.4kDat扪。人有两个不同GlmS(GFATl和 GFAT2),其中GFATl包含681个aa,在Ecoli中表 达产生分子量约306kDa的同型四聚体蛋白质【们。 GlmS催化D一果糖一6.磷酸(F-6一P)和厶谷氨酰胺 (Gin)生成葡糖胺一6一磷酸和谷氨酸,是氨基己糖代谢 和细胞壁合成反应的第一步反应,是不可逆限速反 应。该途径终产物N-乙酰.D.葡糖胺(GIcNAc)是细菌 和真菌细胞壁构建的基本成分。真菌、昆虫和甲壳 类动物的几丁质,哺乳动物的糖蛋白和粘多糖都是 通过GIcNAc最终合成的。氨基糖作为细胞壁的前 体,对细胞生长非常重要。在没有GlcN和GIcNAc下 培养GlmS缺失突变株,会快速失去细胞生长能力并 裂解。该酶对细菌和真菌形态的维持也起着非常重 要的作用,过表达黑曲霉GlmS可增强胞壁耐受外界 压力的能力。在哺乳动物中,其生理重要性就更复 杂,但该酶被抑制不会致死整个生物,其活性因组 织而异(I'3’7J。 2.葡糖胺一6一磷酸合酶的结构特征 GImS属于酰胺转移酶家族成员,其肽链折叠成 万方数据 ●生化与医学 《生命的化学》2008年28卷4期 CHEMISTRYOFLIFE2008,28(4) 两个不同功能结构域(图1)。研究最为清楚的是E. coli的GImS,其N一端由aa1-239组成约30kDa(GAH), C一端由aa249-608组成约40kDa异构酶区域(ISOM)。 N一端半胱氨酸位于分子表面D-链浅缝的开端,参与 底物结合和催化的其他aa位于连接p链的环中。其 中Q环(73~80aa)尤为重要,它在结合Gin后盖住活 性位点使其与溶剂隔开【8】。真核生物C.albicans的 两个结构域分别位子aa1-345、346-712,Q环由aa98- 103组成,两ISOM相互作用负责GlmS同型四聚体结 构的形成,GAH不参与蛋白寡聚体的形成【9l。虽原 核生物和真核生物GlmS结构、拓扑学活性位点和催 化机制都不一样,但不同来源GImS初级结构中起关 键作用的位点和aa序列是一样的,各GImSaa序列 进行比对(图2)n1,可以看出,它们存在一些非常保 守的序列和位点。 GImSGAH催化Gin水解成谷氨酸和氨,ISOM利 用氨将F-6.P转化成GlcN.6.P。这个反应被认为先生 成果糖胺一6一磷酸然后再异构化形成GIcN一6一P。GImS 在氨基转移时不接受外源氨为氮源,它需要Gin的 图1GImS单体的立体图181 ·473· 氨并与果糖胺的C一2紧密结合。GlmS不能利用外源 的氨作为氮受体,这可能与它天然的四级结构有关m—o/。 GlmS两个功能结构域,通过胰凝乳蛋白酶水解 分开或者单独表达时,仍然保持单独底物结合能力 及酶催化活性。通过X(射)线衍射分析E.coliGImS 两个结构域与不同物质形成的复合体并研究其三维 结构,包括GAH.谷氨酸复合体(PDB代码1GDO)、 GAH一丫-谷氨酰基氧肟酸盐复合体(PDB代码1GMS) ISOM—GlcN-6-P复合体(PDB代码1MOQ),ISOM一2-氨 基·2一葡萄糖醇.6一磷酸复合体(PDB代码1MOS)ISOM- 葡萄糖一6·磷酸复合体(PDB代码IMOR)GImS.葡萄 糖一6一磷酸复合体(PDB代码1JXA),GImS.葡萄糖一6. 磷酸一5-氧一L正亮氨酸复合体(PDB代码2J6H),GlmS— F-6一P复合体(PDB代码)。这些复合体结构表明Gin的 水解机制是N.端亲和型,且其水解依赖于F.6.P的 异构化,通过烯醇/烯二醇中间体完成,其作用类 似于磷酸丙糖异构酶[8,11-13】。 GImSISOM的活性位点在进化时通过复制随后 二聚体化形成的。通过His504催化环化-开环步骤及 Glu懈将底物Cl的质子转移到C2上,F一6一P可能与GlmS 的Lys603形成希夫碱。高度保守的C-端可能在底物 结合、催化及GAH通讯中起着关键作用,相应的序 列模式DXPXXLAK[SC]VT可能是GImS的指纹[11J。E coliGImS有一系列对其催化作用重要的保守残基或 序础C1,Y25GYD29,R73wATHG78,H黼,H97NG99,D123, C300,S347QSGET352,E481GALKLKE4髂,K503HG505和 P598RNLAK603,这些残基恰好负责识别、结合底物以 及催化Gln水解成氨,形成酶催化活性位点,从丽 完成整个催化反应[8,10,12,131。 