HIV-1病毒分组

HIV-1 对部分病毒基因尤其是包膜蛋白区进行PCR扩增及序列测定，特别有助于快速进行HIV-I和HIV-2毒株间差异的比较 HIV-1病毒分组 HIV-1 对部分病毒基因尤其是包膜蛋白区进行PCR扩增及序列测定，特别有助于快速进行HIV-I和HIV-2毒株间差异的比较。通过氨基酸分析方法发现不同毒株包膜的显著多样性的同时也发现了一定的相似性。目前，依据病毒全基因序列的测序结果，HIV-1可分为三个组，分别为M组(主要组)、O组(外围组)和 N(非M非O组)，已经确定了HIV-2的8个组。M组内9个群(或亚型)已经被确定，分别被定名为A～D、F～H、J和K。一些亚型归属于O组，只有几个毒株属于N组。HIV-2病毒的亚型还没有确定(3755)HIVM组的不同亚型在包膜区的氨基酸组成上有至少2O％的差异，Gag区也至少有15％的差异。HIV-1不同组间的差异在EnV和]Gag区至少为2 5％，而亚型间的遗传距离则近似。当对毒株进行最终分型时，必须与组内其他型的病毒进行全基因组序列比较。 可用垂直系统进化树或无根放射状树来确立病毒不同组和亚型之间的相关性。HIV-1 M组A亚型主要发现于中非，B亚型在北美和欧洲，C亚型在南非和印度，D亚型在中非，F亚型包括了几个来自巴西的毒株和所有目前从罗马尼亚的儿童中得到的毒株。一些研究人员建议将A亚型再分为A1和A2亚型，F亚型分为F1(来源于巴西、罗马尼亚和芬兰)和F2(来源于喀麦隆和刚果民主共和国)亚型。来源于巴西的F亚型毒株在它们的V3环顶部具有GPGR．而来源于罗马尼亚的F亚型毒株却为GPGQ。M组内的其他亚型包括来自俄罗斯(G亚型)、非洲和中国台湾(H亚型)、扎伊尔(J亚型)和喀麦隆(K亚型)的毒株。 在多种亚型共流行时，重组病毒经常出现于感染人群中。在某些情况下，病毒重组株会成为流行病学上的一个重要株系。这些毒株被称为流行重组模式(CRF)，并根据所来源毒株的名称依次命名。当不知道亲本毒株时，用字母U来表示。含有四种或更多亚型的重组毒株称为复合型毒株(cpx)。当前，来源于HIV M组的16种CRF已被确认。 —摘自：艾滋病病毒与艾滋病的发病机制，中文翻译版第三版15-18页 链接地址：http://www.yidijiuyi.com/wenxue/wenxue17.html