真核生物的GlmS在C-端和N.端区域之间含额 外的结构域。例如CalbicansGImSaa218~283,该 区域没有特异的功能,但它的缺失会强烈破坏功能 结构域问的通讯和信号传输[9,12,131。 最近的研究表明反馈抑制剂UDP—GlcNAc能结 合ISOM或Ser208残基,影响GAH的氨基水解酶活性, 进而影响全酶的活性。Calbicans的疏水残基Trp97 是连接两个功能结构域作用通道的分子门,aa702~ 709对该通道也起着很重要的作用,它能减少分子门 的大小,当aa7ll发生突变时该通道将会被阻断一1。 利用具多底物抑制特性的化合物AP3(1),AP4 (2),AP5(3),AP6(4),AP7(5)和CGSl9755(6)为探针, 万方数据 ·474· 《生命的化学》2008年28卷4期 CHEMISTRYOFLIFE2008,28(4) 图2GlmS氨基酸序列多重比对Il】 测定CalbicansGImS磷酸结合位点和氨基酸结合位 点的距离、GmlS两活性位点的二维空间图谱(图3)。 氨基酸的0【一C与膦酸盐的0c—P距离的关系,表明链长 越短,其化合物的抑制活性越好。同时发现Gin结 合位点可以耐受大量的基团,哌啶环的疏水性增强 该位点的结合力,也证明r两个位点的距离约为3A 表明将来多底物抑制剂的合成也可通过形成希夫碱 与赖氨酸残基结合帮助测定异构酶活性位点中Lys 与Gln活性位点的距引11】。 3.葡糖胺.6一磷酸合酶的稳定性 GlmS是普遍存在的酶,但它很不稳定,因此 图3葡糖胺-6一合酶活性位点的二维图【¨I 万方数据 ●生化与医学 《生命的化学》2008年28卷4期 CHEMISTRYOFLIFE2008,28(4) GlmS一般要通过过表达并采用合适的方法才能得 到。纯化真核生物的GlmS是一件很困难的事情,因 为在真核细胞胞质蛋白库中该酶仅占很小一部分, 因此过表达蛋白可能是有效纯化该酶的方法15]。在 Ecoli中构建Calbicans的GlmS基因使其产量比野 生型提高50~100倍。三种带His6标签的Calbicans 的GImS,其酰氨水解酶活性与野生型的差不多,但 仅有18%的己糖磷酸异构酶活性和约1.5%的合成活 性【4j】。人的GlmS在Ecoli中表达带His6标签的蛋白 质,其活性比以往报道的人肝脏中该酶活性高6000 倍【6】。嗜热菌(Thermusthermophilus)的GImS(GImSm) 的二聚体在70oC表现出最佳的活性,在80oC时半 寿期仍有90分钟。在氯化胍和尿素中解离GImS出,与 其单体一样没有活性【141。 4.葡糖胺一6.磷酸合酶作为分子靶标筛选抗生素 真菌感染是现代医学中的难题,然而只有很少 一些抗真菌药物应用于临床。因此不仅要在现有药 物基础上改良药物,也迫切需要寻找新的药靶。不 幸的是,真菌和人类都是真核生物,所以要获得真 菌的选择性毒性不是个简单的事情。真菌和哺乳动 物最重要的区别在于真菌存在细胞壁,因此,参与 形成细胞壁途径中的酶成为潜在的抗真菌药物的药 靶【151。 GImS很早就被鉴定为一个新的抗菌试剂的靶 标。其存在于所有的细胞中,葡糖胺-6.磷酸是该酶 的产物,对细菌、真菌和动物,包括人在内都是必 不可少的。有研究表明在病原体中短期失活GImS对 真菌细胞都是致死的(它可以诱发形态改变、胶合和 裂解)。由于哺乳动物的寿命比真菌长,因此短时间 损耗氨基糖库不会致死,因为GImS有较长半寿期, 并且能快速表达编码该酶的基因【151。由图2可以看 出,各种生物该酶的活性序列和位点都很保守,可 用来设计特异抑制剂,开发潜在抗细菌,抗真菌药 物并获得选择性毒性的药物。 随着一线抗结核药物的治疗的效果下降, 抗药性广泛蔓延,迫切需要开发新的治疗结核病的 药物。乐军等【161通过研究结核分枝杆菌异烟肼耐药 菌株与敏感菌株蛋白质表达的差异,发现异烟肼耐 药菌株中细胞壁蛋白GImS表达量提高,由此推测 GlmS与耐药性相关。因此可将GImS作为开发抗生素 的一个分子靶标。 ·475· 哺乳动物细胞中,GlmS控制着葡萄糖到己糖胺 途径的流量,催化糖蛋白和糖脂生成必须的底物, 在葡萄糖平衡调节中起着重要的作用。当葡萄糖代 谢提高时,通过己糖途径导致胰岛素抵抗,削弱胰 岛素的分泌,引发糖尿病性肾病变。在转基因动物 骨骼肌中过表达GlmS会产生胰岛素抵抗,使肝内合 成过多脂肪酸,B细胞分泌过多胰岛素导致血(内)胰 岛素过多症,长期这样就可能导致肥胖、高脂血症、 D细胞衰竭、型糖尿病和高血糖症。因此GlmS被认 为是治疗II型糖尿病及相关并发症很有吸引力的分 子靶标[1,17,181。 到目前为止,已报道有GlmS抑制剂,包括天然 的和合成的,都表现出抗细菌和抗真菌活性,大多 数是活性位点定向烷基化的谷氨酰胺类似物。已经 有特异的针对GlmS的抗真菌物质,如Ⅳ一3一(4- methoxyfumaroyl)-(S)一2,3-diaminopropanoicacid(FMDP), 2-amino-2一deoxy-D-glucitol一6-phosphate(ADGP).N7- trans—epoxy—succinamoyl-I,2-3一diaminopropanoicacid (EADP)及其类似物【19,20]。Floquet等皿11通过模拟筛选, 从50,000个化合物中筛选到14个具有抑制细菌GlcN. 6-P合酶活性的物质。 提坦菌素是第一个被认可的GlmS的选择性抑制 剂,但研究最多的是具广谱抗菌活性的活性位点定 向失活剂FMDP和EADP,这两个抑制剂都共价结合 GImS,失活该酶N一端Gln结合位点。FMDP在体外 对哺乳动物细胞和老鼠没有毒性,但对实验的念珠 菌病有效[14,21】。 Zthermophilus的GlmS血、Ecoli的GlmS与特异 单克隆抗体Gin结合位点线性抗原决定簇(RWATHG) 进行抗原交叉反应,发现Ecoli的GImS与mAbs没 有交叉反应。E。coliGImS有效的谷氨酰胺位点定向 亲合标签6-diazo-5一oxo-L-norleucin和methoxyfumaroyl— L一2,3-diaminopropionicacid的抑制常数在测试GImS血 时减少2—3个数量级,而F一6一P位点有效的竞争性 抑制荆2-amino-2一deoxycarglucitol一6-P的抑制作用不受 影响【14】。 GlmS在二聚体状态下才具有活性,导致GlmSm 结构和功能受限,构象挠性减少。DON和FMDP是 Zthermophilus和EcoliGlmS时间依赖性的抑制剂, GImS出的抑制常数随时问急剧增大(160—400倍),失 活率减少(2—20倍)【14I。 万方数据 ·476· CH《生EM命I的ST化RY学O》F200LIF8E年220808卷428期(4)!曼堕虫皇竺堕型璺Qs!堂皇型型旦皇. 一 =_===:===二2=====二=二 5.利用葡糖胺.6.磷酸合酶提高葡糖胺生产 由于葡糖胺是粘多糖的前体,可用于修复维持 软骨和关节的健康,临床上被用于治疗关节炎,也 逐渐用于补充膳食。而现在大多数是通过提取和酸 水解甲壳类废弃物而得到,且产量很有限,并带有 潜在的甲壳类动物蛋白污染。由于真核生物GlmS严 重受其代谢产物GlcN一6一P的抑制,同时也受到UDP. GIcNAc的抑制,然而细菌的GlmS对UDP.GIcNAc的 抑制不敏感,因此通过代谢工程的途径在细菌中过 表达细菌GlmS,使GIcN一6一P和UDP—GlcNAc对其的抑 制作用降低,同时失活分解代谢的基因,可提高葡 糖胺产量,解决现在的葡糖胺生产中存在的问题 【221。 制, 分, 综上所述,进一步研究GlmS及其相应作用机 抑制剂和代谢途径,不仅仅是基础科学的一部 而且可以推动医学和工业的前进。 参考文献 【1】MilewskiS.BiochimBiophysActa,2002,1597:173—192 f2】XiaoHHeta1.Int-,Parasitol,2007,37:383·392 【3】RamAFJeta1.Microbiol,2004,150:3315·3326 【4】SachadynPeta1.ProteinExprPurif,2000,19:343—349 【5】OlchowyJeta1.ProteinExprPurif,2006,46:309·315 【6】RichezCeta1.ProteinExprPurif,2007,54:45·53 【7】VoglerAPeta1.JBacteriol,1989,17l(12):6586—6592 181TeplyakovAeta1.JMolBi01.2001,313:1093-1102 【9】OlchowyJeta1.JBiochem,2007,404:12l—130 【10】ChitturSVeta1.BioorgMedChemLett,2002,12:2639-2642 【ll】TeplyakovAeta1.Structure,1998,6(8):1047·1055 【12】IsupovMNeta1.Structure,1996,4(7):801·810 【l3】TeplyakovAeta1.ProteinSci,1999,8:596—602 【14】Badet-DenisotMAeta1.ArchBiochemBiophys,1997,337 n):129.136 【15】WojciechowskiMeta1.ActaBiochimPol,2005,52(3):647—653 【16】乐军等.中华微生物学和免疫学杂志,2004,24(4):258-262 【l7】McClainDA.JDiabetesComplications,2002,16:72—80 f1S】ElbeinSCF,a1.MolGenetMetab,2004,82:321—328 【l9】MelcerAeta1.BioorgMedChemLett,2007,17:6602—6606 【20】Z96dkaDeta1.BioorgMedChem,2001,9:931·938 【21】FloquetNeta1.BioorgMedChemLen,2007,17:1966-1970 1221DengMDeta1.Biochimie,2006,88:419-429 Anovelantibioticanddiabetesdrugtarget_glucosamine-6·phosphatesynthase Liang-RunFEllzong·HuiWU2Hong-HaiWANG2Jian·PingXIEl3 ('ImtimteofModemBiopharmacenticals,SchoolofLifeSciences,SouthwestUniversity,Chongqin9400715,alina:2SOllthWegtUniversityHospital,Chongqing 400715,China;3StateKeyIab0哟loqofGeneticEngineering,InstituteofGenetics,SchoolofLifeSciences,FudanUniversity,Shaaghai200433,China) AbstractGlucosamine一6-phosphatesynthasecatalysesthefollowingreaction:L—glutamine+D-fruetose一6一phosphate一口 glucosamine·6一phosphate+L-glutamate,thereactioninvolvingammoniatransferandsugarphosphateisomerization.This irreversiblereactionisthefirststepinhexosaminebiosynthesis,leadingtotheformationofuridine5'-diphospho—N—acetyl—D- glucosamine,nllactivatedprecursorofnumerousaminosugar—containingbiomacromolecules,includingchitinandmannoprotein infungi,peptidoglycanandlipopolysaccharidesinbacteria,andglycoproteinandinmammals.Thissynthaseisanimportant pointofmetaboliccontrolofaminosugarbiosynthesis,andthemammalianenzymeissupposedtobeinflictedinphenomenon ofhexosamine—inducedinsulinresistanceindiabetes.Soglucosamine·6-phosphatesynthasehasbeenproposedasanewmoleca— lartargetforantibacterial,antifungalandtreatingdiabetes. Keywordsglucosamine—-6·,phosphatesynthase;antibiotic;moleculartarget 万方数据 新抗生素和糖尿病治疗药物开发的靶标——葡糖胺-6-磷酸合 酶 作者: 费良润, 吴宗辉, 王洪海, 谢建平 作者单位: 费良润(西南大学生命科学学院现代生物医药研究所,重庆,400715), 吴宗辉(西南大学校医 院,重庆,400715), 王洪海(复旦大学生命科学学院,遗传学研究所,遗传工程国家重点实验 室,上海,200433), 谢建平(西南大学生命科学学院现代生物医药研究所,重庆,400715;复旦 大学生命科学学院,遗传学研究所,遗传工程国家重点实验室,上海,200433) 刊名: 生命的化学 英文刊名: CHEMISTRY OF LIFE 年,卷(期): 2008,28(4) 参考文献(22条) 1.Olchowy J 查看详情 2007 2.Teplyakov A Channeling of ammonia in glucosamine-6-phosphate synthase[外文期刊] 2001(5) 3.Vogler A P 查看详情 1989(12) 4.Richez C 查看详情 2007 5.Olchowy J Construction, purification, and functional characterization of His-tagged Candida albicans glucosamine-6-phosphate synthase expressed in Escherichia coli[外文期刊] 2006(2) 6.Sachadyn P Purification to homogeneity of Candida albicans glucosamine-6-phosphate synthase overexpressed in Escherichia coli[外文期刊] 2000(3) 7.Ram A F J 查看详情 2004 8.Xiao H H 查看详情 2007 9.Deng M D Directed evolution and characterization of Escherichia coli glucosamine synthase[外文期刊 ] 2006(5) 10.Floquet N Discovering new inhibitors of bacterial glucosamine-6P synthase (GlmS) by docking simulations.[外文期刊] 2007(7) 11.Zg6dka D 查看详情 2001 12.Melter A 查看详情 2007 13.Elbein S C Molecular screening of the human glutamine-fructose-6-phosphate amidotransferase 1 (GFPT1) gene and association studies with diabetes and diabetic nephropathy.[外文期刊] 2004(4) 14.McClain D A Hexosamines as mediators of nutrient sensing and regulation in diabetes.[外文期刊] 2002(1) 15.乐军 异烟肼耐药和敏感结核分枝杆菌的比较蛋白质组学研究[期刊论文]-中华微生物学和免疫学杂志 2004(04) 16.Wojciechowski M 查看详情[外文期刊] 2005(03) 17.Badet-Denisot M A 查看详情 1997(01) 18.Teplyakov A The mechanism of sugar phosphate isomerization by glucosamine 6-phosphate synthase. [外文期刊] 1999(3) 19.Isupov M N 查看详情 1996(07) 20.Teplyakov A 查看详情 1998(08) 21.Chittur S V 查看详情 2002 22.Milewski S Glucosamine-6-phosphate synthase-the multi-facets enzyme.[外文期刊] 2002(2) 本文链接:http://d.g.wanfangdata.com.cn/Periodical_smdhx200804026.aspx
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